RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483493.6

CAAP1-202, Transcript of caspase activity and apoptosis inhibitor 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAAP1, Length 1,236 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAAP1-202ENST00000483493 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.13■■■■■ 6.58
CAAP1-202ENST00000483493 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.98■■■■■ 5.59
CAAP1-202ENST00000483493 ABCC9O60706 1549 aa49.6■■■■■ 5.53
CAAP1-202ENST00000483493 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.37■■■■■ 5.17
CAAP1-202ENST00000483493 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.23■■■■■ 5.15
CAAP1-202ENST00000483493 NACADO15069 1562 aa47.2■■■■■ 5.15
CAAP1-202ENST00000483493 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.75■■■■■ 5.07
CAAP1-202ENST00000483493 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.63■■■■■ 5.05
CAAP1-202ENST00000483493 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.37■■■■■ 5.01
CAAP1-202ENST00000483493 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.34■■■■■ 5.01
CAAP1-202ENST00000483493 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.17■■■■■ 4.98
CAAP1-202ENST00000483493 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.11■■■■■ 4.97
CAAP1-202ENST00000483493 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.01■■■■■ 4.96
CAAP1-202ENST00000483493 SCRIBQ14160 1630 aa45.66■■■■■ 4.9
CAAP1-202ENST00000483493 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.42■■■■■ 4.86
CAAP1-202ENST00000483493 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.82■■■■■ 4.77
CAAP1-202ENST00000483493 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.76■■■■■ 4.76
CAAP1-202ENST00000483493 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.61■■■■■ 4.73
CAAP1-202ENST00000483493 NCAPD3P42695 1498 aa43.64■■■■■ 4.58
CAAP1-202ENST00000483493 SMARCA4P51532 1647 aa43.61■■■■■ 4.57
CAAP1-202ENST00000483493 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.59■■■■■ 4.57
CAAP1-202ENST00000483493 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.49■■■■■ 4.55
CAAP1-202ENST00000483493 SMARCA2P51531 1590 aa43.43■■■■■ 4.54
CAAP1-202ENST00000483493 HMGXB3Q12766 1538 aa43.29■■■■■ 4.52
CAAP1-202ENST00000483493 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.28■■■■■ 4.52
CAAP1-202ENST00000483493 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.19■■■■■ 4.5
CAAP1-202ENST00000483493 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.16■■■■■ 4.5
CAAP1-202ENST00000483493 NESP48681 1621 aa42.77■■■■■ 4.44
CAAP1-202ENST00000483493 ERCC6Q03468 1493 aa42.74■■■■■ 4.43
CAAP1-202ENST00000483493 WIZO95785 1651 aa42.71■■■■■ 4.43
CAAP1-202ENST00000483493 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.63■■■■■ 4.41
CAAP1-202ENST00000483493 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.48■■■■■ 4.39
CAAP1-202ENST00000483493 CUX2O14529 1486 aa42.46■■■■■ 4.39
CAAP1-202ENST00000483493 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.37■■■■■ 4.37
CAAP1-202ENST00000483493 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.29■■■■■ 4.36
CAAP1-202ENST00000483493 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.23■■■■■ 4.35
CAAP1-202ENST00000483493 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.14■■■■■ 4.34
CAAP1-202ENST00000483493 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.09■■■■■ 4.33
CAAP1-202ENST00000483493 CFTRP13569 1480 aa41.98■■■■■ 4.31
CAAP1-202ENST00000483493 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.89■■■■■ 4.3
CAAP1-202ENST00000483493 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.87■■■■■ 4.29
CAAP1-202ENST00000483493 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.85■■■■■ 4.29
CAAP1-202ENST00000483493 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.82■■■■■ 4.29
CAAP1-202ENST00000483493 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.81■■■■■ 4.28
CAAP1-202ENST00000483493 WDR62O43379 1518 aa41.73■■■■■ 4.27
CAAP1-202ENST00000483493 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.46■■■■■ 4.23
CAAP1-202ENST00000483493 PRDM2Q13029 1718 aa41.36■■■■■ 4.21
