RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481828.5

MME-208, Transcript of membrane metalloendopeptidase, humanhuman

TSL 3

Gene MME, Length 856 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MME-208ENST00000481828 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.67■■■■□ 3.46
MME-208ENST00000481828 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.72■■■□□ 2.83
MME-208ENST00000481828 ABCC9O60706 1549 aa32.72■■■□□ 2.83
MME-208ENST00000481828 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.18■■■□□ 2.58
MME-208ENST00000481828 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.09■■■□□ 2.57
MME-208ENST00000481828 NACADO15069 1562 aa30.89■■■□□ 2.54
MME-208ENST00000481828 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.58■■■□□ 2.49
MME-208ENST00000481828 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.48■■■□□ 2.47
MME-208ENST00000481828 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.48■■■□□ 2.47
MME-208ENST00000481828 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.41■■■□□ 2.46
MME-208ENST00000481828 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.41■■■□□ 2.46
MME-208ENST00000481828 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.2■■■□□ 2.42
MME-208ENST00000481828 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.16■■■□□ 2.42
MME-208ENST00000481828 SCRIBQ14160 1630 aa30.05■■■□□ 2.4
MME-208ENST00000481828 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.59■■■□□ 2.33
MME-208ENST00000481828 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.49■■■□□ 2.31
MME-208ENST00000481828 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
MME-208ENST00000481828 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.36■■■□□ 2.29
MME-208ENST00000481828 SMARCA4P51532 1647 aa28.58■■■□□ 2.17
MME-208ENST00000481828 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.53■■■□□ 2.16
MME-208ENST00000481828 NCAPD3P42695 1498 aa28.51■■■□□ 2.15
MME-208ENST00000481828 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
MME-208ENST00000481828 SMARCA2P51531 1590 aa28.42■■■□□ 2.14
MME-208ENST00000481828 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.33■■■□□ 2.13
MME-208ENST00000481828 HMGXB3Q12766 1538 aa28.3■■■□□ 2.12
MME-208ENST00000481828 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
MME-208ENST00000481828 ERCC6Q03468 1493 aa28.2■■■□□ 2.1
MME-208ENST00000481828 NESP48681 1621 aa28.18■■■□□ 2.1
MME-208ENST00000481828 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.16■■■□□ 2.1
MME-208ENST00000481828 WIZO95785 1651 aa28.06■■■□□ 2.08
MME-208ENST00000481828 CUX2O14529 1486 aa27.89■■■□□ 2.06
MME-208ENST00000481828 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.85■■■□□ 2.05
MME-208ENST00000481828 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
MME-208ENST00000481828 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.79■■■□□ 2.04
MME-208ENST00000481828 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.72■■■□□ 2.03
MME-208ENST00000481828 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.72■■■□□ 2.03
MME-208ENST00000481828 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
MME-208ENST00000481828 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.7■■■□□ 2.02
MME-208ENST00000481828 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
MME-208ENST00000481828 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.48■■□□□ 1.99
MME-208ENST00000481828 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.44■■□□□ 1.98
MME-208ENST00000481828 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.44■■□□□ 1.98
MME-208ENST00000481828 CFTRP13569 1480 aa27.42■■□□□ 1.98
MME-208ENST00000481828 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.36■■□□□ 1.97
MME-208ENST00000481828 WDR62O43379 1518 aa27.36■■□□□ 1.97
MME-208ENST00000481828 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
MME-208ENST00000481828 PRDM2Q13029 1718 aa27.2■■□□□ 1.94
MME-208ENST00000481828 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
MME-208ENST00000481828 TOPBP1Q92547 1522 aa26.95■■□□□ 1.9
MME-208ENST00000481828 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
MME-208ENST00000481828 IFT140Q96RY7 1462 aa26.84■■□□□ 1.89
MME-208ENST00000481828 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.84■■□□□ 1.89
MME-208ENST00000481828 TRIM41Q8WV44 630 aa26.81■■□□□ 1.88
MME-208ENST00000481828 ABCC8Q09428 1581 aa26.8■■□□□ 1.88
MME-208ENST00000481828 OSCARQ8IYS5 282 aa26.8■■□□□ 1.88
MME-208ENST00000481828 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
MME-208ENST00000481828 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.68■■□□□ 1.86
MME-208ENST00000481828 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
MME-208ENST00000481828 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.68■■□□□ 1.86
MME-208ENST00000481828 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
MME-208ENST00000481828 SOGA1O94964 1423 aa26.61■■□□□ 1.85
MME-208ENST00000481828 CUX1P39880 1505 aa26.6■■□□□ 1.85
MME-208ENST00000481828 FBLN2P98095 1184 aa26.59■■□□□ 1.85
MME-208ENST00000481828 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.59■■□□□ 1.85
MME-208ENST00000481828 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
MME-208ENST00000481828 CHD1O14646 1710 aa26.51■■□□□ 1.83
MME-208ENST00000481828 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.43■■□□□ 1.82
MME-208ENST00000481828 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.43■■□□□ 1.82
MME-208ENST00000481828 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.43■■□□□ 1.82
MME-208ENST00000481828 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.39■■□□□ 1.82
MME-208ENST00000481828 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
MME-208ENST00000481828 ARHGEF11O15085 1522 aa26.33■■□□□ 1.81
MME-208ENST00000481828 WDR97A6NE52 1622 aa26.32■■□□□ 1.8
MME-208ENST00000481828 GRIN2BQ13224 1484 aa26.3■■□□□ 1.8
MME-208ENST00000481828 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.27■■□□□ 1.8
MME-208ENST00000481828 PBRM1Q86U86 1689 aa26.26■■□□□ 1.79
MME-208ENST00000481828 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.26■■□□□ 1.79
MME-208ENST00000481828 SYNJ1O43426 1573 aa26.24■■□□□ 1.79
MME-208ENST00000481828 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.23■■□□□ 1.79
MME-208ENST00000481828 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
MME-208ENST00000481828 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.21■■□□□ 1.79
MME-208ENST00000481828 TOP2BQ02880 1626 aa26.18■■□□□ 1.78
MME-208ENST00000481828 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.18■■□□□ 1.78
MME-208ENST00000481828 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.17■■□□□ 1.78
MME-208ENST00000481828 SYNJ2O15056 1496 aa26.17■■□□□ 1.78
MME-208ENST00000481828 ARAP1Q96P48 1450 aa26.11■■□□□ 1.77
MME-208ENST00000481828 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.09■■□□□ 1.77
MME-208ENST00000481828 ADAMTS12P58397 1594 aa25.98■■□□□ 1.75
MME-208ENST00000481828 GRIN2AQ12879 1464 aa25.96■■□□□ 1.75
MME-208ENST00000481828 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
MME-208ENST00000481828 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.9■■□□□ 1.74
MME-208ENST00000481828 CEP170Q5SW79 1584 aa25.9■■□□□ 1.74
MME-208ENST00000481828 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.88■■□□□ 1.73
MME-208ENST00000481828 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.84■■□□□ 1.73
MME-208ENST00000481828 NUP160Q12769 1436 aa25.81■■□□□ 1.72
MME-208ENST00000481828 KIF27Q86VH2 1401 aa25.71■■□□□ 1.71
MME-208ENST00000481828 IGF1RP08069 1367 aa25.68■■□□□ 1.7
MME-208ENST00000481828 JPH4Q96JJ6 628 aa25.67■■□□□ 1.7
MME-208ENST00000481828 SHROOM2Q13796 1616 aa25.66■■□□□ 1.7
MME-208ENST00000481828 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms