RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483335.1

ADAMTSL4-205, Transcript of ADAMTS like 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ADAMTSL4, Length 1,826 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADAMTSL4-205ENST00000483335 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.66■■■■□ 3.62
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ADAMTSL4-205ENST00000483335 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.51■■■□□ 2.64
ADAMTSL4-205ENST00000483335 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.28■■■□□ 2.6
ADAMTSL4-205ENST00000483335 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.1■■■□□ 2.57
ADAMTSL4-205ENST00000483335 NACADO15069 1562 aa31■■■□□ 2.55
ADAMTSL4-205ENST00000483335 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.96■■■□□ 2.55
ADAMTSL4-205ENST00000483335 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.9■■■□□ 2.54
ADAMTSL4-205ENST00000483335 SCRIBQ14160 1630 aa30.43■■■□□ 2.46
ADAMTSL4-205ENST00000483335 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.4■■■□□ 2.46
ADAMTSL4-205ENST00000483335 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.29■■■□□ 2.44
ADAMTSL4-205ENST00000483335 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.06■■■□□ 2.4
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ADAMTSL4-205ENST00000483335 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.36■■■□□ 2.29
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ADAMTSL4-205ENST00000483335 SMARCA4P51532 1647 aa29.11■■■□□ 2.25
ADAMTSL4-205ENST00000483335 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.11■■■□□ 2.25
ADAMTSL4-205ENST00000483335 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
ADAMTSL4-205ENST00000483335 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
ADAMTSL4-205ENST00000483335 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.92■■■□□ 2.22
ADAMTSL4-205ENST00000483335 WIZO95785 1651 aa28.86■■■□□ 2.21
ADAMTSL4-205ENST00000483335 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.82■■■□□ 2.2
ADAMTSL4-205ENST00000483335 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.77■■■□□ 2.2
ADAMTSL4-205ENST00000483335 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
ADAMTSL4-205ENST00000483335 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.76■■■□□ 2.2
ADAMTSL4-205ENST00000483335 SMARCA2P51531 1590 aa28.71■■■□□ 2.19
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ADAMTSL4-205ENST00000483335 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.19■■■□□ 2.1
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ADAMTSL4-205ENST00000483335 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.82■■■□□ 2.04
ADAMTSL4-205ENST00000483335 CFTRP13569 1480 aa27.81■■■□□ 2.04
ADAMTSL4-205ENST00000483335 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.76■■■□□ 2.03
ADAMTSL4-205ENST00000483335 PRDM2Q13029 1718 aa27.71■■■□□ 2.03
ADAMTSL4-205ENST00000483335 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.57■■■□□ 2
ADAMTSL4-205ENST00000483335 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.54■■■□□ 2
ADAMTSL4-205ENST00000483335 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.52■■■□□ 2
ADAMTSL4-205ENST00000483335 ABCC8Q09428 1581 aa27.44■■□□□ 1.98
ADAMTSL4-205ENST00000483335 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.42■■□□□ 1.98
ADAMTSL4-205ENST00000483335 ERCC6Q03468 1493 aa27.41■■□□□ 1.98
ADAMTSL4-205ENST00000483335 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
ADAMTSL4-205ENST00000483335 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
ADAMTSL4-205ENST00000483335 CUX1P39880 1505 aa27.25■■□□□ 1.95
ADAMTSL4-205ENST00000483335 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.25■■□□□ 1.95
ADAMTSL4-205ENST00000483335 SYNJ1O43426 1573 aa27.24■■□□□ 1.95
ADAMTSL4-205ENST00000483335 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.24■■□□□ 1.95
