RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483015.1

MIB2-211, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, humanhuman

TSL 3

Gene MIB2, Length 1,058 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIB2-211ENST00000483015 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.75■■■■■ 7.15
MIB2-211ENST00000483015 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.28■■■■■ 6.12
MIB2-211ENST00000483015 ABCC9O60706 1549 aa53.09■■■■■ 6.09
MIB2-211ENST00000483015 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.68■■■■■ 5.7
MIB2-211ENST00000483015 NACADO15069 1562 aa50.36■■■■■ 5.65
MIB2-211ENST00000483015 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.93■■■■■ 5.58
MIB2-211ENST00000483015 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.85■■■■■ 5.57
MIB2-211ENST00000483015 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.79■■■■■ 5.56
MIB2-211ENST00000483015 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.76■■■■■ 5.56
MIB2-211ENST00000483015 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.55■■■■■ 5.52
MIB2-211ENST00000483015 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.4■■■■■ 5.52e-6■□□□□ 11.2
MIB2-211ENST00000483015 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.37■■■■■ 5.49
MIB2-211ENST00000483015 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.07■■■■■ 5.45
MIB2-211ENST00000483015 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.67■■■■■ 5.38
MIB2-211ENST00000483015 SCRIBQ14160 1630 aa48.45■■■■■ 5.35
MIB2-211ENST00000483015 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.01■■■■■ 5.28
MIB2-211ENST00000483015 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.92■■■■■ 5.26
MIB2-211ENST00000483015 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.91■■■■■ 5.26
MIB2-211ENST00000483015 NCAPD3P42695 1498 aa46.48■■■■■ 5.03
MIB2-211ENST00000483015 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.4■■■■■ 5.02
MIB2-211ENST00000483015 SMARCA4P51532 1647 aa46.38■■■■■ 5.01
MIB2-211ENST00000483015 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.26■■■■■ 5
MIB2-211ENST00000483015 SMARCA2P51531 1590 aa46.22■■■■■ 4.99
MIB2-211ENST00000483015 HMGXB3Q12766 1538 aa46.12■■■■■ 4.97
MIB2-211ENST00000483015 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.99■■■■■ 4.95
MIB2-211ENST00000483015 CUX2O14529 1486 aa45.95■■■■■ 4.95
MIB2-211ENST00000483015 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.94■■■■■ 4.94
MIB2-211ENST00000483015 ERCC6Q03468 1493 aa45.93■■■■■ 4.94
MIB2-211ENST00000483015 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.93■■■■■ 4.94
MIB2-211ENST00000483015 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.83■■■■■ 4.93
MIB2-211ENST00000483015 NESP48681 1621 aa45.55■■■■■ 4.88
MIB2-211ENST00000483015 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.43■■■■■ 4.86
MIB2-211ENST00000483015 WIZO95785 1651 aa45.43■■■■■ 4.86
MIB2-211ENST00000483015 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.42■■■■■ 4.86
MIB2-211ENST00000483015 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.21■■■■■ 4.83
MIB2-211ENST00000483015 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.17■■■■■ 4.82
MIB2-211ENST00000483015 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.08■■■■■ 4.81
MIB2-211ENST00000483015 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.05■■■■■ 4.8
MIB2-211ENST00000483015 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45■■■■■ 4.79
MIB2-211ENST00000483015 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.73■■■■■ 4.75
MIB2-211ENST00000483015 WDR62O43379 1518 aa44.62■■■■■ 4.73
MIB2-211ENST00000483015 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.55■■■■■ 4.72
MIB2-211ENST00000483015 CFTRP13569 1480 aa44.54■■■■■ 4.72
MIB2-211ENST00000483015 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.48■■■■■ 4.71
MIB2-211ENST00000483015 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.47■■■■■ 4.71
MIB2-211ENST00000483015 PRDM2Q13029 1718 aa44.21■■■■■ 4.67
MIB2-211ENST00000483015 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.12■■■■■ 4.65
