RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481079.1

PTPRD-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRD, Length 521 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-210ENST00000481079 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.27■■■■■ 7.08
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PTPRD-210ENST00000481079 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.98■■■■■ 5.59
PTPRD-210ENST00000481079 NACADO15069 1562 aa49.83■■■■■ 5.57
PTPRD-210ENST00000481079 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.57■■■■■ 5.53
PTPRD-210ENST00000481079 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.41■■■■■ 5.5
PTPRD-210ENST00000481079 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.28■■■■■ 5.48
PTPRD-210ENST00000481079 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.02■■■■■ 5.44
PTPRD-210ENST00000481079 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.93■■■■■ 5.42
PTPRD-210ENST00000481079 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.68■■■■■ 5.38
PTPRD-210ENST00000481079 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.59■■■■■ 5.37
PTPRD-210ENST00000481079 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.42■■■■■ 5.34
PTPRD-210ENST00000481079 SCRIBQ14160 1630 aa48.21■■■■■ 5.31
PTPRD-210ENST00000481079 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.95■■■■■ 5.27
PTPRD-210ENST00000481079 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.29■■■■■ 5.16
PTPRD-210ENST00000481079 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.22■■■■■ 5.15
PTPRD-210ENST00000481079 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.95■■■■■ 5.11
PTPRD-210ENST00000481079 SMARCA4P51532 1647 aa46.09■■■■■ 4.97
PTPRD-210ENST00000481079 NCAPD3P42695 1498 aa46.01■■■■■ 4.96
PTPRD-210ENST00000481079 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.96■■■■■ 4.95
PTPRD-210ENST00000481079 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.93■■■■■ 4.94
PTPRD-210ENST00000481079 SMARCA2P51531 1590 aa45.84■■■■■ 4.93
PTPRD-210ENST00000481079 HMGXB3Q12766 1538 aa45.73■■■■■ 4.91
PTPRD-210ENST00000481079 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.68■■■■■ 4.9
PTPRD-210ENST00000481079 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.68■■■■■ 4.9
PTPRD-210ENST00000481079 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.51■■■■■ 4.88
PTPRD-210ENST00000481079 WIZO95785 1651 aa45.16■■■■■ 4.82
PTPRD-210ENST00000481079 NESP48681 1621 aa45.06■■■■■ 4.8
PTPRD-210ENST00000481079 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.98■■■■■ 4.79
PTPRD-210ENST00000481079 ERCC6Q03468 1493 aa44.96■■■■■ 4.79
PTPRD-210ENST00000481079 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.84■■■■■ 4.77
PTPRD-210ENST00000481079 CUX2O14529 1486 aa44.71■■■■■ 4.75
PTPRD-210ENST00000481079 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.63■■■■■ 4.73
PTPRD-210ENST00000481079 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.61■■■■■ 4.73
PTPRD-210ENST00000481079 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.52■■■■■ 4.72
PTPRD-210ENST00000481079 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.51■■■■■ 4.72
PTPRD-210ENST00000481079 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.5■■■■■ 4.71
PTPRD-210ENST00000481079 CFTRP13569 1480 aa44.28■■■■■ 4.68
PTPRD-210ENST00000481079 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.12■■■■■ 4.65
PTPRD-210ENST00000481079 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.12■■■■■ 4.65
PTPRD-210ENST00000481079 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.1■■■■■ 4.65
PTPRD-210ENST00000481079 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.07■■■■■ 4.65
PTPRD-210ENST00000481079 WDR62O43379 1518 aa44.04■■■■■ 4.64
PTPRD-210ENST00000481079 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.92■■■■■ 4.62
PTPRD-210ENST00000481079 PRDM2Q13029 1718 aa43.89■■■■■ 4.62
PTPRD-210ENST00000481079 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.73■■■■■ 4.59
PTPRD-210ENST00000481079 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.37■■■■■ 4.53
