RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484735.5

ITGB1BP1-215, Transcript of integrin subunit beta 1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene ITGB1BP1, Length 540 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB1BP1-215ENST00000484735 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.21■■■■■ 4.19
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ITGB1BP1-215ENST00000484735 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.95■■■■□ 3.18
ITGB1BP1-215ENST00000484735 NACADO15069 1562 aa34.79■■■■□ 3.16
ITGB1BP1-215ENST00000484735 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.53■■■■□ 3.12
ITGB1BP1-215ENST00000484735 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.45■■■■□ 3.1
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ITGB1BP1-215ENST00000484735 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.23■■■■□ 3.07
ITGB1BP1-215ENST00000484735 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.11■■■■□ 3.05
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ITGB1BP1-215ENST00000484735 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.91■■■■□ 3.02
ITGB1BP1-215ENST00000484735 SCRIBQ14160 1630 aa33.58■■■□□ 2.97
ITGB1BP1-215ENST00000484735 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.53■■■□□ 2.96
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ITGB1BP1-215ENST00000484735 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.04■■■□□ 2.88
ITGB1BP1-215ENST00000484735 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.86■■■□□ 2.85
ITGB1BP1-215ENST00000484735 SMARCA4P51532 1647 aa32.11■■■□□ 2.73
ITGB1BP1-215ENST00000484735 NCAPD3P42695 1498 aa32.1■■■□□ 2.73
ITGB1BP1-215ENST00000484735 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.03■■■□□ 2.72
ITGB1BP1-215ENST00000484735 SMARCA2P51531 1590 aa31.98■■■□□ 2.71
ITGB1BP1-215ENST00000484735 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.98■■■□□ 2.71
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ITGB1BP1-215ENST00000484735 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.81■■■□□ 2.68
ITGB1BP1-215ENST00000484735 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.74■■■□□ 2.67
ITGB1BP1-215ENST00000484735 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.73■■■□□ 2.67
ITGB1BP1-215ENST00000484735 ERCC6Q03468 1493 aa31.5■■■□□ 2.63
ITGB1BP1-215ENST00000484735 NESP48681 1621 aa31.45■■■□□ 2.62
ITGB1BP1-215ENST00000484735 WIZO95785 1651 aa31.4■■■□□ 2.62
ITGB1BP1-215ENST00000484735 CUX2O14529 1486 aa31.39■■■□□ 2.62
ITGB1BP1-215ENST00000484735 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.34■■■□□ 2.61
ITGB1BP1-215ENST00000484735 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.18■■■□□ 2.58
ITGB1BP1-215ENST00000484735 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.13■■■□□ 2.57
ITGB1BP1-215ENST00000484735 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.13■■■□□ 2.57
ITGB1BP1-215ENST00000484735 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.12■■■□□ 2.57
ITGB1BP1-215ENST00000484735 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.11■■■□□ 2.57
ITGB1BP1-215ENST00000484735 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.03■■■□□ 2.56
ITGB1BP1-215ENST00000484735 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.97■■■□□ 2.55
ITGB1BP1-215ENST00000484735 CFTRP13569 1480 aa30.83■■■□□ 2.53
ITGB1BP1-215ENST00000484735 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.83■■■□□ 2.53
ITGB1BP1-215ENST00000484735 WDR62O43379 1518 aa30.77■■■□□ 2.52
ITGB1BP1-215ENST00000484735 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.76■■■□□ 2.52
ITGB1BP1-215ENST00000484735 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.76■■■□□ 2.51
ITGB1BP1-215ENST00000484735 PRDM2Q13029 1718 aa30.67■■■□□ 2.5
ITGB1BP1-215ENST00000484735 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.64■■■□□ 2.5
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ITGB1BP1-215ENST00000484735 TOPBP1Q92547 1522 aa30.22■■■□□ 2.43
ITGB1BP1-215ENST00000484735 ABCC8Q09428 1581 aa30.2■■■□□ 2.43
ITGB1BP1-215ENST00000484735 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.16■■■□□ 2.42
ITGB1BP1-215ENST00000484735 IFT140Q96RY7 1462 aa30.15■■■□□ 2.42
ITGB1BP1-215ENST00000484735 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.04■■■□□ 2.4
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ITGB1BP1-215ENST00000484735 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
ITGB1BP1-215ENST00000484735 OSCARQ8IYS5 282 aa29.95■■■□□ 2.39
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ITGB1BP1-215ENST00000484735 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
ITGB1BP1-215ENST00000484735 CUX1P39880 1505 aa29.81■■■□□ 2.36
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ITGB1BP1-215ENST00000484735 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.79■■■□□ 2.36
ITGB1BP1-215ENST00000484735 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.78■■■□□ 2.36
ITGB1BP1-215ENST00000484735 SOGA1O94964 1423 aa29.78■■■□□ 2.36
ITGB1BP1-215ENST00000484735 WDR97A6NE52 1622 aa29.72■■■□□ 2.35
ITGB1BP1-215ENST00000484735 CHD1O14646 1710 aa29.69■■■□□ 2.34
ITGB1BP1-215ENST00000484735 TRIM41Q8WV44 630 aa29.67■■■□□ 2.34
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ITGB1BP1-215ENST00000484735 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.58■■■□□ 2.33
ITGB1BP1-215ENST00000484735 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.58■■■□□ 2.33
ITGB1BP1-215ENST00000484735 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.53■■■□□ 2.32
ITGB1BP1-215ENST00000484735 ARHGEF11O15085 1522 aa29.5■■■□□ 2.31
ITGB1BP1-215ENST00000484735 GRIN2BQ13224 1484 aa29.5■■■□□ 2.31
ITGB1BP1-215ENST00000484735 FBLN2P98095 1184 aa29.5■■■□□ 2.31
ITGB1BP1-215ENST00000484735 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
ITGB1BP1-215ENST00000484735 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.49■■■□□ 2.31
ITGB1BP1-215ENST00000484735 PBRM1Q86U86 1689 aa29.47■■■□□ 2.31
ITGB1BP1-215ENST00000484735 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.47■■■□□ 2.31
ITGB1BP1-215ENST00000484735 TOP2BQ02880 1626 aa29.45■■■□□ 2.3
ITGB1BP1-215ENST00000484735 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.43■■■□□ 2.3
ITGB1BP1-215ENST00000484735 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.43■■■□□ 2.3
ITGB1BP1-215ENST00000484735 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.42■■■□□ 2.3
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ITGB1BP1-215ENST00000484735 SYNJ2O15056 1496 aa29.38■■■□□ 2.29
ITGB1BP1-215ENST00000484735 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
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ITGB1BP1-215ENST00000484735 ARAP1Q96P48 1450 aa29.23■■■□□ 2.27
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ITGB1BP1-215ENST00000484735 ADAMTS12P58397 1594 aa29.18■■■□□ 2.26
ITGB1BP1-215ENST00000484735 GRIN2AQ12879 1464 aa29.13■■■□□ 2.25
ITGB1BP1-215ENST00000484735 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.13■■■□□ 2.25
ITGB1BP1-215ENST00000484735 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.08■■■□□ 2.25
ITGB1BP1-215ENST00000484735 NUP160Q12769 1436 aa29.03■■■□□ 2.24
ITGB1BP1-215ENST00000484735 CEP170Q5SW79 1584 aa29.02■■■□□ 2.24
ITGB1BP1-215ENST00000484735 SHROOM2Q13796 1616 aa28.91■■■□□ 2.22
ITGB1BP1-215ENST00000484735 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.86■■■□□ 2.21
ITGB1BP1-215ENST00000484735 KIF27Q86VH2 1401 aa28.84■■■□□ 2.21
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ITGB1BP1-215ENST00000484735 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.76■■■□□ 2.19
ITGB1BP1-215ENST00000484735 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.76■■■□□ 2.19
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