RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484545.1

NELFA-214, Transcript of negative elongation factor complex member A, humanhuman

TSL 3

Gene NELFA, Length 556 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFA-214ENST00000484545 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.16■■■■■ 4.18
NELFA-214ENST00000484545 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.66■■■■□ 3.46
NELFA-214ENST00000484545 ABCC9O60706 1549 aa36.23■■■■□ 3.39
NELFA-214ENST00000484545 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.7■■■■□ 3.15
NELFA-214ENST00000484545 NACADO15069 1562 aa34.62■■■■□ 3.13
NELFA-214ENST00000484545 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.52■■■■□ 3.12
NELFA-214ENST00000484545 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.35■■■■□ 3.09
NELFA-214ENST00000484545 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.2■■■■□ 3.06
NELFA-214ENST00000484545 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.06■■■■□ 3.04
NELFA-214ENST00000484545 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.84■■■■□ 3.01
NELFA-214ENST00000484545 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.79■■■■□ 3
NELFA-214ENST00000484545 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.68■■■□□ 2.98
NELFA-214ENST00000484545 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.65■■■□□ 2.98
NELFA-214ENST00000484545 SCRIBQ14160 1630 aa33.39■■■□□ 2.93
NELFA-214ENST00000484545 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.34■■■□□ 2.93
NELFA-214ENST00000484545 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.8■■■□□ 2.84
NELFA-214ENST00000484545 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.73■■■□□ 2.83
NELFA-214ENST00000484545 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.61■■■□□ 2.81
NELFA-214ENST00000484545 NCAPD3P42695 1498 aa32■■■□□ 2.71
NELFA-214ENST00000484545 SMARCA4P51532 1647 aa31.95■■■□□ 2.71
NELFA-214ENST00000484545 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.93■■■□□ 2.7
NELFA-214ENST00000484545 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.9■■■□□ 2.7
NELFA-214ENST00000484545 SMARCA2P51531 1590 aa31.85■■■□□ 2.69
NELFA-214ENST00000484545 HMGXB3Q12766 1538 aa31.74■■■□□ 2.67
NELFA-214ENST00000484545 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.69■■■□□ 2.66
NELFA-214ENST00000484545 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.69■■■□□ 2.66
NELFA-214ENST00000484545 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.6■■■□□ 2.65
NELFA-214ENST00000484545 WIZO95785 1651 aa31.27■■■□□ 2.6
NELFA-214ENST00000484545 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.25■■■□□ 2.59
NELFA-214ENST00000484545 NESP48681 1621 aa31.25■■■□□ 2.59
NELFA-214ENST00000484545 ERCC6Q03468 1493 aa31.24■■■□□ 2.59
NELFA-214ENST00000484545 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.13■■■□□ 2.57
NELFA-214ENST00000484545 CUX2O14529 1486 aa31.08■■■□□ 2.57
NELFA-214ENST00000484545 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.05■■■□□ 2.56
NELFA-214ENST00000484545 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.98■■■□□ 2.55
NELFA-214ENST00000484545 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.97■■■□□ 2.55
NELFA-214ENST00000484545 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.81■■■□□ 2.52
NELFA-214ENST00000484545 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.78■■■□□ 2.52
NELFA-214ENST00000484545 CFTRP13569 1480 aa30.77■■■□□ 2.52
NELFA-214ENST00000484545 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.64■■■□□ 2.5
NELFA-214ENST00000484545 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.64■■■□□ 2.5
NELFA-214ENST00000484545 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.63■■■□□ 2.49
NELFA-214ENST00000484545 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.62■■■□□ 2.49
NELFA-214ENST00000484545 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.59■■■□□ 2.49
NELFA-214ENST00000484545 WDR62O43379 1518 aa30.55■■■□□ 2.48
NELFA-214ENST00000484545 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.34■■■□□ 2.45
