RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484547.7

RABGEF1-207, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RABGEF1, Length 1,596 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-207ENST00000484547 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.71■■■□□ 2.35
RABGEF1-207ENST00000484547 ABCC9O60706 1549 aa27.03■■□□□ 1.92
RABGEF1-207ENST00000484547 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.78■■□□□ 1.88
RABGEF1-207ENST00000484547 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.6■■□□□ 1.69
RABGEF1-207ENST00000484547 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.53■■□□□ 1.68
RABGEF1-207ENST00000484547 NACADO15069 1562 aa25.35■■□□□ 1.65
RABGEF1-207ENST00000484547 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.23■■□□□ 1.63
RABGEF1-207ENST00000484547 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.12■■□□□ 1.61
RABGEF1-207ENST00000484547 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.08■■□□□ 1.61
RABGEF1-207ENST00000484547 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.89■■□□□ 1.57
RABGEF1-207ENST00000484547 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.87■■□□□ 1.57
RABGEF1-207ENST00000484547 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.52
RABGEF1-207ENST00000484547 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.5■■□□□ 1.51
RABGEF1-207ENST00000484547 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.46■■□□□ 1.51
RABGEF1-207ENST00000484547 SCRIBQ14160 1630 aa24.43■■□□□ 1.5
RABGEF1-207ENST00000484547 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.4■■□□□ 1.5
RABGEF1-207ENST00000484547 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.35■■□□□ 1.49
RABGEF1-207ENST00000484547 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
RABGEF1-207ENST00000484547 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.58■■□□□ 1.37
RABGEF1-207ENST00000484547 NCAPD3P42695 1498 aa23.39■■□□□ 1.33
RABGEF1-207ENST00000484547 ERCC6Q03468 1493 aa23.34■■□□□ 1.33
RABGEF1-207ENST00000484547 CUX2O14529 1486 aa23.34■■□□□ 1.33
RABGEF1-207ENST00000484547 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.31■■□□□ 1.32
RABGEF1-207ENST00000484547 SMARCA4P51532 1647 aa23.25■■□□□ 1.31
RABGEF1-207ENST00000484547 SMARCA2P51531 1590 aa23.23■■□□□ 1.31
RABGEF1-207ENST00000484547 HMGXB3Q12766 1538 aa23.21■■□□□ 1.31
RABGEF1-207ENST00000484547 NESP48681 1621 aa23.15■■□□□ 1.3
RABGEF1-207ENST00000484547 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
RABGEF1-207ENST00000484547 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
RABGEF1-207ENST00000484547 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.99■■□□□ 1.27
RABGEF1-207ENST00000484547 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
RABGEF1-207ENST00000484547 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.92■■□□□ 1.26
RABGEF1-207ENST00000484547 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.92■■□□□ 1.26
RABGEF1-207ENST00000484547 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.87■■□□□ 1.25
RABGEF1-207ENST00000484547 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.79■■□□□ 1.24
RABGEF1-207ENST00000484547 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.68■■□□□ 1.22
RABGEF1-207ENST00000484547 WIZO95785 1651 aa22.66■■□□□ 1.22
RABGEF1-207ENST00000484547 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.62■■□□□ 1.21
RABGEF1-207ENST00000484547 WDR62O43379 1518 aa22.57■■□□□ 1.2
RABGEF1-207ENST00000484547 TRIM41Q8WV44 630 aa22.52■■□□□ 1.2
RABGEF1-207ENST00000484547 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.49■■□□□ 1.19
RABGEF1-207ENST00000484547 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.45■■□□□ 1.18
RABGEF1-207ENST00000484547 CFTRP13569 1480 aa22.37■■□□□ 1.17
RABGEF1-207ENST00000484547 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
RABGEF1-207ENST00000484547 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
RABGEF1-207ENST00000484547 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
RABGEF1-207ENST00000484547 OSCARQ8IYS5 282 aa22.24■■□□□ 1.15
RABGEF1-207ENST00000484547 PRDM2Q13029 1718 aa22.2■■□□□ 1.14