CAAP1-202ENST00000483493 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.2■■■■■ 4.19
CAAP1-202ENST00000483493 TOPBP1Q92547 1522 aa41.1■■■■■ 4.17
CAAP1-202ENST00000483493 ABCC8Q09428 1581 aa41.03■■■■■ 4.16
CAAP1-202ENST00000483493 IFT140Q96RY7 1462 aa40.97■■■■■ 4.15
CAAP1-202ENST00000483493 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.97■■■■■ 4.15
CAAP1-202ENST00000483493 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.88■■■■■ 4.14
CAAP1-202ENST00000483493 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.73■■■■■ 4.11
CAAP1-202ENST00000483493 OSCARQ8IYS5 282 aa40.7■■■■■ 4.11
CAAP1-202ENST00000483493 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.66■■■■■ 4.1
CAAP1-202ENST00000483493 CUX1P39880 1505 aa40.62■■■■■ 4.09
CAAP1-202ENST00000483493 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.61■■■■■ 4.09
CAAP1-202ENST00000483493 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.6■■■■■ 4.09
CAAP1-202ENST00000483493 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.59■■■■■ 4.09
CAAP1-202ENST00000483493 SOGA1O94964 1423 aa40.59■■■■■ 4.09
CAAP1-202ENST00000483493 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.55■■■■■ 4.08
CAAP1-202ENST00000483493 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.46■■■■■ 4.07
CAAP1-202ENST00000483493 TRIM41Q8WV44 630 aa40.29■■■■■ 4.04
CAAP1-202ENST00000483493 FBLN2P98095 1184 aa40.24■■■■■ 4.03
CAAP1-202ENST00000483493 WDR97A6NE52 1622 aa40.24■■■■■ 4.03
CAAP1-202ENST00000483493 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.17■■■■■ 4.02
CAAP1-202ENST00000483493 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.16■■■■■ 4.02
CAAP1-202ENST00000483493 GRIN2BQ13224 1484 aa40.14■■■■■ 4.02
CAAP1-202ENST00000483493 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.12■■■■■ 4.01
CAAP1-202ENST00000483493 CHD1O14646 1710 aa40.11■■■■■ 4.01
CAAP1-202ENST00000483493 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.08■■■■■ 4.01
CAAP1-202ENST00000483493 SYNJ1O43426 1573 aa40.06■■■■■ 4
CAAP1-202ENST00000483493 TOP2BQ02880 1626 aa40.06■■■■■ 4
CAAP1-202ENST00000483493 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.06■■■■■ 4
CAAP1-202ENST00000483493 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.03■■■■■ 4
CAAP1-202ENST00000483493 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.02■■■■■ 4
CAAP1-202ENST00000483493 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.99■■■■□ 3.99
CAAP1-202ENST00000483493 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.99■■■■□ 3.99
CAAP1-202ENST00000483493 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.99■■■■□ 3.99
CAAP1-202ENST00000483493 ARHGEF11O15085 1522 aa39.98■■■■□ 3.99
CAAP1-202ENST00000483493 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.95■■■■□ 3.99
CAAP1-202ENST00000483493 SYNJ2O15056 1496 aa39.94■■■■□ 3.98
CAAP1-202ENST00000483493 PBRM1Q86U86 1689 aa39.88■■■■□ 3.97
CAAP1-202ENST00000483493 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.77■■■■□ 3.96
CAAP1-202ENST00000483493 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.74■■■■□ 3.95
CAAP1-202ENST00000483493 ARAP1Q96P48 1450 aa39.64■■■■□ 3.94
CAAP1-202ENST00000483493 ADAMTS12P58397 1594 aa39.63■■■■□ 3.93
CAAP1-202ENST00000483493 GRIN2AQ12879 1464 aa39.61■■■■□ 3.93
CAAP1-202ENST00000483493 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.6■■■■□ 3.93
CAAP1-202ENST00000483493 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.6■■■■□ 3.93
CAAP1-202ENST00000483493 NUP160Q12769 1436 aa39.48■■■■□ 3.91
CAAP1-202ENST00000483493 CEP170Q5SW79 1584 aa39.42■■■■□ 3.9
CAAP1-202ENST00000483493 KIF27Q86VH2 1401 aa39.37■■■■□ 3.89
CAAP1-202ENST00000483493 IGF1RP08069 1367 aa39.34■■■■□ 3.89
CAAP1-202ENST00000483493 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.23■■■■□ 3.87
CAAP1-202ENST00000483493 SHROOM2Q13796 1616 aa39.15■■■■□ 3.86
CAAP1-202ENST00000483493 JPH4Q96JJ6 628 aa39.14■■■■□ 3.86
CAAP1-202ENST00000483493 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.08■■■■□ 3.85
CAAP1-202ENST00000483493 CUL7Q14999 1698 aa39.07■■■■□ 3.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.4 ms