RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483774.1

AARSD1-210, Transcript of alanyl-tRNA synthetase domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene AARSD1, Length 928 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AARSD1-210ENST00000483774 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.51■■■□□ 2.79
AARSD1-210ENST00000483774 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.81■■■□□ 2.2
AARSD1-210ENST00000483774 ABCC9O60706 1549 aa28.25■■■□□ 2.11
AARSD1-210ENST00000483774 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.17■■□□□ 1.94
AARSD1-210ENST00000483774 NACADO15069 1562 aa27.14■■□□□ 1.93
AARSD1-210ENST00000483774 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.14■■□□□ 1.93
AARSD1-210ENST00000483774 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
AARSD1-210ENST00000483774 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.99■■□□□ 1.91
AARSD1-210ENST00000483774 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.89■■□□□ 1.89
AARSD1-210ENST00000483774 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.45■■□□□ 1.83
AARSD1-210ENST00000483774 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.44■■□□□ 1.82
AARSD1-210ENST00000483774 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.35■■□□□ 1.81
AARSD1-210ENST00000483774 SCRIBQ14160 1630 aa26.34■■□□□ 1.81
AARSD1-210ENST00000483774 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.06■■□□□ 1.76
AARSD1-210ENST00000483774 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.96■■□□□ 1.75
AARSD1-210ENST00000483774 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.69
AARSD1-210ENST00000483774 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.52■■□□□ 1.68
AARSD1-210ENST00000483774 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.42■■□□□ 1.66
AARSD1-210ENST00000483774 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
AARSD1-210ENST00000483774 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.38■■□□□ 1.65
AARSD1-210ENST00000483774 SMARCA4P51532 1647 aa25.19■■□□□ 1.62
AARSD1-210ENST00000483774 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
AARSD1-210ENST00000483774 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.09■■□□□ 1.61
AARSD1-210ENST00000483774 NCAPD3P42695 1498 aa25.08■■□□□ 1.6
AARSD1-210ENST00000483774 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.06■■□□□ 1.6
AARSD1-210ENST00000483774 SMARCA2P51531 1590 aa25.02■■□□□ 1.6
AARSD1-210ENST00000483774 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.96■■□□□ 1.59
AARSD1-210ENST00000483774 HMGXB3Q12766 1538 aa24.92■■□□□ 1.58
AARSD1-210ENST00000483774 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
AARSD1-210ENST00000483774 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
AARSD1-210ENST00000483774 WIZO95785 1651 aa24.75■■□□□ 1.55
AARSD1-210ENST00000483774 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
AARSD1-210ENST00000483774 NESP48681 1621 aa24.46■■□□□ 1.51
AARSD1-210ENST00000483774 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.35■■□□□ 1.49
AARSD1-210ENST00000483774 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.35■■□□□ 1.49
AARSD1-210ENST00000483774 ERCC6Q03468 1493 aa24.32■■□□□ 1.48
AARSD1-210ENST00000483774 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.26■■□□□ 1.47
AARSD1-210ENST00000483774 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.23■■□□□ 1.47
AARSD1-210ENST00000483774 CFTRP13569 1480 aa24.2■■□□□ 1.47
AARSD1-210ENST00000483774 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
AARSD1-210ENST00000483774 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.08■■□□□ 1.45
AARSD1-210ENST00000483774 CUX2O14529 1486 aa24.07■■□□□ 1.44
AARSD1-210ENST00000483774 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.06■■□□□ 1.44
AARSD1-210ENST00000483774 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
AARSD1-210ENST00000483774 CEP164Q9UPV0 1460 aa24■■□□□ 1.43
AARSD1-210ENST00000483774 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.98■■□□□ 1.43
AARSD1-210ENST00000483774 WDR62O43379 1518 aa23.89■■□□□ 1.41
