RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482429.1

LTB-212, Transcript of lymphotoxin beta, humanhuman

TSL 2

Gene LTB, Length 1,388 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTB-212ENST00000482429 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.3■■■■■ 5.96
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LTB-212ENST00000482429 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.12■■■■■ 4.81
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LTB-212ENST00000482429 NACADO15069 1562 aa44.72■■■■■ 4.75
LTB-212ENST00000482429 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.22■■■■■ 4.67
LTB-212ENST00000482429 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.15■■■■■ 4.66
LTB-212ENST00000482429 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.09■■■■■ 4.65
LTB-212ENST00000482429 MYO15BQ96JP2 1530 aa44■■■■■ 4.63
LTB-212ENST00000482429 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.81■■■■■ 4.6
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LTB-212ENST00000482429 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.91■■■■■ 4.46
LTB-212ENST00000482429 SCRIBQ14160 1630 aa42.86■■■■■ 4.45
LTB-212ENST00000482429 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.76■■■■■ 4.44
LTB-212ENST00000482429 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.74■■■■■ 4.27
LTB-212ENST00000482429 NCAPD3P42695 1498 aa41.28■■■■■ 4.2
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LTB-212ENST00000482429 ERCC6Q03468 1493 aa41.1■■■■■ 4.17
LTB-212ENST00000482429 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.05■■■■■ 4.16
LTB-212ENST00000482429 SMARCA2P51531 1590 aa40.95■■■■■ 4.15
LTB-212ENST00000482429 HMGXB3Q12766 1538 aa40.93■■■■■ 4.14
LTB-212ENST00000482429 SMARCA4P51532 1647 aa40.9■■■■■ 4.14
LTB-212ENST00000482429 NESP48681 1621 aa40.7■■■■■ 4.11
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LTB-212ENST00000482429 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.44■■■■■ 4.06
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LTB-212ENST00000482429 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.26■■■■■ 4.04
LTB-212ENST00000482429 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.2■■■■■ 4.03
LTB-212ENST00000482429 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.19■■■■■ 4.02
LTB-212ENST00000482429 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.97■■■■□ 3.99
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LTB-212ENST00000482429 WDR62O43379 1518 aa39.79■■■■□ 3.96
LTB-212ENST00000482429 WIZO95785 1651 aa39.75■■■■□ 3.95
LTB-212ENST00000482429 TRIM41Q8WV44 630 aa39.61■■■■□ 3.93
LTB-212ENST00000482429 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.6■■■■□ 3.93
LTB-212ENST00000482429 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.51■■■■□ 3.92
LTB-212ENST00000482429 CFTRP13569 1480 aa39.44■■■■□ 3.9
LTB-212ENST00000482429 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.27■■■■□ 3.88
LTB-212ENST00000482429 OSCARQ8IYS5 282 aa39.26■■■■□ 3.88
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LTB-212ENST00000482429 IFT140Q96RY7 1462 aa38.84■■■■□ 3.81
LTB-212ENST00000482429 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.79■■■■□ 3.8
LTB-212ENST00000482429 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.79■■■■□ 3.8
LTB-212ENST00000482429 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.79■■■■□ 3.8
LTB-212ENST00000482429 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.79■■■■□ 3.8
LTB-212ENST00000482429 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.78■■■■□ 3.8
LTB-212ENST00000482429 TOPBP1Q92547 1522 aa38.71■■■■□ 3.79
LTB-212ENST00000482429 ABCC8Q09428 1581 aa38.66■■■■□ 3.78
LTB-212ENST00000482429 ARHGEF11O15085 1522 aa38.62■■■■□ 3.77
LTB-212ENST00000482429 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.57■■■■□ 3.76
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LTB-212ENST00000482429 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.42■■■■□ 3.74
LTB-212ENST00000482429 CHD1O14646 1710 aa38.37■■■■□ 3.73
LTB-212ENST00000482429 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.37■■■■□ 3.73
LTB-212ENST00000482429 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.31■■■■□ 3.72
LTB-212ENST00000482429 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.28■■■■□ 3.72
LTB-212ENST00000482429 ARAP1Q96P48 1450 aa38.2■■■■□ 3.71
LTB-212ENST00000482429 FBLN2P98095 1184 aa38.18■■■■□ 3.7
LTB-212ENST00000482429 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.11■■■■□ 3.69
LTB-212ENST00000482429 SOGA1O94964 1423 aa38.09■■■■□ 3.69
LTB-212ENST00000482429 WDR97A6NE52 1622 aa38.07■■■■□ 3.68
LTB-212ENST00000482429 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.05■■■■□ 3.68
LTB-212ENST00000482429 TRHP20396 242 aaPredicted RBP38.03■■■■□ 3.68
LTB-212ENST00000482429 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.98■■■■□ 3.67
LTB-212ENST00000482429 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.96■■■■□ 3.67
LTB-212ENST00000482429 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.94■■■■□ 3.66
LTB-212ENST00000482429 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.91■■■■□ 3.66
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LTB-212ENST00000482429 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.86■■■■□ 3.65
LTB-212ENST00000482429 GRIN2BQ13224 1484 aa37.84■■■■□ 3.65
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LTB-212ENST00000482429 PBRM1Q86U86 1689 aa37.65■■■■□ 3.62
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LTB-212ENST00000482429 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.55■■■■□ 3.6
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LTB-212ENST00000482429 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.29■■■■□ 3.56
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LTB-212ENST00000482429 ADAMTS12P58397 1594 aa37.26■■■■□ 3.56
LTB-212ENST00000482429 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.26■■■■□ 3.56
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LTB-212ENST00000482429 CEP170Q5SW79 1584 aa37.22■■■■□ 3.55
LTB-212ENST00000482429 SHROOM2Q13796 1616 aa37.16■■■■□ 3.54
LTB-212ENST00000482429 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.16■■■■□ 3.54
LTB-212ENST00000482429 TOP2BQ02880 1626 aa37.16■■■■□ 3.54
LTB-212ENST00000482429 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.15■■■■□ 3.54
LTB-212ENST00000482429 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.08■■■■□ 3.53
LTB-212ENST00000482429 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.07■■■■□ 3.53
LTB-212ENST00000482429 KIF13AQ9H1H9 1805 aa36.91■■■■□ 3.5
LTB-212ENST00000482429 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36.9■■■■□ 3.5
LTB-212ENST00000482429 JPH4Q96JJ6 628 aa36.85■■■■□ 3.49
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