RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482438.2

QARS-218, Transcript of glutaminyl-tRNA synthetase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene QARS, Length 600 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
QARS-218ENST00000482438 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.13■■■□□ 2.09
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QARS-218ENST00000482438 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23.77■■□□□ 1.4
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QARS-218ENST00000482438 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
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QARS-218ENST00000482438 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa22.79■■□□□ 1.24
QARS-218ENST00000482438 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.7■■□□□ 1.22
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QARS-218ENST00000482438 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.57■■□□□ 1.2
QARS-218ENST00000482438 SMARCA4P51532 1647 aa21.96■■□□□ 1.11
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QARS-218ENST00000482438 SMARCA2P51531 1590 aa21.82■■□□□ 1.08
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QARS-218ENST00000482438 NESP48681 1621 aa21.66■■□□□ 1.06
QARS-218ENST00000482438 ERCC6Q03468 1493 aa21.65■■□□□ 1.06
QARS-218ENST00000482438 WIZO95785 1651 aa21.54■■□□□ 1.04
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QARS-218ENST00000482438 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.41■■□□□ 1.02
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QARS-218ENST00000482438 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
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QARS-218ENST00000482438 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.07■□□□□ 0.96
QARS-218ENST00000482438 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.07■□□□□ 0.96
QARS-218ENST00000482438 WDR62O43379 1518 aa21.06■□□□□ 0.96
QARS-218ENST00000482438 CFTRP13569 1480 aa21.04■□□□□ 0.96
QARS-218ENST00000482438 PRDM2Q13029 1718 aa20.97■□□□□ 0.95
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QARS-218ENST00000482438 IFT140Q96RY7 1462 aa20.61■□□□□ 0.89
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QARS-218ENST00000482438 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.37■□□□□ 0.85
QARS-218ENST00000482438 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.37■□□□□ 0.85
QARS-218ENST00000482438 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.37■□□□□ 0.85
QARS-218ENST00000482438 SOGA1O94964 1423 aa20.36■□□□□ 0.85
QARS-218ENST00000482438 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
QARS-218ENST00000482438 FBLN2P98095 1184 aa20.31■□□□□ 0.84
QARS-218ENST00000482438 WDR97A6NE52 1622 aa20.28■□□□□ 0.84
QARS-218ENST00000482438 ARHGEF11O15085 1522 aa20.27■□□□□ 0.84
QARS-218ENST00000482438 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.26■□□□□ 0.83
QARS-218ENST00000482438 PBRM1Q86U86 1689 aa20.22■□□□□ 0.83
QARS-218ENST00000482438 GRIN2BQ13224 1484 aa20.17■□□□□ 0.82
QARS-218ENST00000482438 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.14■□□□□ 0.81
QARS-218ENST00000482438 SYNJ1O43426 1573 aa20.14■□□□□ 0.81
QARS-218ENST00000482438 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.13■□□□□ 0.81
QARS-218ENST00000482438 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
QARS-218ENST00000482438 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.13■□□□□ 0.81
QARS-218ENST00000482438 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.12■□□□□ 0.81
QARS-218ENST00000482438 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
QARS-218ENST00000482438 TOP2BQ02880 1626 aa20.1■□□□□ 0.81
QARS-218ENST00000482438 CYB5RLQ6IPT4 315 aa20.1■□□□□ 0.81
QARS-218ENST00000482438 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.1■□□□□ 0.81
QARS-218ENST00000482438 ARAP1Q96P48 1450 aa20.09■□□□□ 0.81
QARS-218ENST00000482438 SYNJ2O15056 1496 aa20.08■□□□□ 0.81
QARS-218ENST00000482438 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.08■□□□□ 0.8
QARS-218ENST00000482438 ADAMTS12P58397 1594 aa19.99■□□□□ 0.79
QARS-218ENST00000482438 GRIN2AQ12879 1464 aa19.92■□□□□ 0.78
QARS-218ENST00000482438 CEP170Q5SW79 1584 aa19.91■□□□□ 0.78
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QARS-218ENST00000482438 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa19.71■□□□□ 0.75
QARS-218ENST00000482438 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP19.67■□□□□ 0.74
QARS-218ENST00000482438 KIF27Q86VH2 1401 aa19.66■□□□□ 0.74
QARS-218ENST00000482438 CUL7Q14999 1698 aa19.65■□□□□ 0.74
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