RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485036.5

TNFRSF25-215, Transcript of TNF receptor superfamily member 25, human

TSL 1 (best)

Gene TNFRSF25, Length 1,726 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TNFRSF25-215	ENST00000485036	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		57.67	■■■■■ 6.82
TNFRSF25-215	ENST00000485036	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		50.41	■■■■■ 5.66
TNFRSF25-215	ENST00000485036	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	48.48	■■■■■ 5.35
TNFRSF25-215	ENST00000485036	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		47.78	■■■■■ 5.24
TNFRSF25-215	ENST00000485036	ABCC9	O60706	1549 aa		47.47	■■■■■ 5.19
TNFRSF25-215	ENST00000485036	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		47.3	■■■■■ 5.16
TNFRSF25-215	ENST00000485036	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		47.24	■■■■■ 5.15
TNFRSF25-215	ENST00000485036	NACAD	O15069	1562 aa		46.89	■■■■■ 5.1
TNFRSF25-215	ENST00000485036	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		46.8	■■■■■ 5.08
TNFRSF25-215	ENST00000485036	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		46.47	■■■■■ 5.03
TNFRSF25-215	ENST00000485036	SCRIB	Q14160	1630 aa		46.21	■■■■■ 4.99
TNFRSF25-215	ENST00000485036	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		45.62	■■■■■ 4.89
TNFRSF25-215	ENST00000485036	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		45.1	■■■■■ 4.81
TNFRSF25-215	ENST00000485036	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	44.97	■■■■■ 4.79
TNFRSF25-215	ENST00000485036	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		44.74	■■■■■ 4.75
TNFRSF25-215	ENST00000485036	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	44.68	■■■■■ 4.74
TNFRSF25-215	ENST00000485036	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	44.66	■■■■■ 4.74
TNFRSF25-215	ENST00000485036	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	44.55	■■■■■ 4.72
TNFRSF25-215	ENST00000485036	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		44.52	■■■■■ 4.72
TNFRSF25-215	ENST00000485036	SMARCA4	P51532	1647 aa		44.36	■■■■■ 4.69
TNFRSF25-215	ENST00000485036	WIZ	O95785	1651 aa		44.17	■■■■■ 4.66
TNFRSF25-215	ENST00000485036	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		43.89	■■■■■ 4.62
TNFRSF25-215	ENST00000485036	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	43.76	■■■■■ 4.6
TNFRSF25-215	ENST00000485036	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	43.71	■■■■■ 4.59
TNFRSF25-215	ENST00000485036	SMARCA2	P51531	1590 aa		43.6	■■■■■ 4.57
TNFRSF25-215	ENST00000485036	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		43.59	■■■■■ 4.57
TNFRSF25-215	ENST00000485036	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	43.32	■■■■■ 4.53
TNFRSF25-215	ENST00000485036	HMGXB3	Q12766	1538 aa		43.24	■■■■■ 4.51
TNFRSF25-215	ENST00000485036	NCAPD3	P42695	1498 aa		43.24	■■■■■ 4.51
TNFRSF25-215	ENST00000485036	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		43.23	■■■■■ 4.51
TNFRSF25-215	ENST00000485036	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		43.14	■■■■■ 4.5
TNFRSF25-215	ENST00000485036	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		43.05	■■■■■ 4.48
TNFRSF25-215	ENST00000485036	TRIM41	Q8WV44	630 aa		42.34	■■■■■ 4.37
TNFRSF25-215	ENST00000485036	ABCC8	Q09428	1581 aa		42.31	■■■■■ 4.36
TNFRSF25-215	ENST00000485036	CFTR	P13569	1480 aa		42.28	■■■■■ 4.36
TNFRSF25-215	ENST00000485036	PRDM2	Q13029	1718 aa		42.2	■■■■■ 4.35
TNFRSF25-215	ENST00000485036	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		42.2	■■■■■ 4.35
TNFRSF25-215	ENST00000485036	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		42.08	■■■■■ 4.33
TNFRSF25-215	ENST00000485036	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	42.05	■■■■■ 4.32
TNFRSF25-215	ENST00000485036	SYNJ1	O43426	1573 aa		41.93	■■■■■ 4.3
TNFRSF25-215	ENST00000485036	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		41.81	■■■■■ 4.28
TNFRSF25-215	ENST00000485036	TOP2B	Q02880	1626 aa		41.8	■■■■■ 4.28
TNFRSF25-215	ENST00000485036	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		41.79	■■■■■ 4.28
TNFRSF25-215	ENST00000485036	NES	P48681	1621 aa		41.69	■■■■■ 4.26
TNFRSF25-215	ENST00000485036	CUX1	P39880	1505 aa		41.64	■■■■■ 4.26
TNFRSF25-215	ENST00000485036	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		41.62	■■■■■ 4.25
TNFRSF25-215	ENST00000485036	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	41.48	■■■■■ 4.23
TNFRSF25-215	ENST00000485036	SOGA1	O94964	1423 aa		41.48	■■■■■ 4.23
TNFRSF25-215	ENST00000485036	EEA1	Q15075	1411 aa		41.48	■■■■■ 4.23
