RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481564.1

MALSU1-205, Transcript of mitochondrial assembly of ribosomal large subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene MALSU1, Length 625 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1-205ENST00000481564 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.28■■■■■ 5.8
MALSU1-205ENST00000481564 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.14■■■■■ 4.98
MALSU1-205ENST00000481564 ABCC9O60706 1549 aa46.01■■■■■ 4.96
MALSU1-205ENST00000481564 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.91■■■■■ 4.62
MALSU1-205ENST00000481564 NACADO15069 1562 aa43.63■■■■■ 4.57
MALSU1-205ENST00000481564 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.24■■■■■ 4.51
MALSU1-205ENST00000481564 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.12■■■■■ 4.49
MALSU1-205ENST00000481564 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.07■■■■■ 4.49
MALSU1-205ENST00000481564 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.87■■■■■ 4.45
MALSU1-205ENST00000481564 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.78■■■■■ 4.44
MALSU1-205ENST00000481564 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.61■■■■■ 4.41
MALSU1-205ENST00000481564 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.5■■■■■ 4.39
MALSU1-205ENST00000481564 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.49■■■■■ 4.39
MALSU1-205ENST00000481564 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.21■■■■■ 4.35
MALSU1-205ENST00000481564 SCRIBQ14160 1630 aa41.85■■■■■ 4.29
MALSU1-205ENST00000481564 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.64■■■■■ 4.26
MALSU1-205ENST00000481564 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.57■■■■■ 4.25
MALSU1-205ENST00000481564 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.53■■■■■ 4.24
MALSU1-205ENST00000481564 NCAPD3P42695 1498 aa40.27■■■■■ 4.04
MALSU1-205ENST00000481564 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.07■■■■■ 4.01
MALSU1-205ENST00000481564 SMARCA4P51532 1647 aa40.02■■■■■ 4
MALSU1-205ENST00000481564 SMARCA2P51531 1590 aa40.01■■■■□ 3.99
MALSU1-205ENST00000481564 HMGXB3Q12766 1538 aa39.97■■■■□ 3.99
MALSU1-205ENST00000481564 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.87■■■■□ 3.97
MALSU1-205ENST00000481564 CUX2O14529 1486 aa39.87■■■■□ 3.97
MALSU1-205ENST00000481564 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.84■■■■□ 3.97
MALSU1-205ENST00000481564 ERCC6Q03468 1493 aa39.77■■■■□ 3.96
MALSU1-205ENST00000481564 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.73■■■■□ 3.95
MALSU1-205ENST00000481564 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.66■■■■□ 3.94
MALSU1-205ENST00000481564 NESP48681 1621 aa39.51■■■■□ 3.92
MALSU1-205ENST00000481564 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.46■■■■□ 3.91
MALSU1-205ENST00000481564 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.38■■■■□ 3.89
MALSU1-205ENST00000481564 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.23■■■■□ 3.87
MALSU1-205ENST00000481564 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.12■■■■□ 3.85
MALSU1-205ENST00000481564 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.04■■■■□ 3.84
MALSU1-205ENST00000481564 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.99■■■■□ 3.83
MALSU1-205ENST00000481564 WIZO95785 1651 aa38.95■■■■□ 3.83
MALSU1-205ENST00000481564 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.76■■■■□ 3.8
MALSU1-205ENST00000481564 WDR62O43379 1518 aa38.71■■■■□ 3.79
MALSU1-205ENST00000481564 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.63■■■■□ 3.78
MALSU1-205ENST00000481564 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.58■■■■□ 3.77
MALSU1-205ENST00000481564 CFTRP13569 1480 aa38.56■■■■□ 3.76
MALSU1-205ENST00000481564 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.53■■■■□ 3.76
MALSU1-205ENST00000481564 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.52■■■■□ 3.76
MALSU1-205ENST00000481564 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.2■■■■□ 3.71
MALSU1-205ENST00000481564 PRDM2Q13029 1718 aa38.18■■■■□ 3.7
MALSU1-205ENST00000481564 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.05■■■■□ 3.68
MALSU1-205ENST00000481564 OSCARQ8IYS5 282 aa37.95■■■■□ 3.67
