RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482015.5

UPP1-211, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene UPP1, Length 861 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-211ENST00000482015 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.4■■■■■ 5.02
UPP1-211ENST00000482015 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.36■■■■■ 4.21
UPP1-211ENST00000482015 ABCC9O60706 1549 aa41.13■■■■■ 4.18
UPP1-211ENST00000482015 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.25■■■■□ 3.87
UPP1-211ENST00000482015 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.14■■■■□ 3.86
UPP1-211ENST00000482015 NACADO15069 1562 aa39.07■■■■□ 3.84
UPP1-211ENST00000482015 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.63■■■■□ 3.78
UPP1-211ENST00000482015 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.54■■■■□ 3.76
UPP1-211ENST00000482015 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.43■■■■□ 3.74
UPP1-211ENST00000482015 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.3■■■■□ 3.72
UPP1-211ENST00000482015 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.3■■■■□ 3.72
UPP1-211ENST00000482015 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.3■■■■□ 3.72
UPP1-211ENST00000482015 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.11■■■■□ 3.69
UPP1-211ENST00000482015 SCRIBQ14160 1630 aa37.82■■■■□ 3.64
UPP1-211ENST00000482015 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.57■■■■□ 3.6
UPP1-211ENST00000482015 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.14■■■■□ 3.54
UPP1-211ENST00000482015 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.13■■■■□ 3.53
UPP1-211ENST00000482015 CECR2Q9BXF3 1484 aa37■■■■□ 3.51
UPP1-211ENST00000482015 NCAPD3P42695 1498 aa36.11■■■■□ 3.37
UPP1-211ENST00000482015 SMARCA4P51532 1647 aa36.08■■■■□ 3.37
UPP1-211ENST00000482015 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.07■■■■□ 3.37
UPP1-211ENST00000482015 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.97■■■■□ 3.35
UPP1-211ENST00000482015 SMARCA2P51531 1590 aa35.93■■■■□ 3.34
UPP1-211ENST00000482015 HMGXB3Q12766 1538 aa35.83■■■■□ 3.33
UPP1-211ENST00000482015 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.79■■■■□ 3.32
UPP1-211ENST00000482015 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.73■■■■□ 3.31
UPP1-211ENST00000482015 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.71■■■■□ 3.31
UPP1-211ENST00000482015 ERCC6Q03468 1493 aa35.47■■■■□ 3.27
UPP1-211ENST00000482015 NESP48681 1621 aa35.46■■■■□ 3.27
UPP1-211ENST00000482015 WIZO95785 1651 aa35.35■■■■□ 3.25
UPP1-211ENST00000482015 CUX2O14529 1486 aa35.22■■■■□ 3.23
UPP1-211ENST00000482015 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.21■■■■□ 3.23
UPP1-211ENST00000482015 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.18■■■■□ 3.22
UPP1-211ENST00000482015 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.06■■■■□ 3.2
UPP1-211ENST00000482015 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.02■■■■□ 3.2
UPP1-211ENST00000482015 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.93■■■■□ 3.18
UPP1-211ENST00000482015 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.92■■■■□ 3.18
UPP1-211ENST00000482015 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.91■■■■□ 3.18
UPP1-211ENST00000482015 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.83■■■■□ 3.17
UPP1-211ENST00000482015 CFTRP13569 1480 aa34.72■■■■□ 3.15
UPP1-211ENST00000482015 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.68■■■■□ 3.14
UPP1-211ENST00000482015 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.65■■■■□ 3.14
UPP1-211ENST00000482015 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.63■■■■□ 3.13
UPP1-211ENST00000482015 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.58■■■■□ 3.13
UPP1-211ENST00000482015 WDR62O43379 1518 aa34.56■■■■□ 3.12
UPP1-211ENST00000482015 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.34■■■■□ 3.09
UPP1-211ENST00000482015 PRDM2Q13029 1718 aa34.26■■■■□ 3.07