NELFA-214ENST00000484545 PRDM2Q13029 1718 aa30.32■■■□□ 2.44
NELFA-214ENST00000484545 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
NELFA-214ENST00000484545 ABCC8Q09428 1581 aa30.12■■■□□ 2.41
NELFA-214ENST00000484545 TOPBP1Q92547 1522 aa30.1■■■□□ 2.41
NELFA-214ENST00000484545 IFT140Q96RY7 1462 aa30.01■■■□□ 2.4
NELFA-214ENST00000484545 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.01■■■□□ 2.39
NELFA-214ENST00000484545 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
NELFA-214ENST00000484545 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
NELFA-214ENST00000484545 OSCARQ8IYS5 282 aa29.79■■■□□ 2.36
NELFA-214ENST00000484545 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
NELFA-214ENST00000484545 SOGA1O94964 1423 aa29.74■■■□□ 2.35
NELFA-214ENST00000484545 CUX1P39880 1505 aa29.74■■■□□ 2.35
NELFA-214ENST00000484545 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.7■■■□□ 2.355e-8■■□□□ 11.6
NELFA-214ENST00000484545 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.7■■■□□ 2.35
NELFA-214ENST00000484545 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
NELFA-214ENST00000484545 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.69■■■□□ 2.34
NELFA-214ENST00000484545 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
NELFA-214ENST00000484545 WDR97A6NE52 1622 aa29.53■■■□□ 2.32
NELFA-214ENST00000484545 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.45■■■□□ 2.31
NELFA-214ENST00000484545 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.42■■■□□ 2.3
NELFA-214ENST00000484545 GRIN2BQ13224 1484 aa29.42■■■□□ 2.3
NELFA-214ENST00000484545 FBLN2P98095 1184 aa29.4■■■□□ 2.3
NELFA-214ENST00000484545 TOP2BQ02880 1626 aa29.38■■■□□ 2.29
NELFA-214ENST00000484545 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.38■■■□□ 2.29
NELFA-214ENST00000484545 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
NELFA-214ENST00000484545 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.36■■■□□ 2.29
NELFA-214ENST00000484545 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.36■■■□□ 2.29
NELFA-214ENST00000484545 TRIM41Q8WV44 630 aa29.34■■■□□ 2.29
NELFA-214ENST00000484545 SYNJ1O43426 1573 aa29.33■■■□□ 2.29
NELFA-214ENST00000484545 CHD1O14646 1710 aa29.33■■■□□ 2.29
NELFA-214ENST00000484545 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.3■■■□□ 2.28
NELFA-214ENST00000484545 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.27■■■□□ 2.28
NELFA-214ENST00000484545 SYNJ2O15056 1496 aa29.25■■■□□ 2.27
NELFA-214ENST00000484545 ARHGEF11O15085 1522 aa29.22■■■□□ 2.27
NELFA-214ENST00000484545 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.22■■■□□ 2.27
NELFA-214ENST00000484545 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.22■■■□□ 2.27
NELFA-214ENST00000484545 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.22■■■□□ 2.27
NELFA-214ENST00000484545 PBRM1Q86U86 1689 aa29.19■■■□□ 2.26
NELFA-214ENST00000484545 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.1■■■□□ 2.25
NELFA-214ENST00000484545 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.04■■■□□ 2.24
NELFA-214ENST00000484545 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.03■■■□□ 2.24
NELFA-214ENST00000484545 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.03■■■□□ 2.24
NELFA-214ENST00000484545 GRIN2AQ12879 1464 aa29.02■■■□□ 2.24
NELFA-214ENST00000484545 ADAMTS12P58397 1594 aa29.01■■■□□ 2.23
NELFA-214ENST00000484545 ARAP1Q96P48 1450 aa28.97■■■□□ 2.23
NELFA-214ENST00000484545 NUP160Q12769 1436 aa28.94■■■□□ 2.22
NELFA-214ENST00000484545 KIF27Q86VH2 1401 aa28.88■■■□□ 2.21
NELFA-214ENST00000484545 CEP170Q5SW79 1584 aa28.85■■■□□ 2.21
NELFA-214ENST00000484545 IGF1RP08069 1367 aa28.85■■■□□ 2.21
NELFA-214ENST00000484545 SHROOM2Q13796 1616 aa28.69■■■□□ 2.18
NELFA-214ENST00000484545 JPH4Q96JJ6 628 aa28.67■■■□□ 2.18
NELFA-214ENST00000484545 CUL7Q14999 1698 aa28.66■■■□□ 2.18
NELFA-214ENST00000484545 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.66■■■□□ 2.18
NELFA-214ENST00000484545 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.64■■■□□ 2.18
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