MIB2-211ENST00000483015 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.06■■■■■ 4.64
MIB2-211ENST00000483015 OSCARQ8IYS5 282 aa43.85■■■■■ 4.61
MIB2-211ENST00000483015 TRIM41Q8WV44 630 aa43.76■■■■■ 4.6
MIB2-211ENST00000483015 ABCC8Q09428 1581 aa43.75■■■■■ 4.59
MIB2-211ENST00000483015 IFT140Q96RY7 1462 aa43.7■■■■■ 4.59
MIB2-211ENST00000483015 TOPBP1Q92547 1522 aa43.62■■■■■ 4.57
MIB2-211ENST00000483015 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.56■■■■■ 4.56
MIB2-211ENST00000483015 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.48■■■■■ 4.55
MIB2-211ENST00000483015 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.29■■■■■ 4.52
MIB2-211ENST00000483015 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.22■■■■■ 4.51
MIB2-211ENST00000483015 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.19■■■■■ 4.5
MIB2-211ENST00000483015 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.14■■■■■ 4.5
MIB2-211ENST00000483015 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.14■■■■■ 4.5
MIB2-211ENST00000483015 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.14■■■■■ 4.5
MIB2-211ENST00000483015 CUX1P39880 1505 aa43.13■■■■■ 4.5
MIB2-211ENST00000483015 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.13■■■■■ 4.491e-7■■■■■ 32.3
MIB2-211ENST00000483015 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.06■■■■■ 4.48
MIB2-211ENST00000483015 SOGA1O94964 1423 aa43.04■■■■■ 4.48
MIB2-211ENST00000483015 ARHGEF11O15085 1522 aa43.03■■■■■ 4.48
MIB2-211ENST00000483015 WDR97A6NE52 1622 aa42.96■■■■■ 4.47
MIB2-211ENST00000483015 CHD1O14646 1710 aa42.94■■■■■ 4.47
MIB2-211ENST00000483015 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.94■■■■■ 4.46
MIB2-211ENST00000483015 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.91■■■■■ 4.46
MIB2-211ENST00000483015 FBLN2P98095 1184 aa42.88■■■■■ 4.45
MIB2-211ENST00000483015 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.86■■■■■ 4.45
MIB2-211ENST00000483015 TOP2BQ02880 1626 aa42.82■■■■■ 4.44
MIB2-211ENST00000483015 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.8■■■■■ 4.44
MIB2-211ENST00000483015 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.73■■■■■ 4.43
MIB2-211ENST00000483015 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.7■■■■■ 4.43
MIB2-211ENST00000483015 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.7■■■■■ 4.43
MIB2-211ENST00000483015 SYNJ1O43426 1573 aa42.69■■■■■ 4.43
MIB2-211ENST00000483015 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.69■■■■■ 4.42
MIB2-211ENST00000483015 GRIN2BQ13224 1484 aa42.67■■■■■ 4.42
MIB2-211ENST00000483015 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.64■■■■■ 4.42
MIB2-211ENST00000483015 ARAP1Q96P48 1450 aa42.57■■■■■ 4.41
MIB2-211ENST00000483015 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.55■■■■■ 4.4
MIB2-211ENST00000483015 SYNJ2O15056 1496 aa42.53■■■■■ 4.4
MIB2-211ENST00000483015 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.51■■■■■ 4.4
MIB2-211ENST00000483015 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.49■■■■■ 4.39
MIB2-211ENST00000483015 PBRM1Q86U86 1689 aa42.43■■■■■ 4.38
MIB2-211ENST00000483015 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.27■■■■■ 4.36
MIB2-211ENST00000483015 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.23■■■■■ 4.35
MIB2-211ENST00000483015 ADAMTS12P58397 1594 aa42.11■■■■■ 4.33
MIB2-211ENST00000483015 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.1■■■■■ 4.33
MIB2-211ENST00000483015 GRIN2AQ12879 1464 aa42.09■■■■■ 4.33
MIB2-211ENST00000483015 KIF27Q86VH2 1401 aa42.08■■■■■ 4.33
MIB2-211ENST00000483015 NUP160Q12769 1436 aa41.96■■■■■ 4.31
MIB2-211ENST00000483015 CEP170Q5SW79 1584 aa41.86■■■■■ 4.29
MIB2-211ENST00000483015 CUL7Q14999 1698 aa41.84■■■■■ 4.29
MIB2-211ENST00000483015 IGF1RP08069 1367 aa41.8■■■■■ 4.28
MIB2-211ENST00000483015 SHROOM2Q13796 1616 aa41.77■■■■■ 4.28
MIB2-211ENST00000483015 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.71■■■■■ 4.27
MIB2-211ENST00000483015 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.61■■■■■ 4.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 120.6 ms