RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481742.1

TBCB-204, Transcript of tubulin folding cofactor B, humanhuman

TSL 2

Gene TBCB, Length 904 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCB-204ENST00000481742 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.09■■■■■ 6.89
TBCB-204ENST00000481742 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.06■■■■■ 5.92
TBCB-204ENST00000481742 ABCC9O60706 1549 aa51.49■■■■■ 5.83
TBCB-204ENST00000481742 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.32■■■■■ 5.49
TBCB-204ENST00000481742 NACADO15069 1562 aa49.09■■■■■ 5.45
TBCB-204ENST00000481742 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.71■■■■■ 5.39
TBCB-204ENST00000481742 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.6■■■■■ 5.37
TBCB-204ENST00000481742 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.24■■■■■ 5.31
TBCB-204ENST00000481742 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.18■■■■■ 5.3
TBCB-204ENST00000481742 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.1■■■■■ 5.29
TBCB-204ENST00000481742 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.93■■■■■ 5.26
TBCB-204ENST00000481742 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.85■■■■■ 5.25
TBCB-204ENST00000481742 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.79■■■■■ 5.24
TBCB-204ENST00000481742 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.36■■■■■ 5.17
TBCB-204ENST00000481742 SCRIBQ14160 1630 aa47.33■■■■■ 5.17
TBCB-204ENST00000481742 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.61■■■■■ 5.05
TBCB-204ENST00000481742 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.6■■■■■ 5.05
TBCB-204ENST00000481742 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.38■■■■■ 5.02
TBCB-204ENST00000481742 NCAPD3P42695 1498 aa45.27■■■■■ 4.84
TBCB-204ENST00000481742 SMARCA4P51532 1647 aa45.25■■■■■ 4.83
TBCB-204ENST00000481742 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.16■■■■■ 4.82
TBCB-204ENST00000481742 SMARCA2P51531 1590 aa45.13■■■■■ 4.82
TBCB-204ENST00000481742 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.11■■■■■ 4.81
TBCB-204ENST00000481742 HMGXB3Q12766 1538 aa45.02■■■■■ 4.8
TBCB-204ENST00000481742 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.85■■■■■ 4.77
TBCB-204ENST00000481742 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.77■■■■■ 4.76
TBCB-204ENST00000481742 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.72■■■■■ 4.75
TBCB-204ENST00000481742 ERCC6Q03468 1493 aa44.49■■■■■ 4.71
TBCB-204ENST00000481742 CUX2O14529 1486 aa44.34■■■■■ 4.69
TBCB-204ENST00000481742 NESP48681 1621 aa44.33■■■■■ 4.69
TBCB-204ENST00000481742 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.23■■■■■ 4.67
TBCB-204ENST00000481742 WIZO95785 1651 aa44.2■■■■■ 4.67
TBCB-204ENST00000481742 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.94■■■■■ 4.62
TBCB-204ENST00000481742 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.93■■■■■ 4.62
TBCB-204ENST00000481742 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.9■■■■■ 4.62
TBCB-204ENST00000481742 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.89■■■■■ 4.62
TBCB-204ENST00000481742 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.85■■■■■ 4.61
TBCB-204ENST00000481742 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.76■■■■■ 4.6
TBCB-204ENST00000481742 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.74■■■■■ 4.59
TBCB-204ENST00000481742 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.51■■■■■ 4.56
TBCB-204ENST00000481742 CFTRP13569 1480 aa43.49■■■■■ 4.55
TBCB-204ENST00000481742 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.44■■■■■ 4.54
TBCB-204ENST00000481742 WDR62O43379 1518 aa43.41■■■■■ 4.54
TBCB-204ENST00000481742 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.38■■■■■ 4.54
TBCB-204ENST00000481742 PRDM2Q13029 1718 aa43.19■■■■■ 4.51
TBCB-204ENST00000481742 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.17■■■■■ 4.5
TBCB-204ENST00000481742 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.98■■■■■ 4.47
