RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481705.1

MKRN1-212, Transcript of makorin ring finger protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene MKRN1, Length 636 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN1-212ENST00000481705 NISCHQ9Y2I1 1504 aa64.57■■■■■ 7.93
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MKRN1-212ENST00000481705 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.86■■■■■ 6.37
MKRN1-212ENST00000481705 NACADO15069 1562 aa54.56■■■■■ 6.32
MKRN1-212ENST00000481705 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54.34■■■■■ 6.29
MKRN1-212ENST00000481705 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.91■■■■■ 6.22
MKRN1-212ENST00000481705 UNC13AQ9UPW8 1703 aa53.66■■■■■ 6.18
MKRN1-212ENST00000481705 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP53.6■■■■■ 6.17
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MKRN1-212ENST00000481705 DNAJC5BQ9UF47 199 aa53.45■■■■■ 6.15
MKRN1-212ENST00000481705 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa53.36■■■■■ 6.13
MKRN1-212ENST00000481705 BICRAQ9NZM4 1560 aa53.21■■■■■ 6.11
MKRN1-212ENST00000481705 SCRIBQ14160 1630 aa52.72■■■■■ 6.03
MKRN1-212ENST00000481705 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52.56■■■■■ 6
MKRN1-212ENST00000481705 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.92■■■■■ 5.9
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MKRN1-212ENST00000481705 CECR2Q9BXF3 1484 aa51.69■■■■■ 5.87
MKRN1-212ENST00000481705 NCAPD3P42695 1498 aa50.33■■■■■ 5.65
MKRN1-212ENST00000481705 SMARCA4P51532 1647 aa50.33■■■■■ 5.65
MKRN1-212ENST00000481705 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.23■■■■■ 5.63
MKRN1-212ENST00000481705 SMARCA2P51531 1590 aa50.16■■■■■ 5.62
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MKRN1-212ENST00000481705 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.8■■■■■ 5.56
MKRN1-212ENST00000481705 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.75■■■■■ 5.56
MKRN1-212ENST00000481705 ERCC6Q03468 1493 aa49.59■■■■■ 5.53
MKRN1-212ENST00000481705 NESP48681 1621 aa49.43■■■■■ 5.5
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MKRN1-212ENST00000481705 WIZO95785 1651 aa49.21■■■■■ 5.47
MKRN1-212ENST00000481705 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa49.18■■■■■ 5.46
MKRN1-212ENST00000481705 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.9■■■■■ 5.42
MKRN1-212ENST00000481705 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.88■■■■■ 5.41
MKRN1-212ENST00000481705 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.86■■■■■ 5.41
MKRN1-212ENST00000481705 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.84■■■■■ 5.41
MKRN1-212ENST00000481705 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa48.84■■■■■ 5.41
MKRN1-212ENST00000481705 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.82■■■■■ 5.41
MKRN1-212ENST00000481705 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP48.62■■■■■ 5.37
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MKRN1-212ENST00000481705 CFTRP13569 1480 aa48.35■■■■■ 5.33
MKRN1-212ENST00000481705 CEP164Q9UPV0 1460 aa48.33■■■■■ 5.33
MKRN1-212ENST00000481705 WDR62O43379 1518 aa48.3■■■■■ 5.32
MKRN1-212ENST00000481705 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.29■■■■■ 5.32
MKRN1-212ENST00000481705 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.02■■■■■ 5.28
MKRN1-212ENST00000481705 PRDM2Q13029 1718 aa48.01■■■■■ 5.28
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MKRN1-212ENST00000481705 TOPBP1Q92547 1522 aa47.42■■■■■ 5.18
MKRN1-212ENST00000481705 ABCC8Q09428 1581 aa47.35■■■■■ 5.17
MKRN1-212ENST00000481705 IFT140Q96RY7 1462 aa47.33■■■■■ 5.17
MKRN1-212ENST00000481705 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.3■■■■■ 5.16
MKRN1-212ENST00000481705 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.2■■■■■ 5.15
MKRN1-212ENST00000481705 OSCARQ8IYS5 282 aa47.13■■■■■ 5.14
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MKRN1-212ENST00000481705 TRIM41Q8WV44 630 aa46.9■■■■■ 5.1
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MKRN1-212ENST00000481705 SOGA1O94964 1423 aa46.73■■■■■ 5.07
MKRN1-212ENST00000481705 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.73■■■■■ 5.07
MKRN1-212ENST00000481705 CHD1O14646 1710 aa46.62■■■■■ 5.05
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MKRN1-212ENST00000481705 WDR97A6NE52 1622 aa46.55■■■■■ 5.04
MKRN1-212ENST00000481705 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa46.53■■■■■ 5.04
MKRN1-212ENST00000481705 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa46.53■■■■■ 5.04
MKRN1-212ENST00000481705 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa46.53■■■■■ 5.04
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MKRN1-212ENST00000481705 ARHGEF11O15085 1522 aa46.41■■■■■ 5.02
MKRN1-212ENST00000481705 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa46.38■■■■■ 5.02
MKRN1-212ENST00000481705 GRIN2BQ13224 1484 aa46.31■■■■■ 5
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MKRN1-212ENST00000481705 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP46.17■■■■■ 4.98
MKRN1-212ENST00000481705 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.14■■■■■ 4.98
MKRN1-212ENST00000481705 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.13■■■■■ 4.97
MKRN1-212ENST00000481705 TOP2BQ02880 1626 aa46.11■■■■■ 4.97
MKRN1-212ENST00000481705 SYNJ2O15056 1496 aa46.11■■■■■ 4.97
MKRN1-212ENST00000481705 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.11■■■■■ 4.97
MKRN1-212ENST00000481705 SYNJ1O43426 1573 aa46.09■■■■■ 4.97
MKRN1-212ENST00000481705 CLASP1Q7Z460 1538 aa46.03■■■■■ 4.96
MKRN1-212ENST00000481705 CYB5RLQ6IPT4 315 aa46.01■■■■■ 4.96
MKRN1-212ENST00000481705 ARAP1Q96P48 1450 aa45.96■■■■■ 4.95
MKRN1-212ENST00000481705 ADAMTS12P58397 1594 aa45.76■■■■■ 4.92
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MKRN1-212ENST00000481705 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.65■■■■■ 4.9
MKRN1-212ENST00000481705 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.61■■■■■ 4.89
MKRN1-212ENST00000481705 CEP170Q5SW79 1584 aa45.54■■■■■ 4.88
MKRN1-212ENST00000481705 NUP160Q12769 1436 aa45.53■■■■■ 4.88
MKRN1-212ENST00000481705 TRHP20396 242 aaPredicted RBP45.4■■■■■ 4.86
MKRN1-212ENST00000481705 ERCC6L2Q5T890 1561 aa45.34■■■■■ 4.85
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MKRN1-212ENST00000481705 KIF27Q86VH2 1401 aa45.21■■■■■ 4.83
MKRN1-212ENST00000481705 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.11■■■■■ 4.81
MKRN1-212ENST00000481705 IGF1RP08069 1367 aa45.09■■■■■ 4.81
MKRN1-212ENST00000481705 CUL7Q14999 1698 aa45.09■■■■■ 4.81
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