PTPRD-210ENST00000481079 TOPBP1Q92547 1522 aa43.37■■■■■ 4.53
PTPRD-210ENST00000481079 ABCC8Q09428 1581 aa43.27■■■■■ 4.52
PTPRD-210ENST00000481079 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.26■■■■■ 4.52
PTPRD-210ENST00000481079 IFT140Q96RY7 1462 aa43.18■■■■■ 4.5
PTPRD-210ENST00000481079 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.08■■■■■ 4.49
PTPRD-210ENST00000481079 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.97■■■■■ 4.47
PTPRD-210ENST00000481079 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.97■■■■■ 4.47
PTPRD-210ENST00000481079 CUX1P39880 1505 aa42.88■■■■■ 4.46
PTPRD-210ENST00000481079 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.87■■■■■ 4.45
PTPRD-210ENST00000481079 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.79■■■■■ 4.44
PTPRD-210ENST00000481079 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.78■■■■■ 4.44
PTPRD-210ENST00000481079 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.74■■■■■ 4.43
PTPRD-210ENST00000481079 SOGA1O94964 1423 aa42.74■■■■■ 4.43
PTPRD-210ENST00000481079 OSCARQ8IYS5 282 aa42.73■■■■■ 4.43
PTPRD-210ENST00000481079 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.58■■■■■ 4.41
PTPRD-210ENST00000481079 WDR97A6NE52 1622 aa42.54■■■■■ 4.4
PTPRD-210ENST00000481079 CHD1O14646 1710 aa42.41■■■■■ 4.38
PTPRD-210ENST00000481079 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.38■■■■■ 4.37
PTPRD-210ENST00000481079 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.37■■■■■ 4.37
PTPRD-210ENST00000481079 TOP2BQ02880 1626 aa42.37■■■■■ 4.37
PTPRD-210ENST00000481079 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.36■■■■■ 4.37
PTPRD-210ENST00000481079 SYNJ1O43426 1573 aa42.35■■■■■ 4.37
PTPRD-210ENST00000481079 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.33■■■■■ 4.37
PTPRD-210ENST00000481079 GRIN2BQ13224 1484 aa42.3■■■■■ 4.36
PTPRD-210ENST00000481079 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.25■■■■■ 4.35
PTPRD-210ENST00000481079 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.24■■■■■ 4.35
PTPRD-210ENST00000481079 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.24■■■■■ 4.35
PTPRD-210ENST00000481079 FBLN2P98095 1184 aa42.23■■■■■ 4.35
PTPRD-210ENST00000481079 PBRM1Q86U86 1689 aa42.21■■■■■ 4.35
PTPRD-210ENST00000481079 TRIM41Q8WV44 630 aa42.19■■■■■ 4.34
PTPRD-210ENST00000481079 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.17■■■■■ 4.34
PTPRD-210ENST00000481079 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.17■■■■■ 4.34
PTPRD-210ENST00000481079 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.17■■■■■ 4.34
PTPRD-210ENST00000481079 ARHGEF11O15085 1522 aa42.1■■■■■ 4.33
PTPRD-210ENST00000481079 SYNJ2O15056 1496 aa42.1■■■■■ 4.33
PTPRD-210ENST00000481079 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.05■■■■■ 4.32
PTPRD-210ENST00000481079 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.98■■■■■ 4.31
PTPRD-210ENST00000481079 ADAMTS12P58397 1594 aa41.86■■■■■ 4.29
PTPRD-210ENST00000481079 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.82■■■■■ 4.29
PTPRD-210ENST00000481079 GRIN2AQ12879 1464 aa41.78■■■■■ 4.28
PTPRD-210ENST00000481079 ARAP1Q96P48 1450 aa41.76■■■■■ 4.28
PTPRD-210ENST00000481079 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.74■■■■■ 4.27
PTPRD-210ENST00000481079 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.68■■■■■ 4.26
PTPRD-210ENST00000481079 NUP160Q12769 1436 aa41.64■■■■■ 4.26
PTPRD-210ENST00000481079 CEP170Q5SW79 1584 aa41.63■■■■■ 4.25
PTPRD-210ENST00000481079 KIF27Q86VH2 1401 aa41.5■■■■■ 4.23
PTPRD-210ENST00000481079 IGF1RP08069 1367 aa41.46■■■■■ 4.23
PTPRD-210ENST00000481079 SHROOM2Q13796 1616 aa41.4■■■■■ 4.22
PTPRD-210ENST00000481079 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.38■■■■■ 4.22
PTPRD-210ENST00000481079 CUL7Q14999 1698 aa41.33■■■■■ 4.21
PTPRD-210ENST00000481079 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.27■■■■■ 4.2
PTPRD-210ENST00000481079 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.15■■■■■ 4.18
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