ADAMTSL4-205ENST00000483335 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.19■■□□□ 1.94
ADAMTSL4-205ENST00000483335 TOPBP1Q92547 1522 aa27.18■■□□□ 1.94
ADAMTSL4-205ENST00000483335 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.18■■□□□ 1.94
ADAMTSL4-205ENST00000483335 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.15■■□□□ 1.94
ADAMTSL4-205ENST00000483335 WDR62O43379 1518 aa27.15■■□□□ 1.94
ADAMTSL4-205ENST00000483335 TOP2BQ02880 1626 aa27.14■■□□□ 1.94
ADAMTSL4-205ENST00000483335 TRIM41Q8WV44 630 aa27.06■■□□□ 1.92
ADAMTSL4-205ENST00000483335 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.04■■□□□ 1.92
ADAMTSL4-205ENST00000483335 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
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ADAMTSL4-205ENST00000483335 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.93■■□□□ 1.9
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ADAMTSL4-205ENST00000483335 SOGA1O94964 1423 aa26.87■■□□□ 1.89
ADAMTSL4-205ENST00000483335 WDR97A6NE52 1622 aa26.82■■□□□ 1.88
ADAMTSL4-205ENST00000483335 IFT140Q96RY7 1462 aa26.78■■□□□ 1.88
ADAMTSL4-205ENST00000483335 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.76■■□□□ 1.87
ADAMTSL4-205ENST00000483335 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
ADAMTSL4-205ENST00000483335 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.73■■□□□ 1.87
ADAMTSL4-205ENST00000483335 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
ADAMTSL4-205ENST00000483335 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.66■■□□□ 1.869e-15■■■■□ 26.7
ADAMTSL4-205ENST00000483335 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.65■■□□□ 1.86
ADAMTSL4-205ENST00000483335 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.85
ADAMTSL4-205ENST00000483335 KIF27Q86VH2 1401 aa26.59■■□□□ 1.85
ADAMTSL4-205ENST00000483335 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
ADAMTSL4-205ENST00000483335 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.58■■□□□ 1.85
ADAMTSL4-205ENST00000483335 PBRM1Q86U86 1689 aa26.55■■□□□ 1.84
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ADAMTSL4-205ENST00000483335 GRIN2BQ13224 1484 aa26.45■■□□□ 1.82
ADAMTSL4-205ENST00000483335 EEA1Q15075 1411 aa26.45■■□□□ 1.82
ADAMTSL4-205ENST00000483335 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.43■■□□□ 1.82
ADAMTSL4-205ENST00000483335 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.41■■□□□ 1.82
ADAMTSL4-205ENST00000483335 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.39■■□□□ 1.82
ADAMTSL4-205ENST00000483335 ADAMTS12P58397 1594 aa26.33■■□□□ 1.81
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ADAMTSL4-205ENST00000483335 PRXQ9BXM0 1461 aa26.29■■□□□ 1.8
ADAMTSL4-205ENST00000483335 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.28■■□□□ 1.8
ADAMTSL4-205ENST00000483335 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.25■■□□□ 1.79
ADAMTSL4-205ENST00000483335 KIF21BO75037 1637 aa26.23■■□□□ 1.79
ADAMTSL4-205ENST00000483335 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.23■■□□□ 1.79
ADAMTSL4-205ENST00000483335 CHD1O14646 1710 aa26.23■■□□□ 1.79
ADAMTSL4-205ENST00000483335 SYNJ2O15056 1496 aa26.22■■□□□ 1.79
ADAMTSL4-205ENST00000483335 FBLN2P98095 1184 aa26.19■■□□□ 1.78
ADAMTSL4-205ENST00000483335 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.16■■□□□ 1.78
ADAMTSL4-205ENST00000483335 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
ADAMTSL4-205ENST00000483335 GRIN2AQ12879 1464 aa26.15■■□□□ 1.78
ADAMTSL4-205ENST00000483335 GOLGA3Q08378 1498 aa26.1■■□□□ 1.77
ADAMTSL4-205ENST00000483335 CEP170Q5SW79 1584 aa26.05■■□□□ 1.76
ADAMTSL4-205ENST00000483335 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
ADAMTSL4-205ENST00000483335 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.99■■□□□ 1.75
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