RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481211.1

NISCH-208, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 557 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-208ENST00000481211 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.72■■■□□ 2.51
NISCH-208ENST00000481211 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.16■■□□□ 1.94
NISCH-208ENST00000481211 ABCC9O60706 1549 aa25.92■■□□□ 1.74
NISCH-208ENST00000481211 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
NISCH-208ENST00000481211 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.54■■□□□ 1.68
NISCH-208ENST00000481211 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.48■■□□□ 1.67
NISCH-208ENST00000481211 NACADO15069 1562 aa25.41■■□□□ 1.66
NISCH-208ENST00000481211 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.31■■□□□ 1.64
NISCH-208ENST00000481211 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.28■■□□□ 1.64
NISCH-208ENST00000481211 SCRIBQ14160 1630 aa24.68■■□□□ 1.54
NISCH-208ENST00000481211 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.61■■□□□ 1.53
NISCH-208ENST00000481211 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.42■■□□□ 1.5
NISCH-208ENST00000481211 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.41■■□□□ 1.5
NISCH-208ENST00000481211 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.25■■□□□ 1.47
NISCH-208ENST00000481211 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
NISCH-208ENST00000481211 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.78■■□□□ 1.4
NISCH-208ENST00000481211 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
NISCH-208ENST00000481211 SMARCA4P51532 1647 aa23.73■■□□□ 1.39
NISCH-208ENST00000481211 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.62■■□□□ 1.37
NISCH-208ENST00000481211 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
NISCH-208ENST00000481211 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.55■■□□□ 1.36
NISCH-208ENST00000481211 SMARCA2P51531 1590 aa23.52■■□□□ 1.36
NISCH-208ENST00000481211 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.51■■□□□ 1.35
NISCH-208ENST00000481211 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.46■■□□□ 1.35
NISCH-208ENST00000481211 NCAPD3P42695 1498 aa23.41■■□□□ 1.34
NISCH-208ENST00000481211 WIZO95785 1651 aa23.38■■□□□ 1.33
NISCH-208ENST00000481211 HMGXB3Q12766 1538 aa23.37■■□□□ 1.33
NISCH-208ENST00000481211 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
NISCH-208ENST00000481211 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
NISCH-208ENST00000481211 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
NISCH-208ENST00000481211 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.24■■□□□ 1.31
NISCH-208ENST00000481211 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.92■■□□□ 1.26
NISCH-208ENST00000481211 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.73■■□□□ 1.23
NISCH-208ENST00000481211 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.72■■□□□ 1.23
NISCH-208ENST00000481211 CFTRP13569 1480 aa22.72■■□□□ 1.23
NISCH-208ENST00000481211 PRDM2Q13029 1718 aa22.6■■□□□ 1.21
NISCH-208ENST00000481211 NESP48681 1621 aa22.56■■□□□ 1.2
NISCH-208ENST00000481211 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.55■■□□□ 1.2
NISCH-208ENST00000481211 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.45■■□□□ 1.18
NISCH-208ENST00000481211 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
NISCH-208ENST00000481211 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.41■■□□□ 1.18
NISCH-208ENST00000481211 ERCC6Q03468 1493 aa22.36■■□□□ 1.17
NISCH-208ENST00000481211 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.36■■□□□ 1.17
NISCH-208ENST00000481211 ABCC8Q09428 1581 aa22.28■■□□□ 1.16
NISCH-208ENST00000481211 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.26■■□□□ 1.15
NISCH-208ENST00000481211 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.23■■□□□ 1.15
NISCH-208ENST00000481211 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.2■■□□□ 1.14
