RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483972.1

LTB-213, Transcript of lymphotoxin beta, humanhuman

TSL 5

Gene LTB, Length 738 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTB-213ENST00000483972 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.44■■■■■ 5.83
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LTB-213ENST00000483972 NACADO15069 1562 aa44.08■■■■■ 4.65
LTB-213ENST00000483972 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.99■■■■■ 4.63
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LTB-213ENST00000483972 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.16■■■■■ 4.5
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LTB-213ENST00000483972 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.57■■■■■ 4.41
LTB-213ENST00000483972 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.56■■■■■ 4.4
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LTB-213ENST00000483972 NCAPD3P42695 1498 aa40.68■■■■■ 4.1
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LTB-213ENST00000483972 NESP48681 1621 aa40.33■■■■■ 4.05
LTB-213ENST00000483972 HMGXB3Q12766 1538 aa40.32■■■■■ 4.05
LTB-213ENST00000483972 SMARCA4P51532 1647 aa40.28■■■■■ 4.04
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LTB-213ENST00000483972 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.76■■■■□ 3.96
LTB-213ENST00000483972 TRIM41Q8WV44 630 aa39.75■■■■□ 3.95
LTB-213ENST00000483972 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.64■■■■□ 3.94
LTB-213ENST00000483972 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.47■■■■□ 3.91
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LTB-213ENST00000483972 WIZO95785 1651 aa39.16■■■■□ 3.86
LTB-213ENST00000483972 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.05■■■■□ 3.84
LTB-213ENST00000483972 OSCARQ8IYS5 282 aa39.01■■■■□ 3.84
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LTB-213ENST00000483972 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.51■■■■□ 3.76
LTB-213ENST00000483972 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.51■■■■□ 3.76
LTB-213ENST00000483972 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.39■■■■□ 3.74
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LTB-213ENST00000483972 PRDM2Q13029 1718 aa38.38■■■■□ 3.74
LTB-213ENST00000483972 ARHGEF11O15085 1522 aa38.33■■■■□ 3.73
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LTB-213ENST00000483972 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.68■■■■□ 3.62
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LTB-213ENST00000483972 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.48■■■■□ 3.59
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LTB-213ENST00000483972 ADAMTS12P58397 1594 aa36.75■■■■□ 3.47
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LTB-213ENST00000483972 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.58■■■■□ 3.45
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LTB-213ENST00000483972 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36.52■■■■□ 3.44
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LTB-213ENST00000483972 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.49■■■■□ 3.43
LTB-213ENST00000483972 JPH4Q96JJ6 628 aa36.45■■■■□ 3.43
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