UPP1-211ENST00000482015 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.04■■■■□ 3.04
UPP1-211ENST00000482015 TOPBP1Q92547 1522 aa34.03■■■■□ 3.04
UPP1-211ENST00000482015 ABCC8Q09428 1581 aa33.94■■■■□ 3.02
UPP1-211ENST00000482015 IFT140Q96RY7 1462 aa33.92■■■■□ 3.02
UPP1-211ENST00000482015 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.9■■■■□ 3.02
UPP1-211ENST00000482015 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.87■■■■□ 3.01
UPP1-211ENST00000482015 OSCARQ8IYS5 282 aa33.76■■■□□ 2.99
UPP1-211ENST00000482015 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.71■■■□□ 2.99
UPP1-211ENST00000482015 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.66■■■□□ 2.98
UPP1-211ENST00000482015 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.64■■■□□ 2.98
UPP1-211ENST00000482015 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.63■■■□□ 2.97
UPP1-211ENST00000482015 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.63■■■□□ 2.97
UPP1-211ENST00000482015 CUX1P39880 1505 aa33.59■■■□□ 2.97
UPP1-211ENST00000482015 SOGA1O94964 1423 aa33.59■■■□□ 2.97
UPP1-211ENST00000482015 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.56■■■□□ 2.96
UPP1-211ENST00000482015 TRIM41Q8WV44 630 aa33.52■■■□□ 2.96
UPP1-211ENST00000482015 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.5■■■□□ 2.95
UPP1-211ENST00000482015 FBLN2P98095 1184 aa33.38■■■□□ 2.93
UPP1-211ENST00000482015 WDR97A6NE52 1622 aa33.28■■■□□ 2.92
UPP1-211ENST00000482015 CHD1O14646 1710 aa33.28■■■□□ 2.92
UPP1-211ENST00000482015 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.26■■■□□ 2.92
UPP1-211ENST00000482015 GRIN2BQ13224 1484 aa33.22■■■□□ 2.91
UPP1-211ENST00000482015 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33.2■■■□□ 2.91
UPP1-211ENST00000482015 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33.2■■■□□ 2.91
UPP1-211ENST00000482015 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.2■■■□□ 2.91
UPP1-211ENST00000482015 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.19■■■□□ 2.9
UPP1-211ENST00000482015 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.18■■■□□ 2.9
UPP1-211ENST00000482015 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.17■■■□□ 2.9
UPP1-211ENST00000482015 ARHGEF11O15085 1522 aa33.17■■■□□ 2.9
UPP1-211ENST00000482015 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.16■■■□□ 2.9
UPP1-211ENST00000482015 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.16■■■□□ 2.9
UPP1-211ENST00000482015 SYNJ1O43426 1573 aa33.13■■■□□ 2.89
UPP1-211ENST00000482015 TOP2BQ02880 1626 aa33.12■■■□□ 2.89
UPP1-211ENST00000482015 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.1■■■□□ 2.89
UPP1-211ENST00000482015 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.06■■■□□ 2.88
UPP1-211ENST00000482015 SYNJ2O15056 1496 aa33.05■■■□□ 2.88
UPP1-211ENST00000482015 PBRM1Q86U86 1689 aa33.04■■■□□ 2.88
UPP1-211ENST00000482015 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.98■■■□□ 2.87
UPP1-211ENST00000482015 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.94■■■□□ 2.86
UPP1-211ENST00000482015 ARAP1Q96P48 1450 aa32.87■■■□□ 2.85
UPP1-211ENST00000482015 GRIN2AQ12879 1464 aa32.8■■■□□ 2.84
UPP1-211ENST00000482015 ADAMTS12P58397 1594 aa32.79■■■□□ 2.84
UPP1-211ENST00000482015 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.76■■■□□ 2.83
UPP1-211ENST00000482015 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.75■■■□□ 2.83
UPP1-211ENST00000482015 NUP160Q12769 1436 aa32.67■■■□□ 2.82
UPP1-211ENST00000482015 CEP170Q5SW79 1584 aa32.65■■■□□ 2.82
UPP1-211ENST00000482015 KIF27Q86VH2 1401 aa32.53■■■□□ 2.8
UPP1-211ENST00000482015 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.51■■■□□ 2.79
UPP1-211ENST00000482015 IGF1RP08069 1367 aa32.51■■■□□ 2.79
UPP1-211ENST00000482015 TRHP20396 242 aaPredicted RBP32.49■■■□□ 2.79
UPP1-211ENST00000482015 SHROOM2Q13796 1616 aa32.43■■■□□ 2.78
UPP1-211ENST00000482015 JPH4Q96JJ6 628 aa32.4■■■□□ 2.78
UPP1-211ENST00000482015 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP32.36■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.6 ms