RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482904.1

RHBDF1-208, Transcript of rhomboid 5 homolog 1, humanhuman

TSL 3

Gene RHBDF1, Length 556 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF1-208ENST00000482904 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.77■■■■■ 6.84
RHBDF1-208ENST00000482904 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.58■■■■■ 5.85
RHBDF1-208ENST00000482904 ABCC9O60706 1549 aa50.94■■■■■ 5.75
RHBDF1-208ENST00000482904 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.79■■■■■ 5.4
RHBDF1-208ENST00000482904 NACADO15069 1562 aa48.6■■■■■ 5.37
RHBDF1-208ENST00000482904 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.52■■■■■ 5.36
RHBDF1-208ENST00000482904 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.11■■■■■ 5.29
RHBDF1-208ENST00000482904 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.06■■■■■ 5.28
RHBDF1-208ENST00000482904 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.76■■■■■ 5.24
RHBDF1-208ENST00000482904 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.58■■■■■ 5.21
RHBDF1-208ENST00000482904 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.49■■■■■ 5.19
RHBDF1-208ENST00000482904 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.24■■■■■ 5.15
RHBDF1-208ENST00000482904 SCRIBQ14160 1630 aa47.09■■■■■ 5.13
RHBDF1-208ENST00000482904 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47■■■■■ 5.11
RHBDF1-208ENST00000482904 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.78■■■■■ 5.08
RHBDF1-208ENST00000482904 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.1■■■■■ 4.97
RHBDF1-208ENST00000482904 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.02■■■■■ 4.96
RHBDF1-208ENST00000482904 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.81■■■■■ 4.92
RHBDF1-208ENST00000482904 SMARCA4P51532 1647 aa44.95■■■■■ 4.79
RHBDF1-208ENST00000482904 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.86■■■■■ 4.77
RHBDF1-208ENST00000482904 NCAPD3P42695 1498 aa44.81■■■■■ 4.76
RHBDF1-208ENST00000482904 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.8■■■■■ 4.76
RHBDF1-208ENST00000482904 SMARCA2P51531 1590 aa44.76■■■■■ 4.76
RHBDF1-208ENST00000482904 HMGXB3Q12766 1538 aa44.6■■■■■ 4.73
RHBDF1-208ENST00000482904 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.52■■■■■ 4.72
RHBDF1-208ENST00000482904 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.47■■■■■ 4.71
RHBDF1-208ENST00000482904 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.47■■■■■ 4.71
RHBDF1-208ENST00000482904 WIZO95785 1651 aa44.02■■■■■ 4.64
RHBDF1-208ENST00000482904 ERCC6Q03468 1493 aa44■■■■■ 4.63
RHBDF1-208ENST00000482904 NESP48681 1621 aa43.91■■■■■ 4.62
RHBDF1-208ENST00000482904 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.84■■■■■ 4.61
RHBDF1-208ENST00000482904 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.75■■■■■ 4.59
RHBDF1-208ENST00000482904 CUX2O14529 1486 aa43.62■■■■■ 4.57
RHBDF1-208ENST00000482904 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.58■■■■■ 4.57
RHBDF1-208ENST00000482904 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.51■■■■■ 4.56
RHBDF1-208ENST00000482904 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.48■■■■■ 4.55
RHBDF1-208ENST00000482904 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.38■■■■■ 4.54
RHBDF1-208ENST00000482904 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.36■■■■■ 4.53
RHBDF1-208ENST00000482904 CFTRP13569 1480 aa43.15■■■■■ 4.5
RHBDF1-208ENST00000482904 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.08■■■■■ 4.49
RHBDF1-208ENST00000482904 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.07■■■■■ 4.49
RHBDF1-208ENST00000482904 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.06■■■■■ 4.48
RHBDF1-208ENST00000482904 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.01■■■■■ 4.48
RHBDF1-208ENST00000482904 WDR62O43379 1518 aa42.93■■■■■ 4.46
RHBDF1-208ENST00000482904 PRDM2Q13029 1718 aa42.79■■■■■ 4.44
RHBDF1-208ENST00000482904 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.7■■■■■ 4.43
RHBDF1-208ENST00000482904 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.62■■■■■ 4.41
