RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485041.5

TUBA4B-202, Transcript of tubulin alpha 4b, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TUBA4B, Length 1,131 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA4B-202ENST00000485041 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.96■■■■□ 3.83
TUBA4B-202ENST00000485041 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.13■■■■□ 3.05
TUBA4B-202ENST00000485041 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.69■■■□□ 2.82
TUBA4B-202ENST00000485041 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.35■■■□□ 2.77
TUBA4B-202ENST00000485041 ABCC9O60706 1549 aa32.3■■■□□ 2.76
TUBA4B-202ENST00000485041 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.17■■■□□ 2.74
TUBA4B-202ENST00000485041 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.08■■■□□ 2.73
TUBA4B-202ENST00000485041 NACADO15069 1562 aa31.87■■■□□ 2.69
TUBA4B-202ENST00000485041 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.63■■■□□ 2.65
TUBA4B-202ENST00000485041 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.45■■■□□ 2.62
TUBA4B-202ENST00000485041 SCRIBQ14160 1630 aa31.19■■■□□ 2.58
TUBA4B-202ENST00000485041 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.67■■■□□ 2.5
TUBA4B-202ENST00000485041 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.49■■■□□ 2.47
TUBA4B-202ENST00000485041 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.38■■■□□ 2.45
TUBA4B-202ENST00000485041 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
TUBA4B-202ENST00000485041 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.16■■■□□ 2.42
TUBA4B-202ENST00000485041 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.15■■■□□ 2.42
TUBA4B-202ENST00000485041 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
TUBA4B-202ENST00000485041 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.98■■■□□ 2.39
TUBA4B-202ENST00000485041 SMARCA4P51532 1647 aa29.96■■■□□ 2.39
TUBA4B-202ENST00000485041 WIZO95785 1651 aa29.69■■■□□ 2.34
TUBA4B-202ENST00000485041 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.68■■■□□ 2.34
TUBA4B-202ENST00000485041 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
TUBA4B-202ENST00000485041 SMARCA2P51531 1590 aa29.62■■■□□ 2.33
TUBA4B-202ENST00000485041 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
TUBA4B-202ENST00000485041 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.55■■■□□ 2.32
TUBA4B-202ENST00000485041 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
TUBA4B-202ENST00000485041 NCAPD3P42695 1498 aa29.4■■■□□ 2.3
TUBA4B-202ENST00000485041 HMGXB3Q12766 1538 aa29.34■■■□□ 2.29
TUBA4B-202ENST00000485041 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.23■■■□□ 2.27
TUBA4B-202ENST00000485041 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.17■■■□□ 2.26
TUBA4B-202ENST00000485041 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.89■■■□□ 2.22
TUBA4B-202ENST00000485041 CFTRP13569 1480 aa28.66■■■□□ 2.18
TUBA4B-202ENST00000485041 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.62■■■□□ 2.17
TUBA4B-202ENST00000485041 TRIM41Q8WV44 630 aa28.59■■■□□ 2.17
TUBA4B-202ENST00000485041 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.52■■■□□ 2.16
TUBA4B-202ENST00000485041 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.43■■■□□ 2.14
TUBA4B-202ENST00000485041 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.42■■■□□ 2.14
TUBA4B-202ENST00000485041 PRDM2Q13029 1718 aa28.4■■■□□ 2.14
TUBA4B-202ENST00000485041 ABCC8Q09428 1581 aa28.38■■■□□ 2.13
TUBA4B-202ENST00000485041 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.27■■■□□ 2.12
TUBA4B-202ENST00000485041 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.26■■■□□ 2.11
TUBA4B-202ENST00000485041 NESP48681 1621 aa28.22■■■□□ 2.11
TUBA4B-202ENST00000485041 TOP2BQ02880 1626 aa28.17■■■□□ 2.1
TUBA4B-202ENST00000485041 SYNJ1O43426 1573 aa28.16■■■□□ 2.1
TUBA4B-202ENST00000485041 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.14■■■□□ 2.09
TUBA4B-202ENST00000485041 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.13■■■□□ 2.09
TUBA4B-202ENST00000485041 CUX1P39880 1505 aa28.08■■■□□ 2.08