TNFRSF25-215	ENST00000485036	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		41.39	■■■■■ 4.22
TNFRSF25-215	ENST00000485036	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		41.39	■■■■■ 4.22
TNFRSF25-215	ENST00000485036	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		41.38	■■■■■ 4.22
TNFRSF25-215	ENST00000485036	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		41.32	■■■■■ 4.21
TNFRSF25-215	ENST00000485036	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		41.32	■■■■■ 4.2
TNFRSF25-215	ENST00000485036	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		41.3	■■■■■ 4.2
TNFRSF25-215	ENST00000485036	TOPBP1	Q92547	1522 aa		41.2	■■■■■ 4.19
TNFRSF25-215	ENST00000485036	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		41.17	■■■■■ 4.18
TNFRSF25-215	ENST00000485036	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	41.13	■■■■■ 4.18
TNFRSF25-215	ENST00000485036	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		41.12	■■■■■ 4.17
TNFRSF25-215	ENST00000485036	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	41	■■■■■ 4.15
TNFRSF25-215	ENST00000485036	KIF21B	O75037	1637 aa		40.99	■■■■■ 4.15
TNFRSF25-215	ENST00000485036	KIF27	Q86VH2	1401 aa		40.98	■■■■■ 4.15
TNFRSF25-215	ENST00000485036	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		40.91	■■■■■ 4.14
TNFRSF25-215	ENST00000485036	GOLGA3	Q08378	1498 aa		40.88	■■■■■ 4.13
TNFRSF25-215	ENST00000485036	CUX2	O14529	1486 aa		40.86	■■■■■ 4.13
TNFRSF25-215	ENST00000485036	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		40.85	■■■■■ 4.13
TNFRSF25-215	ENST00000485036	WDR97	A6NE52	1622 aa		40.82	■■■■■ 4.13
TNFRSF25-215	ENST00000485036	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		40.81	■■■■■ 4.12
TNFRSF25-215	ENST00000485036	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		40.79	■■■■■ 4.12
TNFRSF25-215	ENST00000485036	PRX	Q9BXM0	1461 aa		40.75	■■■■■ 4.11
TNFRSF25-215	ENST00000485036	WDR62	O43379	1518 aa		40.75	■■■■■ 4.11
TNFRSF25-215	ENST00000485036	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		40.73	■■■■■ 4.11
TNFRSF25-215	ENST00000485036	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		40.72	■■■■■ 4.11
TNFRSF25-215	ENST00000485036	ERCC6	Q03468	1493 aa		40.7	■■■■■ 4.11
TNFRSF25-215	ENST00000485036	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		40.67	■■■■■ 4.1
TNFRSF25-215	ENST00000485036	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	40.65	■■■■■ 4.1
TNFRSF25-215	ENST00000485036	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	40.64	■■■■■ 4.1
TNFRSF25-215	ENST00000485036	IGF1R	P08069	1367 aa		40.59	■■■■■ 4.09
TNFRSF25-215	ENST00000485036	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		40.57	■■■■■ 4.09
TNFRSF25-215	ENST00000485036	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	40.51	■■■■■ 4.08
TNFRSF25-215	ENST00000485036	CEP162	Q5TB80	1403 aa		40.49	■■■■■ 4.07
TNFRSF25-215	ENST00000485036	CUL7	Q14999	1698 aa		40.42	■■■■■ 4.06
TNFRSF25-215	ENST00000485036	IFT140	Q96RY7	1462 aa		40.4	■■■■■ 4.06
TNFRSF25-215	ENST00000485036	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		40.38	■■■■■ 4.06
TNFRSF25-215	ENST00000485036	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		40.38	■■■■■ 4.05
TNFRSF25-215	ENST00000485036	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	40.35	■■■■■ 4.05
TNFRSF25-215	ENST00000485036	PBRM1	Q86U86	1689 aa		40.26	■■■■■ 4.04
TNFRSF25-215	ENST00000485036	CLIP1	P30622	1438 aa		40.18	■■■■■ 4.02
TNFRSF25-215	ENST00000485036	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	40.14	■■■■■ 4.02
TNFRSF25-215	ENST00000485036	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	40.13	■■■■■ 4.01
TNFRSF25-215	ENST00000485036	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	40.09	■■■■■ 4.01
TNFRSF25-215	ENST00000485036	GRIN2B	Q13224	1484 aa		40.09	■■■■■ 4.01
TNFRSF25-215	ENST00000485036	ADAMTS12	P58397	1594 aa		40.03	■■■■■ 4
TNFRSF25-215	ENST00000485036	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		39.98	■■■■□ 3.99
TNFRSF25-215	ENST00000485036	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		39.96	■■■■□ 3.99
TNFRSF25-215	ENST00000485036	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		39.86	■■■■□ 3.97
TNFRSF25-215	ENST00000485036	ARAP1	Q96P48	1450 aa		39.85	■■■■□ 3.97
TNFRSF25-215	ENST00000485036	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		39.83	■■■■□ 3.97
TNFRSF25-215	ENST00000485036	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		39.81	■■■■□ 3.96
TNFRSF25-215	ENST00000485036	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	39.78	■■■■□ 3.96

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