AARSD1-210ENST00000483774 PRDM2Q13029 1718 aa23.88■■□□□ 1.41
AARSD1-210ENST00000483774 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
AARSD1-210ENST00000483774 TOPBP1Q92547 1522 aa23.67■■□□□ 1.38
AARSD1-210ENST00000483774 ABCC8Q09428 1581 aa23.65■■□□□ 1.38
AARSD1-210ENST00000483774 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.62■■□□□ 1.37
AARSD1-210ENST00000483774 IFT140Q96RY7 1462 aa23.51■■□□□ 1.35
AARSD1-210ENST00000483774 CUX1P39880 1505 aa23.51■■□□□ 1.35
AARSD1-210ENST00000483774 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
AARSD1-210ENST00000483774 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
AARSD1-210ENST00000483774 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.42■■□□□ 1.34
AARSD1-210ENST00000483774 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.39■■□□□ 1.34
AARSD1-210ENST00000483774 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
AARSD1-210ENST00000483774 SOGA1O94964 1423 aa23.39■■□□□ 1.33
AARSD1-210ENST00000483774 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.37■■□□□ 1.33
AARSD1-210ENST00000483774 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.33■■□□□ 1.33
AARSD1-210ENST00000483774 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.3■■□□□ 1.32
AARSD1-210ENST00000483774 SYNJ1O43426 1573 aa23.3■■□□□ 1.32
AARSD1-210ENST00000483774 TOP2BQ02880 1626 aa23.29■■□□□ 1.32
AARSD1-210ENST00000483774 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
AARSD1-210ENST00000483774 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.31
AARSD1-210ENST00000483774 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.26■■□□□ 1.31
AARSD1-210ENST00000483774 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.19■■□□□ 1.3
AARSD1-210ENST00000483774 WDR97A6NE52 1622 aa23.18■■□□□ 1.3
AARSD1-210ENST00000483774 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.11■■□□□ 1.29
AARSD1-210ENST00000483774 GRIN2BQ13224 1484 aa23.1■■□□□ 1.29
AARSD1-210ENST00000483774 OSCARQ8IYS5 282 aa23.09■■□□□ 1.29
AARSD1-210ENST00000483774 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.08■■□□□ 1.28
AARSD1-210ENST00000483774 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.06■■□□□ 1.28
AARSD1-210ENST00000483774 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
AARSD1-210ENST00000483774 FBLN2P98095 1184 aa23■■□□□ 1.27
AARSD1-210ENST00000483774 PBRM1Q86U86 1689 aa22.97■■□□□ 1.27
AARSD1-210ENST00000483774 SYNJ2O15056 1496 aa22.95■■□□□ 1.26
AARSD1-210ENST00000483774 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
AARSD1-210ENST00000483774 CHD1O14646 1710 aa22.94■■□□□ 1.26
AARSD1-210ENST00000483774 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.9■■□□□ 1.26
AARSD1-210ENST00000483774 KIF27Q86VH2 1401 aa22.88■■□□□ 1.25
AARSD1-210ENST00000483774 ADAMTS12P58397 1594 aa22.86■■□□□ 1.25
AARSD1-210ENST00000483774 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.85■■□□□ 1.25
AARSD1-210ENST00000483774 TRIM41Q8WV44 630 aa22.85■■□□□ 1.25
AARSD1-210ENST00000483774 IGF1RP08069 1367 aa22.82■■□□□ 1.24
AARSD1-210ENST00000483774 GRIN2AQ12879 1464 aa22.8■■□□□ 1.24
AARSD1-210ENST00000483774 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.77■■□□□ 1.24
AARSD1-210ENST00000483774 NUP160Q12769 1436 aa22.72■■□□□ 1.23
AARSD1-210ENST00000483774 ARHGEF11O15085 1522 aa22.7■■□□□ 1.22
AARSD1-210ENST00000483774 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.7■■□□□ 1.22
AARSD1-210ENST00000483774 CEP170Q5SW79 1584 aa22.67■■□□□ 1.22
AARSD1-210ENST00000483774 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.67■■□□□ 1.22
AARSD1-210ENST00000483774 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.67■■□□□ 1.22
AARSD1-210ENST00000483774 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.67■■□□□ 1.22
AARSD1-210ENST00000483774 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.66■■□□□ 1.22
AARSD1-210ENST00000483774 CUL7Q14999 1698 aa22.66■■□□□ 1.22
AARSD1-210ENST00000483774 ARAP1Q96P48 1450 aa22.54■■□□□ 1.2
AARSD1-210ENST00000483774 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.7 ms