TUBA4B-202ENST00000485041 EEA1Q15075 1411 aa28.06■■■□□ 2.08
TUBA4B-202ENST00000485041 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.99■■■□□ 2.07
TUBA4B-202ENST00000485041 TOPBP1Q92547 1522 aa27.91■■■□□ 2.06
TUBA4B-202ENST00000485041 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
TUBA4B-202ENST00000485041 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.88■■■□□ 2.05
TUBA4B-202ENST00000485041 SOGA1O94964 1423 aa27.86■■■□□ 2.05
TUBA4B-202ENST00000485041 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.85■■■□□ 2.05
TUBA4B-202ENST00000485041 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.85■■■□□ 2.05
TUBA4B-202ENST00000485041 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
TUBA4B-202ENST00000485041 ERCC6Q03468 1493 aa27.83■■■□□ 2.05
TUBA4B-202ENST00000485041 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.79■■■□□ 2.04
TUBA4B-202ENST00000485041 KIF27Q86VH2 1401 aa27.78■■■□□ 2.04
TUBA4B-202ENST00000485041 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
TUBA4B-202ENST00000485041 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.69■■■□□ 2.02
TUBA4B-202ENST00000485041 WDR62O43379 1518 aa27.68■■■□□ 2.02
TUBA4B-202ENST00000485041 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.66■■■□□ 2.02
TUBA4B-202ENST00000485041 CUX2O14529 1486 aa27.65■■■□□ 2.02
TUBA4B-202ENST00000485041 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.65■■■□□ 2.02
TUBA4B-202ENST00000485041 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.58■■■□□ 2.01
TUBA4B-202ENST00000485041 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
TUBA4B-202ENST00000485041 GOLGA3Q08378 1498 aa27.55■■■□□ 2
TUBA4B-202ENST00000485041 KIF21BO75037 1637 aa27.55■■■□□ 2
TUBA4B-202ENST00000485041 IFT140Q96RY7 1462 aa27.52■■■□□ 2
TUBA4B-202ENST00000485041 WDR97A6NE52 1622 aa27.47■■□□□ 1.99
TUBA4B-202ENST00000485041 PRXQ9BXM0 1461 aa27.46■■□□□ 1.99
TUBA4B-202ENST00000485041 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
TUBA4B-202ENST00000485041 IGF1RP08069 1367 aa27.46■■□□□ 1.99
TUBA4B-202ENST00000485041 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.45■■□□□ 1.98
TUBA4B-202ENST00000485041 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.42■■□□□ 1.98
TUBA4B-202ENST00000485041 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
TUBA4B-202ENST00000485041 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.39■■□□□ 1.98
TUBA4B-202ENST00000485041 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.38■■□□□ 1.97
TUBA4B-202ENST00000485041 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.38■■□□□ 1.97
TUBA4B-202ENST00000485041 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
TUBA4B-202ENST00000485041 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.35■■□□□ 1.97
TUBA4B-202ENST00000485041 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.33■■□□□ 1.97
TUBA4B-202ENST00000485041 CUL7Q14999 1698 aa27.32■■□□□ 1.96
TUBA4B-202ENST00000485041 GRIN2BQ13224 1484 aa27.25■■□□□ 1.95
TUBA4B-202ENST00000485041 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.21■■□□□ 1.95
TUBA4B-202ENST00000485041 CEP162Q5TB80 1403 aa27.18■■□□□ 1.94
TUBA4B-202ENST00000485041 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
TUBA4B-202ENST00000485041 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.15■■□□□ 1.94
TUBA4B-202ENST00000485041 PBRM1Q86U86 1689 aa27.14■■□□□ 1.94
TUBA4B-202ENST00000485041 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.93
TUBA4B-202ENST00000485041 CLIP1P30622 1438 aa27.07■■□□□ 1.92
TUBA4B-202ENST00000485041 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
TUBA4B-202ENST00000485041 ADAMTS12P58397 1594 aa27.05■■□□□ 1.92
TUBA4B-202ENST00000485041 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27■■□□□ 1.91
TUBA4B-202ENST00000485041 SYNJ2O15056 1496 aa26.93■■□□□ 1.9
TUBA4B-202ENST00000485041 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
TUBA4B-202ENST00000485041 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.88■■□□□ 1.89
TUBA4B-202ENST00000485041 GRIN2AQ12879 1464 aa26.87■■□□□ 1.89
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