RHBDF1-208ENST00000482904 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.47■■■■■ 4.39
RHBDF1-208ENST00000482904 TOPBP1Q92547 1522 aa42.3■■■■■ 4.36
RHBDF1-208ENST00000482904 ABCC8Q09428 1581 aa42.26■■■■■ 4.36
RHBDF1-208ENST00000482904 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.22■■■■■ 4.35
RHBDF1-208ENST00000482904 IFT140Q96RY7 1462 aa42.16■■■■■ 4.34
RHBDF1-208ENST00000482904 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.98■■■■■ 4.31
RHBDF1-208ENST00000482904 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.92■■■■■ 4.3
RHBDF1-208ENST00000482904 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.84■■■■■ 4.29
RHBDF1-208ENST00000482904 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.84■■■■■ 4.29
RHBDF1-208ENST00000482904 CUX1P39880 1505 aa41.8■■■■■ 4.28
RHBDF1-208ENST00000482904 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.77■■■■■ 4.28
RHBDF1-208ENST00000482904 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.73■■■■■ 4.27
RHBDF1-208ENST00000482904 SOGA1O94964 1423 aa41.72■■■■■ 4.27
RHBDF1-208ENST00000482904 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.69■■■■■ 4.26
RHBDF1-208ENST00000482904 OSCARQ8IYS5 282 aa41.69■■■■■ 4.26
RHBDF1-208ENST00000482904 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.55■■■■■ 4.24
RHBDF1-208ENST00000482904 WDR97A6NE52 1622 aa41.51■■■■■ 4.24
RHBDF1-208ENST00000482904 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.41■■■■■ 4.22
RHBDF1-208ENST00000482904 CHD1O14646 1710 aa41.36■■■■■ 4.21
RHBDF1-208ENST00000482904 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.34■■■■■ 4.21
RHBDF1-208ENST00000482904 FBLN2P98095 1184 aa41.34■■■■■ 4.21
RHBDF1-208ENST00000482904 TOP2BQ02880 1626 aa41.33■■■■■ 4.21
RHBDF1-208ENST00000482904 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.33■■■■■ 4.21
RHBDF1-208ENST00000482904 GRIN2BQ13224 1484 aa41.32■■■■■ 4.2
RHBDF1-208ENST00000482904 SYNJ1O43426 1573 aa41.32■■■■■ 4.2
RHBDF1-208ENST00000482904 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.31■■■■■ 4.2
RHBDF1-208ENST00000482904 TRIM41Q8WV44 630 aa41.26■■■■■ 4.2
RHBDF1-208ENST00000482904 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.25■■■■■ 4.19
RHBDF1-208ENST00000482904 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.25■■■■■ 4.19
RHBDF1-208ENST00000482904 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.2■■■■■ 4.19
RHBDF1-208ENST00000482904 PBRM1Q86U86 1689 aa41.2■■■■■ 4.19
RHBDF1-208ENST00000482904 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.12■■■■■ 4.17
RHBDF1-208ENST00000482904 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.11■■■■■ 4.17
RHBDF1-208ENST00000482904 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.11■■■■■ 4.17
RHBDF1-208ENST00000482904 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.11■■■■■ 4.17
RHBDF1-208ENST00000482904 SYNJ2O15056 1496 aa41.09■■■■■ 4.17
RHBDF1-208ENST00000482904 ARHGEF11O15085 1522 aa41.08■■■■■ 4.17
RHBDF1-208ENST00000482904 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.9■■■■■ 4.14
RHBDF1-208ENST00000482904 ADAMTS12P58397 1594 aa40.87■■■■■ 4.13
RHBDF1-208ENST00000482904 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.82■■■■■ 4.12
RHBDF1-208ENST00000482904 GRIN2AQ12879 1464 aa40.79■■■■■ 4.12
RHBDF1-208ENST00000482904 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.76■■■■■ 4.11
RHBDF1-208ENST00000482904 ARAP1Q96P48 1450 aa40.7■■■■■ 4.11
RHBDF1-208ENST00000482904 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.69■■■■■ 4.1
RHBDF1-208ENST00000482904 CEP170Q5SW79 1584 aa40.59■■■■■ 4.09
RHBDF1-208ENST00000482904 NUP160Q12769 1436 aa40.59■■■■■ 4.09
RHBDF1-208ENST00000482904 KIF27Q86VH2 1401 aa40.59■■■■■ 4.09
RHBDF1-208ENST00000482904 CUL7Q14999 1698 aa40.39■■■■■ 4.06
RHBDF1-208ENST00000482904 IGF1RP08069 1367 aa40.38■■■■■ 4.06
RHBDF1-208ENST00000482904 SHROOM2Q13796 1616 aa40.31■■■■■ 4.04
RHBDF1-208ENST00000482904 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.3■■■■■ 4.04
RHBDF1-208ENST00000482904 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.28■■■■■ 4.04
RHBDF1-208ENST00000482904 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.19■■■■■ 4.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.6 ms