RABGEF1-207ENST00000484547 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.07■■□□□ 1.12
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
RABGEF1-207ENST00000484547 IFT140Q96RY7 1462 aa22.04■■□□□ 1.12
RABGEF1-207ENST00000484547 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.02■■□□□ 1.12
RABGEF1-207ENST00000484547 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.02■■□□□ 1.12
RABGEF1-207ENST00000484547 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.02■■□□□ 1.12
RABGEF1-207ENST00000484547 TOPBP1Q92547 1522 aa22■■□□□ 1.11
RABGEF1-207ENST00000484547 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
RABGEF1-207ENST00000484547 ARHGEF11O15085 1522 aa21.91■■□□□ 1.1
RABGEF1-207ENST00000484547 ABCC8Q09428 1581 aa21.9■■□□□ 1.1
RABGEF1-207ENST00000484547 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.9■■□□□ 1.1
RABGEF1-207ENST00000484547 CHD1O14646 1710 aa21.84■■□□□ 1.09
RABGEF1-207ENST00000484547 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
RABGEF1-207ENST00000484547 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.82■■□□□ 1.082e-7■■■□□ 15.2
RABGEF1-207ENST00000484547 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.77■■□□□ 1.08
RABGEF1-207ENST00000484547 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
RABGEF1-207ENST00000484547 FBLN2P98095 1184 aa21.74■■□□□ 1.07
RABGEF1-207ENST00000484547 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.7■■□□□ 1.06
RABGEF1-207ENST00000484547 ARAP1Q96P48 1450 aa21.68■■□□□ 1.06
RABGEF1-207ENST00000484547 SOGA1O94964 1423 aa21.65■■□□□ 1.06
RABGEF1-207ENST00000484547 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
RABGEF1-207ENST00000484547 TRHP20396 242 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
RABGEF1-207ENST00000484547 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.59■■□□□ 1.05
RABGEF1-207ENST00000484547 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.59■■□□□ 1.05
RABGEF1-207ENST00000484547 WDR97A6NE52 1622 aa21.55■■□□□ 1.04
RABGEF1-207ENST00000484547 CUX1P39880 1505 aa21.54■■□□□ 1.04
RABGEF1-207ENST00000484547 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.53■■□□□ 1.04
RABGEF1-207ENST00000484547 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
RABGEF1-207ENST00000484547 SYNJ1O43426 1573 aa21.5■■□□□ 1.03
RABGEF1-207ENST00000484547 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
RABGEF1-207ENST00000484547 GRIN2BQ13224 1484 aa21.48■■□□□ 1.03
RABGEF1-207ENST00000484547 SYNJ2O15056 1496 aa21.44■■□□□ 1.02
RABGEF1-207ENST00000484547 PBRM1Q86U86 1689 aa21.44■■□□□ 1.02
RABGEF1-207ENST00000484547 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.38■■□□□ 1.01
RABGEF1-207ENST00000484547 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.33■■□□□ 1
RABGEF1-207ENST00000484547 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.31■■□□□ 1
RABGEF1-207ENST00000484547 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
RABGEF1-207ENST00000484547 GRIN2AQ12879 1464 aa21.22■□□□□ 0.99
RABGEF1-207ENST00000484547 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.21■□□□□ 0.99
RABGEF1-207ENST00000484547 ADAMTS12P58397 1594 aa21.19■□□□□ 0.98
RABGEF1-207ENST00000484547 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.19■□□□□ 0.98
RABGEF1-207ENST00000484547 CEP170Q5SW79 1584 aa21.17■□□□□ 0.98
RABGEF1-207ENST00000484547 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.14■□□□□ 0.98
RABGEF1-207ENST00000484547 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
RABGEF1-207ENST00000484547 NUP160Q12769 1436 aa21.14■□□□□ 0.97
RABGEF1-207ENST00000484547 TOP2BQ02880 1626 aa21.13■□□□□ 0.97
RABGEF1-207ENST00000484547 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.09■□□□□ 0.97
RABGEF1-207ENST00000484547 SHROOM2Q13796 1616 aa21.09■□□□□ 0.97
RABGEF1-207ENST00000484547 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.04■□□□□ 0.96
RABGEF1-207ENST00000484547 KIF13AQ9H1H9 1805 aa20.98■□□□□ 0.95
RABGEF1-207ENST00000484547 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
RABGEF1-207ENST00000484547 JPH4Q96JJ6 628 aa20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms