RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483348.5

SLBP-204, Transcript of stem-loop binding protein, humanhuman

TSL 3

Gene SLBP, Length 1,030 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLBP-204ENST00000483348 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.64■■■■□ 3.94
SLBP-204ENST00000483348 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.31■■■■□ 3.24
SLBP-204ENST00000483348 ABCC9O60706 1549 aa34.76■■■■□ 3.15
SLBP-204ENST00000483348 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.33■■■□□ 2.93
SLBP-204ENST00000483348 NACADO15069 1562 aa33.26■■■□□ 2.92
SLBP-204ENST00000483348 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.15■■■□□ 2.9
SLBP-204ENST00000483348 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.02■■■□□ 2.88
SLBP-204ENST00000483348 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.97■■■□□ 2.87
SLBP-204ENST00000483348 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.8■■■□□ 2.84
SLBP-204ENST00000483348 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.57■■■□□ 2.81
SLBP-204ENST00000483348 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.45■■■□□ 2.79
SLBP-204ENST00000483348 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.37■■■□□ 2.77
SLBP-204ENST00000483348 SCRIBQ14160 1630 aa32.18■■■□□ 2.74
SLBP-204ENST00000483348 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.17■■■□□ 2.74
SLBP-204ENST00000483348 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.99■■■□□ 2.71
SLBP-204ENST00000483348 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.51■■■□□ 2.64
SLBP-204ENST00000483348 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.44■■■□□ 2.62
SLBP-204ENST00000483348 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.26■■■□□ 2.59
SLBP-204ENST00000483348 SMARCA4P51532 1647 aa30.78■■■□□ 2.52
SLBP-204ENST00000483348 NCAPD3P42695 1498 aa30.73■■■□□ 2.51
SLBP-204ENST00000483348 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.71■■■□□ 2.51
SLBP-204ENST00000483348 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.7■■■□□ 2.5
SLBP-204ENST00000483348 SMARCA2P51531 1590 aa30.62■■■□□ 2.49
SLBP-204ENST00000483348 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.54■■■□□ 2.48
SLBP-204ENST00000483348 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.52■■■□□ 2.48
SLBP-204ENST00000483348 HMGXB3Q12766 1538 aa30.52■■■□□ 2.48
SLBP-204ENST00000483348 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.39■■■□□ 2.46
SLBP-204ENST00000483348 WIZO95785 1651 aa30.18■■■□□ 2.42
SLBP-204ENST00000483348 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.13■■■□□ 2.41
SLBP-204ENST00000483348 NESP48681 1621 aa30.03■■■□□ 2.4
SLBP-204ENST00000483348 ERCC6Q03468 1493 aa29.94■■■□□ 2.38
SLBP-204ENST00000483348 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.9■■■□□ 2.38
SLBP-204ENST00000483348 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
SLBP-204ENST00000483348 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.8■■■□□ 2.36
SLBP-204ENST00000483348 CUX2O14529 1486 aa29.74■■■□□ 2.35
SLBP-204ENST00000483348 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.71■■■□□ 2.35
SLBP-204ENST00000483348 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.63■■■□□ 2.33
SLBP-204ENST00000483348 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
SLBP-204ENST00000483348 CFTRP13569 1480 aa29.59■■■□□ 2.33
SLBP-204ENST00000483348 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.53■■■□□ 2.32
SLBP-204ENST00000483348 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.44■■■□□ 2.3
SLBP-204ENST00000483348 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.42■■■□□ 2.3
SLBP-204ENST00000483348 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.41■■■□□ 2.3
SLBP-204ENST00000483348 WDR62O43379 1518 aa29.35■■■□□ 2.29
SLBP-204ENST00000483348 PRDM2Q13029 1718 aa29.28■■■□□ 2.28
SLBP-204ENST00000483348 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
SLBP-204ENST00000483348 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
SLBP-204ENST00000483348 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.13■■■□□ 2.25
SLBP-204ENST00000483348 TOPBP1Q92547 1522 aa28.95■■■□□ 2.23
SLBP-204ENST00000483348 ABCC8Q09428 1581 aa28.93■■■□□ 2.22
SLBP-204ENST00000483348 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.88■■■□□ 2.21
SLBP-204ENST00000483348 IFT140Q96RY7 1462 aa28.81■■■□□ 2.2
SLBP-204ENST00000483348 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
SLBP-204ENST00000483348 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
SLBP-204ENST00000483348 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
SLBP-204ENST00000483348 CUX1P39880 1505 aa28.66■■■□□ 2.18
SLBP-204ENST00000483348 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.59■■■□□ 2.17
SLBP-204ENST00000483348 SOGA1O94964 1423 aa28.58■■■□□ 2.17
SLBP-204ENST00000483348 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.57■■■□□ 2.16
SLBP-204ENST00000483348 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
SLBP-204ENST00000483348 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.53■■■□□ 2.161e-7■■■■■ 30.3
SLBP-204ENST00000483348 OSCARQ8IYS5 282 aa28.49■■■□□ 2.15
SLBP-204ENST00000483348 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
SLBP-204ENST00000483348 WDR97A6NE52 1622 aa28.4■■■□□ 2.14
SLBP-204ENST00000483348 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.39■■■□□ 2.14
SLBP-204ENST00000483348 TOP2BQ02880 1626 aa28.35■■■□□ 2.13
SLBP-204ENST00000483348 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.34■■■□□ 2.13
SLBP-204ENST00000483348 SYNJ1O43426 1573 aa28.33■■■□□ 2.13
SLBP-204ENST00000483348 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.32■■■□□ 2.12
SLBP-204ENST00000483348 GRIN2BQ13224 1484 aa28.26■■■□□ 2.11
SLBP-204ENST00000483348 CHD1O14646 1710 aa28.24■■■□□ 2.11
SLBP-204ENST00000483348 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.23■■■□□ 2.11
SLBP-204ENST00000483348 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.23■■■□□ 2.11
SLBP-204ENST00000483348 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.21■■■□□ 2.11
SLBP-204ENST00000483348 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
SLBP-204ENST00000483348 FBLN2P98095 1184 aa28.19■■■□□ 2.1
SLBP-204ENST00000483348 PBRM1Q86U86 1689 aa28.15■■■□□ 2.1
SLBP-204ENST00000483348 SYNJ2O15056 1496 aa28.1■■■□□ 2.09
SLBP-204ENST00000483348 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
SLBP-204ENST00000483348 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.03■■■□□ 2.08
SLBP-204ENST00000483348 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.03■■■□□ 2.08
SLBP-204ENST00000483348 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.03■■■□□ 2.08
SLBP-204ENST00000483348 ARHGEF11O15085 1522 aa28.01■■■□□ 2.07
SLBP-204ENST00000483348 TRIM41Q8WV44 630 aa28■■■□□ 2.07
SLBP-204ENST00000483348 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.97■■■□□ 2.07
SLBP-204ENST00000483348 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.96■■■□□ 2.07
SLBP-204ENST00000483348 ADAMTS12P58397 1594 aa27.94■■■□□ 2.06
SLBP-204ENST00000483348 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.9■■■□□ 2.06
SLBP-204ENST00000483348 GRIN2AQ12879 1464 aa27.89■■■□□ 2.06
SLBP-204ENST00000483348 NUP160Q12769 1436 aa27.8■■■□□ 2.04
SLBP-204ENST00000483348 KIF27Q86VH2 1401 aa27.8■■■□□ 2.04
SLBP-204ENST00000483348 ARAP1Q96P48 1450 aa27.78■■■□□ 2.04
SLBP-204ENST00000483348 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.77■■■□□ 2.04
SLBP-204ENST00000483348 CEP170Q5SW79 1584 aa27.77■■■□□ 2.04
SLBP-204ENST00000483348 IGF1RP08069 1367 aa27.76■■■□□ 2.03
SLBP-204ENST00000483348 CUL7Q14999 1698 aa27.64■■■□□ 2.02
SLBP-204ENST00000483348 SHROOM2Q13796 1616 aa27.61■■■□□ 2.01
SLBP-204ENST00000483348 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.57■■■□□ 2
SLBP-204ENST00000483348 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.56■■■□□ 2
SLBP-204ENST00000483348 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.54■■■□□ 2
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