NISCH-208ENST00000481211 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
NISCH-208ENST00000481211 WDR62O43379 1518 aa22.18■■□□□ 1.14
NISCH-208ENST00000481211 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
NISCH-208ENST00000481211 TOP2BQ02880 1626 aa22.15■■□□□ 1.14
NISCH-208ENST00000481211 CUX1P39880 1505 aa22.15■■□□□ 1.14
NISCH-208ENST00000481211 TOPBP1Q92547 1522 aa22.15■■□□□ 1.14
NISCH-208ENST00000481211 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.14■■□□□ 1.14
NISCH-208ENST00000481211 SYNJ1O43426 1573 aa22.1■■□□□ 1.13
NISCH-208ENST00000481211 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.05■■□□□ 1.12
NISCH-208ENST00000481211 TRIM41Q8WV44 630 aa22.02■■□□□ 1.12
NISCH-208ENST00000481211 CUX2O14529 1486 aa22.02■■□□□ 1.12
NISCH-208ENST00000481211 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.01■■□□□ 1.11
NISCH-208ENST00000481211 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
NISCH-208ENST00000481211 IFT140Q96RY7 1462 aa21.93■■□□□ 1.1
NISCH-208ENST00000481211 SOGA1O94964 1423 aa21.91■■□□□ 1.1
NISCH-208ENST00000481211 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
NISCH-208ENST00000481211 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.86■■□□□ 1.09
NISCH-208ENST00000481211 WDR97A6NE52 1622 aa21.86■■□□□ 1.09
NISCH-208ENST00000481211 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.83■■□□□ 1.08
NISCH-208ENST00000481211 KIF27Q86VH2 1401 aa21.76■■□□□ 1.07
NISCH-208ENST00000481211 EEA1Q15075 1411 aa21.75■■□□□ 1.07
NISCH-208ENST00000481211 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.72■■□□□ 1.07
NISCH-208ENST00000481211 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.68■■□□□ 1.06
NISCH-208ENST00000481211 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
NISCH-208ENST00000481211 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
NISCH-208ENST00000481211 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
NISCH-208ENST00000481211 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.64■■□□□ 1.05
NISCH-208ENST00000481211 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.63■■□□□ 1.056e-6■■■■□ 23.2
NISCH-208ENST00000481211 GRIN2BQ13224 1484 aa21.63■■□□□ 1.05
NISCH-208ENST00000481211 PBRM1Q86U86 1689 aa21.59■■□□□ 1.05
NISCH-208ENST00000481211 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.57■■□□□ 1.04
NISCH-208ENST00000481211 IGF1RP08069 1367 aa21.55■■□□□ 1.04
NISCH-208ENST00000481211 CUL7Q14999 1698 aa21.55■■□□□ 1.04
NISCH-208ENST00000481211 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
NISCH-208ENST00000481211 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.53■■□□□ 1.04
NISCH-208ENST00000481211 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.48■■□□□ 1.03
NISCH-208ENST00000481211 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.47■■□□□ 1.03
NISCH-208ENST00000481211 ADAMTS12P58397 1594 aa21.47■■□□□ 1.03
NISCH-208ENST00000481211 PRXQ9BXM0 1461 aa21.45■■□□□ 1.03
NISCH-208ENST00000481211 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.45■■□□□ 1.02
NISCH-208ENST00000481211 SYNJ2O15056 1496 aa21.44■■□□□ 1.02
NISCH-208ENST00000481211 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
NISCH-208ENST00000481211 KIF21BO75037 1637 aa21.43■■□□□ 1.02
NISCH-208ENST00000481211 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.4■■□□□ 1.02
NISCH-208ENST00000481211 GRIN2AQ12879 1464 aa21.33■■□□□ 1.01
NISCH-208ENST00000481211 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
NISCH-208ENST00000481211 GOLGA3Q08378 1498 aa21.32■■□□□ 1
NISCH-208ENST00000481211 CHD1O14646 1710 aa21.27■■□□□ 1
NISCH-208ENST00000481211 FBLN2P98095 1184 aa21.24■□□□□ 0.99
NISCH-208ENST00000481211 NUP160Q12769 1436 aa21.23■□□□□ 0.99
NISCH-208ENST00000481211 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.17■□□□□ 0.98
NISCH-208ENST00000481211 CEP170Q5SW79 1584 aa21.17■□□□□ 0.98
NISCH-208ENST00000481211 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.17■□□□□ 0.98
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