RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484939.1

SPATA1-204, Transcript of spermatogenesis associated 1, humanhuman

TSL 2

Gene SPATA1, Length 563 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA1-204ENST00000484939 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.94■■■■■ 7.51
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SPATA1-204ENST00000484939 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.24■■■■■ 5.95
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SPATA1-204ENST00000484939 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.69■■■■■ 5.87
SPATA1-204ENST00000484939 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.61■■■■■ 5.85
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SPATA1-204ENST00000484939 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.29■■■■■ 5.8
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SPATA1-204ENST00000484939 SMARCA4P51532 1647 aa48.2■■■■■ 5.31
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SPATA1-204ENST00000484939 SMARCA2P51531 1590 aa47.92■■■■■ 5.26
SPATA1-204ENST00000484939 HMGXB3Q12766 1538 aa47.83■■■■■ 5.25
SPATA1-204ENST00000484939 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.79■■■■■ 5.24
SPATA1-204ENST00000484939 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.72■■■■■ 5.23
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SPATA1-204ENST00000484939 WIZO95785 1651 aa47.2■■■■■ 5.15
SPATA1-204ENST00000484939 NESP48681 1621 aa47.02■■■■■ 5.12
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SPATA1-204ENST00000484939 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.88■■■■■ 5.1
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SPATA1-204ENST00000484939 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.47■■■■■ 5.03
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SPATA1-204ENST00000484939 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.03■■■■■ 4.96
SPATA1-204ENST00000484939 WDR62O43379 1518 aa46.02■■■■■ 4.96
SPATA1-204ENST00000484939 PRDM2Q13029 1718 aa46■■■■■ 4.95
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SPATA1-204ENST00000484939 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.67■■■■■ 4.9
SPATA1-204ENST00000484939 TOPBP1Q92547 1522 aa45.3■■■■■ 4.84
SPATA1-204ENST00000484939 ABCC8Q09428 1581 aa45.23■■■■■ 4.83
SPATA1-204ENST00000484939 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.23■■■■■ 4.83
SPATA1-204ENST00000484939 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.22■■■■■ 4.83
SPATA1-204ENST00000484939 IFT140Q96RY7 1462 aa45.1■■■■■ 4.81
SPATA1-204ENST00000484939 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.95■■■■■ 4.79
SPATA1-204ENST00000484939 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.91■■■■■ 4.78
SPATA1-204ENST00000484939 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.89■■■■■ 4.78
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SPATA1-204ENST00000484939 CUX1P39880 1505 aa44.8■■■■■ 4.76
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SPATA1-204ENST00000484939 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.65■■■■■ 4.74
SPATA1-204ENST00000484939 SOGA1O94964 1423 aa44.6■■■■■ 4.73
SPATA1-204ENST00000484939 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.59■■■■■ 4.73
SPATA1-204ENST00000484939 OSCARQ8IYS5 282 aa44.53■■■■■ 4.72
SPATA1-204ENST00000484939 WDR97A6NE52 1622 aa44.53■■■■■ 4.72
SPATA1-204ENST00000484939 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.4■■■■■ 4.7
SPATA1-204ENST00000484939 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.36■■■■■ 4.69
SPATA1-204ENST00000484939 CHD1O14646 1710 aa44.36■■■■■ 4.69
SPATA1-204ENST00000484939 TOP2BQ02880 1626 aa44.32■■■■■ 4.69
SPATA1-204ENST00000484939 SYNJ1O43426 1573 aa44.28■■■■■ 4.68
SPATA1-204ENST00000484939 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.27■■■■■ 4.68
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SPATA1-204ENST00000484939 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.2■■■■■ 4.67
SPATA1-204ENST00000484939 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.2■■■■■ 4.67
SPATA1-204ENST00000484939 GRIN2BQ13224 1484 aa44.18■■■■■ 4.66
SPATA1-204ENST00000484939 PBRM1Q86U86 1689 aa44.17■■■■■ 4.66
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SPATA1-204ENST00000484939 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.03■■■■■ 4.64
SPATA1-204ENST00000484939 SYNJ2O15056 1496 aa43.97■■■■■ 4.63
SPATA1-204ENST00000484939 FBLN2P98095 1184 aa43.97■■■■■ 4.63
SPATA1-204ENST00000484939 ARHGEF11O15085 1522 aa43.95■■■■■ 4.63
SPATA1-204ENST00000484939 TRIM41Q8WV44 630 aa43.87■■■■■ 4.61
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SPATA1-204ENST00000484939 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.84■■■■■ 4.61
SPATA1-204ENST00000484939 ADAMTS12P58397 1594 aa43.77■■■■■ 4.6
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SPATA1-204ENST00000484939 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.59■■■■■ 4.57
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SPATA1-204ENST00000484939 NUP160Q12769 1436 aa43.5■■■■■ 4.55
SPATA1-204ENST00000484939 CEP170Q5SW79 1584 aa43.5■■■■■ 4.55
SPATA1-204ENST00000484939 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.4■■■■■ 4.54
SPATA1-204ENST00000484939 KIF27Q86VH2 1401 aa43.35■■■■■ 4.53
SPATA1-204ENST00000484939 SHROOM2Q13796 1616 aa43.3■■■■■ 4.52
SPATA1-204ENST00000484939 CUL7Q14999 1698 aa43.27■■■■■ 4.52
SPATA1-204ENST00000484939 IGF1RP08069 1367 aa43.26■■■■■ 4.52
SPATA1-204ENST00000484939 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.2■■■■■ 4.51
SPATA1-204ENST00000484939 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.16■■■■■ 4.5
SPATA1-204ENST00000484939 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.96■■■■■ 4.47
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