TBCB-204ENST00000481742 ABCC8Q09428 1581 aa42.65■■■■■ 4.42
TBCB-204ENST00000481742 TOPBP1Q92547 1522 aa42.61■■■■■ 4.41
TBCB-204ENST00000481742 IFT140Q96RY7 1462 aa42.55■■■■■ 4.4
TBCB-204ENST00000481742 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.54■■■■■ 4.4
TBCB-204ENST00000481742 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.36■■■■■ 4.37
TBCB-204ENST00000481742 OSCARQ8IYS5 282 aa42.3■■■■■ 4.36
TBCB-204ENST00000481742 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.22■■■■■ 4.35
TBCB-204ENST00000481742 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.22■■■■■ 4.35
TBCB-204ENST00000481742 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.2■■■■■ 4.35
TBCB-204ENST00000481742 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.19■■■■■ 4.34
TBCB-204ENST00000481742 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.01■■■■■ 4.32
TBCB-204ENST00000481742 CUX1P39880 1505 aa42■■■■■ 4.31
TBCB-204ENST00000481742 SOGA1O94964 1423 aa42■■■■■ 4.31
TBCB-204ENST00000481742 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.98■■■■■ 4.31
TBCB-204ENST00000481742 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.98■■■■■ 4.31
TBCB-204ENST00000481742 WDR97A6NE52 1622 aa41.95■■■■■ 4.31
TBCB-204ENST00000481742 TRIM41Q8WV44 630 aa41.93■■■■■ 4.3
TBCB-204ENST00000481742 CHD1O14646 1710 aa41.83■■■■■ 4.29
TBCB-204ENST00000481742 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.81■■■■■ 4.28
TBCB-204ENST00000481742 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.73■■■■■ 4.27
TBCB-204ENST00000481742 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.73■■■■■ 4.27
TBCB-204ENST00000481742 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.73■■■■■ 4.27
TBCB-204ENST00000481742 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.66■■■■■ 4.26
TBCB-204ENST00000481742 ARHGEF11O15085 1522 aa41.64■■■■■ 4.26
TBCB-204ENST00000481742 FBLN2P98095 1184 aa41.64■■■■■ 4.26
TBCB-204ENST00000481742 GRIN2BQ13224 1484 aa41.64■■■■■ 4.26
TBCB-204ENST00000481742 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.63■■■■■ 4.25
TBCB-204ENST00000481742 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.58■■■■■ 4.25
TBCB-204ENST00000481742 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.53■■■■■ 4.24
TBCB-204ENST00000481742 PBRM1Q86U86 1689 aa41.52■■■■■ 4.24
TBCB-204ENST00000481742 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.51■■■■■ 4.24
TBCB-204ENST00000481742 TOP2BQ02880 1626 aa41.49■■■■■ 4.23
TBCB-204ENST00000481742 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.48■■■■■ 4.23
TBCB-204ENST00000481742 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.48■■■■■ 4.23
TBCB-204ENST00000481742 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.46■■■■■ 4.23
TBCB-204ENST00000481742 SYNJ2O15056 1496 aa41.45■■■■■ 4.23
TBCB-204ENST00000481742 SYNJ1O43426 1573 aa41.42■■■■■ 4.22
TBCB-204ENST00000481742 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.37■■■■■ 4.21
TBCB-204ENST00000481742 ARAP1Q96P48 1450 aa41.24■■■■■ 4.19
TBCB-204ENST00000481742 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.23■■■■■ 4.19
TBCB-204ENST00000481742 ADAMTS12P58397 1594 aa41.14■■■■■ 4.18
TBCB-204ENST00000481742 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.09■■■■■ 4.17
TBCB-204ENST00000481742 GRIN2AQ12879 1464 aa41.09■■■■■ 4.17
TBCB-204ENST00000481742 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.03■■■■■ 4.16
TBCB-204ENST00000481742 NUP160Q12769 1436 aa40.94■■■■■ 4.14
TBCB-204ENST00000481742 CEP170Q5SW79 1584 aa40.9■■■■■ 4.14
TBCB-204ENST00000481742 SHROOM2Q13796 1616 aa40.75■■■■■ 4.11
TBCB-204ENST00000481742 KIF27Q86VH2 1401 aa40.68■■■■■ 4.1
TBCB-204ENST00000481742 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.66■■■■■ 4.1
TBCB-204ENST00000481742 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.64■■■■■ 4.1
TBCB-204ENST00000481742 CUL7Q14999 1698 aa40.59■■■■■ 4.09
TBCB-204ENST00000481742 IGF1RP08069 1367 aa40.56■■■■■ 4.08
TBCB-204ENST00000481742 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.55■■■■■ 4.08
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