RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483973.5

TRAPPC10-210, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 3

Gene TRAPPC10, Length 579 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-210ENST00000483973 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.48■■■□□ 2.95
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TRAPPC10-210ENST00000483973 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.18■■■□□ 2.42
TRAPPC10-210ENST00000483973 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.85■■■□□ 2.21
TRAPPC10-210ENST00000483973 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.73■■■□□ 2.19
TRAPPC10-210ENST00000483973 NACADO15069 1562 aa28.56■■■□□ 2.16
TRAPPC10-210ENST00000483973 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.51■■■□□ 2.15
TRAPPC10-210ENST00000483973 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.32■■■□□ 2.12
TRAPPC10-210ENST00000483973 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.29■■■□□ 2.12
TRAPPC10-210ENST00000483973 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.02■■■□□ 2.08
TRAPPC10-210ENST00000483973 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.99■■■□□ 2.07
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TRAPPC10-210ENST00000483973 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.59■■■□□ 2.01
TRAPPC10-210ENST00000483973 SCRIBQ14160 1630 aa27.53■■■□□ 2
TRAPPC10-210ENST00000483973 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.51■■■□□ 2
TRAPPC10-210ENST00000483973 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.49■■□□□ 1.99
TRAPPC10-210ENST00000483973 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.42■■□□□ 1.98
TRAPPC10-210ENST00000483973 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
TRAPPC10-210ENST00000483973 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC10-210ENST00000483973 NCAPD3P42695 1498 aa26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC10-210ENST00000483973 ERCC6Q03468 1493 aa26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC10-210ENST00000483973 CUX2O14529 1486 aa26.28■■□□□ 1.8
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TRAPPC10-210ENST00000483973 SMARCA4P51532 1647 aa26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC10-210ENST00000483973 SMARCA2P51531 1590 aa26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC10-210ENST00000483973 HMGXB3Q12766 1538 aa26.14■■□□□ 1.77
TRAPPC10-210ENST00000483973 NESP48681 1621 aa26.08■■□□□ 1.77
TRAPPC10-210ENST00000483973 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC10-210ENST00000483973 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
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TRAPPC10-210ENST00000483973 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
TRAPPC10-210ENST00000483973 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC10-210ENST00000483973 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC10-210ENST00000483973 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC10-210ENST00000483973 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC10-210ENST00000483973 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.56■■□□□ 1.68
TRAPPC10-210ENST00000483973 WIZO95785 1651 aa25.55■■□□□ 1.68
TRAPPC10-210ENST00000483973 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.47■■□□□ 1.67
TRAPPC10-210ENST00000483973 WDR62O43379 1518 aa25.41■■□□□ 1.66
TRAPPC10-210ENST00000483973 TRIM41Q8WV44 630 aa25.39■■□□□ 1.66
TRAPPC10-210ENST00000483973 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC10-210ENST00000483973 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC10-210ENST00000483973 CFTRP13569 1480 aa25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC10-210ENST00000483973 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC10-210ENST00000483973 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC10-210ENST00000483973 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC10-210ENST00000483973 OSCARQ8IYS5 282 aa25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC10-210ENST00000483973 PRDM2Q13029 1718 aa25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC10-210ENST00000483973 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC10-210ENST00000483973 IFT140Q96RY7 1462 aa24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC10-210ENST00000483973 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC10-210ENST00000483973 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC10-210ENST00000483973 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC10-210ENST00000483973 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC10-210ENST00000483973 TOPBP1Q92547 1522 aa24.79■■□□□ 1.56
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TRAPPC10-210ENST00000483973 ABCC8Q09428 1581 aa24.7■■□□□ 1.54
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TRAPPC10-210ENST00000483973 ARHGEF11O15085 1522 aa24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC10-210ENST00000483973 CHD1O14646 1710 aa24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC10-210ENST00000483973 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC10-210ENST00000483973 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC10-210ENST00000483973 FBLN2P98095 1184 aa24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC10-210ENST00000483973 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC10-210ENST00000483973 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC10-210ENST00000483973 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.45■■□□□ 1.51
TRAPPC10-210ENST00000483973 SOGA1O94964 1423 aa24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC10-210ENST00000483973 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC10-210ENST00000483973 ARAP1Q96P48 1450 aa24.39■■□□□ 1.5
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TRAPPC10-210ENST00000483973 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC10-210ENST00000483973 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC10-210ENST00000483973 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC10-210ENST00000483973 WDR97A6NE52 1622 aa24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC10-210ENST00000483973 CUX1P39880 1505 aa24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC10-210ENST00000483973 SYNJ1O43426 1573 aa24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC10-210ENST00000483973 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC10-210ENST00000483973 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC10-210ENST00000483973 GRIN2BQ13224 1484 aa24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC10-210ENST00000483973 PBRM1Q86U86 1689 aa24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC10-210ENST00000483973 SYNJ2O15056 1496 aa24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC10-210ENST00000483973 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC10-210ENST00000483973 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC10-210ENST00000483973 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC10-210ENST00000483973 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC10-210ENST00000483973 GRIN2AQ12879 1464 aa23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC10-210ENST00000483973 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.89■■□□□ 1.41
TRAPPC10-210ENST00000483973 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC10-210ENST00000483973 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC10-210ENST00000483973 ADAMTS12P58397 1594 aa23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC10-210ENST00000483973 CEP170Q5SW79 1584 aa23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC10-210ENST00000483973 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC10-210ENST00000483973 TOP2BQ02880 1626 aa23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC10-210ENST00000483973 NUP160Q12769 1436 aa23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC10-210ENST00000483973 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC10-210ENST00000483973 SHROOM2Q13796 1616 aa23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC10-210ENST00000483973 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC10-210ENST00000483973 KIF13AQ9H1H9 1805 aa23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC10-210ENST00000483973 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC10-210ENST00000483973 JPH4Q96JJ6 628 aa23.61■■□□□ 1.37
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