MALSU1-205ENST00000481564 TRIM41Q8WV44 630 aa37.89■■■■□ 3.66
MALSU1-205ENST00000481564 IFT140Q96RY7 1462 aa37.85■■■■□ 3.65
MALSU1-205ENST00000481564 ABCC8Q09428 1581 aa37.8■■■■□ 3.64
MALSU1-205ENST00000481564 TOPBP1Q92547 1522 aa37.78■■■■□ 3.64
MALSU1-205ENST00000481564 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.7■■■■□ 3.63
MALSU1-205ENST00000481564 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.67■■■■□ 3.62
MALSU1-205ENST00000481564 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.54■■■■□ 3.6
MALSU1-205ENST00000481564 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.48■■■■□ 3.59
MALSU1-205ENST00000481564 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.45■■■■□ 3.59
MALSU1-205ENST00000481564 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.45■■■■□ 3.59
MALSU1-205ENST00000481564 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.45■■■■□ 3.59
MALSU1-205ENST00000481564 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.39■■■■□ 3.58
MALSU1-205ENST00000481564 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.34■■■■□ 3.571e-12■■■■■ 53.8
MALSU1-205ENST00000481564 ARHGEF11O15085 1522 aa37.34■■■■□ 3.57
MALSU1-205ENST00000481564 CHD1O14646 1710 aa37.25■■■■□ 3.55
MALSU1-205ENST00000481564 WDR97A6NE52 1622 aa37.22■■■■□ 3.55
MALSU1-205ENST00000481564 SOGA1O94964 1423 aa37.2■■■■□ 3.55
MALSU1-205ENST00000481564 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.19■■■■□ 3.54
MALSU1-205ENST00000481564 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.12■■■■□ 3.53
MALSU1-205ENST00000481564 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.09■■■■□ 3.53
MALSU1-205ENST00000481564 CUX1P39880 1505 aa37.08■■■■□ 3.53
MALSU1-205ENST00000481564 FBLN2P98095 1184 aa37.03■■■■□ 3.52
MALSU1-205ENST00000481564 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.99■■■■□ 3.51
MALSU1-205ENST00000481564 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.98■■■■□ 3.51
MALSU1-205ENST00000481564 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.97■■■■□ 3.51
MALSU1-205ENST00000481564 ARAP1Q96P48 1450 aa36.95■■■■□ 3.51
MALSU1-205ENST00000481564 GRIN2BQ13224 1484 aa36.93■■■■□ 3.5
MALSU1-205ENST00000481564 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.9■■■■□ 3.5
MALSU1-205ENST00000481564 SYNJ1O43426 1573 aa36.86■■■■□ 3.49
MALSU1-205ENST00000481564 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.84■■■■□ 3.49
MALSU1-205ENST00000481564 SYNJ2O15056 1496 aa36.83■■■■□ 3.49
MALSU1-205ENST00000481564 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.77■■■■□ 3.48
MALSU1-205ENST00000481564 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.77■■■■□ 3.48
MALSU1-205ENST00000481564 PBRM1Q86U86 1689 aa36.75■■■■□ 3.47
MALSU1-205ENST00000481564 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.73■■■■□ 3.47
MALSU1-205ENST00000481564 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.71■■■■□ 3.47
MALSU1-205ENST00000481564 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.58■■■■□ 3.454e-6■■■■□ 19.5
MALSU1-205ENST00000481564 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.56■■■■□ 3.44
MALSU1-205ENST00000481564 TOP2BQ02880 1626 aa36.52■■■■□ 3.44
MALSU1-205ENST00000481564 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.52■■■■□ 3.44
MALSU1-205ENST00000481564 GRIN2AQ12879 1464 aa36.45■■■■□ 3.43
MALSU1-205ENST00000481564 ADAMTS12P58397 1594 aa36.42■■■■□ 3.42
MALSU1-205ENST00000481564 NUP160Q12769 1436 aa36.37■■■■□ 3.41
MALSU1-205ENST00000481564 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.33■■■■□ 3.41
MALSU1-205ENST00000481564 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.32■■■■□ 3.4
MALSU1-205ENST00000481564 CEP170Q5SW79 1584 aa36.3■■■■□ 3.4
MALSU1-205ENST00000481564 SHROOM2Q13796 1616 aa36.23■■■■□ 3.39
MALSU1-205ENST00000481564 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.2■■■■□ 3.39
MALSU1-205ENST00000481564 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.94■■■■□ 3.34
MALSU1-205ENST00000481564 JPH4Q96JJ6 628 aa35.92■■■■□ 3.34
MALSU1-205ENST00000481564 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.91■■■■□ 3.34
MALSU1-205ENST00000481564 KIF27Q86VH2 1401 aa35.78■■■■□ 3.32
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