RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482716.5

CNNM4-202, Transcript of cyclin and CBS domain divalent metal cation transport mediator 4, humanhuman

TSL 3

Gene CNNM4, Length 547 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM4-202ENST00000482716 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.5■■■□□ 2.31
CNNM4-202ENST00000482716 ABCC9O60706 1549 aa27.72■■■□□ 2.03
CNNM4-202ENST00000482716 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.81■■□□□ 1.88
CNNM4-202ENST00000482716 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.79■■□□□ 1.88
CNNM4-202ENST00000482716 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.9■■□□□ 1.74
CNNM4-202ENST00000482716 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.7■■□□□ 1.7
CNNM4-202ENST00000482716 NACADO15069 1562 aa25.5■■□□□ 1.67
CNNM4-202ENST00000482716 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.48■■□□□ 1.67
CNNM4-202ENST00000482716 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.3■■□□□ 1.64
CNNM4-202ENST00000482716 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.3■■□□□ 1.64
CNNM4-202ENST00000482716 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.07■■□□□ 1.6
CNNM4-202ENST00000482716 CECR2Q9BXF3 1484 aa25■■□□□ 1.59
CNNM4-202ENST00000482716 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.97■■□□□ 1.59
CNNM4-202ENST00000482716 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.81■■□□□ 1.56
CNNM4-202ENST00000482716 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
CNNM4-202ENST00000482716 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.64■■□□□ 1.54
CNNM4-202ENST00000482716 SCRIBQ14160 1630 aa24.49■■□□□ 1.51
CNNM4-202ENST00000482716 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
CNNM4-202ENST00000482716 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.24■■□□□ 1.47
CNNM4-202ENST00000482716 CUX2O14529 1486 aa24.1■■□□□ 1.45
CNNM4-202ENST00000482716 ERCC6Q03468 1493 aa23.9■■□□□ 1.42
CNNM4-202ENST00000482716 TRIM41Q8WV44 630 aa23.71■■□□□ 1.39
CNNM4-202ENST00000482716 NESP48681 1621 aa23.62■■□□□ 1.37
CNNM4-202ENST00000482716 NCAPD3P42695 1498 aa23.57■■□□□ 1.36
CNNM4-202ENST00000482716 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
CNNM4-202ENST00000482716 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.43■■□□□ 1.34
CNNM4-202ENST00000482716 SMARCA2P51531 1590 aa23.32■■□□□ 1.32
CNNM4-202ENST00000482716 HMGXB3Q12766 1538 aa23.32■■□□□ 1.32
CNNM4-202ENST00000482716 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.26■■□□□ 1.31
CNNM4-202ENST00000482716 SMARCA4P51532 1647 aa23.22■■□□□ 1.31
CNNM4-202ENST00000482716 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.17■■□□□ 1.3
CNNM4-202ENST00000482716 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
CNNM4-202ENST00000482716 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.03■■□□□ 1.28
CNNM4-202ENST00000482716 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
CNNM4-202ENST00000482716 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.94■■□□□ 1.26
CNNM4-202ENST00000482716 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.94■■□□□ 1.26
CNNM4-202ENST00000482716 WDR62O43379 1518 aa22.92■■□□□ 1.26
CNNM4-202ENST00000482716 OSCARQ8IYS5 282 aa22.86■■□□□ 1.25
CNNM4-202ENST00000482716 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.82■■□□□ 1.24
CNNM4-202ENST00000482716 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.8■■□□□ 1.24
CNNM4-202ENST00000482716 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.78■■□□□ 1.24
CNNM4-202ENST00000482716 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.78■■□□□ 1.24
CNNM4-202ENST00000482716 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.78■■□□□ 1.24
CNNM4-202ENST00000482716 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.68■■□□□ 1.22
CNNM4-202ENST00000482716 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.6■■□□□ 1.21
CNNM4-202ENST00000482716 ARHGEF11O15085 1522 aa22.58■■□□□ 1.21
CNNM4-202ENST00000482716 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
CNNM4-202ENST00000482716 WIZO95785 1651 aa22.51■■□□□ 1.19
CNNM4-202ENST00000482716 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.47■■□□□ 1.19
CNNM4-202ENST00000482716 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
CNNM4-202ENST00000482716 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
CNNM4-202ENST00000482716 CFTRP13569 1480 aa22.4■■□□□ 1.18
CNNM4-202ENST00000482716 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
CNNM4-202ENST00000482716 ARAP1Q96P48 1450 aa22.33■■□□□ 1.16
CNNM4-202ENST00000482716 CHD1O14646 1710 aa22.23■■□□□ 1.15
CNNM4-202ENST00000482716 IFT140Q96RY7 1462 aa22.23■■□□□ 1.15
CNNM4-202ENST00000482716 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
CNNM4-202ENST00000482716 PRDM2Q13029 1718 aa22.14■■□□□ 1.13
CNNM4-202ENST00000482716 TOPBP1Q92547 1522 aa22.1■■□□□ 1.13
CNNM4-202ENST00000482716 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.12
CNNM4-202ENST00000482716 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CNNM4-202ENST00000482716 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
CNNM4-202ENST00000482716 FBLN2P98095 1184 aa22.05■■□□□ 1.12
CNNM4-202ENST00000482716 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
CNNM4-202ENST00000482716 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.91■■□□□ 1.1
CNNM4-202ENST00000482716 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.91■■□□□ 1.1
CNNM4-202ENST00000482716 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.87■■□□□ 1.09
CNNM4-202ENST00000482716 ABCC8Q09428 1581 aa21.86■■□□□ 1.09
CNNM4-202ENST00000482716 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
CNNM4-202ENST00000482716 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.82■■□□□ 1.08
CNNM4-202ENST00000482716 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.81■■□□□ 1.08
CNNM4-202ENST00000482716 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
CNNM4-202ENST00000482716 SYNJ1O43426 1573 aa21.75■■□□□ 1.07
CNNM4-202ENST00000482716 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.71■■□□□ 1.07
CNNM4-202ENST00000482716 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
CNNM4-202ENST00000482716 SOGA1O94964 1423 aa21.67■■□□□ 1.06
CNNM4-202ENST00000482716 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
CNNM4-202ENST00000482716 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.61■■□□□ 1.05
CNNM4-202ENST00000482716 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
CNNM4-202ENST00000482716 SYNJ2O15056 1496 aa21.59■■□□□ 1.05
CNNM4-202ENST00000482716 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.58■■□□□ 1.04
CNNM4-202ENST00000482716 WDR97A6NE52 1622 aa21.55■■□□□ 1.04
CNNM4-202ENST00000482716 GRIN2BQ13224 1484 aa21.55■■□□□ 1.04
CNNM4-202ENST00000482716 KIF13AQ9H1H9 1805 aa21.54■■□□□ 1.04
CNNM4-202ENST00000482716 PBRM1Q86U86 1689 aa21.5■■□□□ 1.03
CNNM4-202ENST00000482716 CUX1P39880 1505 aa21.46■■□□□ 1.03
CNNM4-202ENST00000482716 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa21.42■■□□□ 1.02
CNNM4-202ENST00000482716 CEP170Q5SW79 1584 aa21.4■■□□□ 1.02
CNNM4-202ENST00000482716 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.33■■□□□ 1
CNNM4-202ENST00000482716 GRIN2AQ12879 1464 aa21.32■■□□□ 1
CNNM4-202ENST00000482716 SHROOM2Q13796 1616 aa21.29■■□□□ 1
CNNM4-202ENST00000482716 NUP160Q12769 1436 aa21.27■■□□□ 1
CNNM4-202ENST00000482716 FAM69CQ0P6D2 419 aa21.25■□□□□ 0.99
CNNM4-202ENST00000482716 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.24■□□□□ 0.99
CNNM4-202ENST00000482716 ADAMTS12P58397 1594 aa21.23■□□□□ 0.99
CNNM4-202ENST00000482716 ABCC10Q5T3U5 1492 aa21.22■□□□□ 0.99
CNNM4-202ENST00000482716 KDM6BO15054 1643 aa21.2■□□□□ 0.98
CNNM4-202ENST00000482716 DIP2BQ9P265 1576 aa21.19■□□□□ 0.98
CNNM4-202ENST00000482716 TSPOAP1O95153 1857 aa21.16■□□□□ 0.98
CNNM4-202ENST00000482716 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.98
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