RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481029.1

FBXO18-212, Transcript of F-box DNA helicase 1, humanhuman

TSL 3

Gene FBXO18, Length 404 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO18-212ENST00000481029 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.63■■■■□ 3.29
FBXO18-212ENST00000481029 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.75■■■□□ 2.67
FBXO18-212ENST00000481029 ABCC9O60706 1549 aa31.2■■■□□ 2.59
FBXO18-212ENST00000481029 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.98■■■□□ 2.39
FBXO18-212ENST00000481029 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.97■■■□□ 2.39
FBXO18-212ENST00000481029 NACADO15069 1562 aa29.86■■■□□ 2.37
FBXO18-212ENST00000481029 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
FBXO18-212ENST00000481029 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.57■■■□□ 2.32
FBXO18-212ENST00000481029 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.43■■■□□ 2.3
FBXO18-212ENST00000481029 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.28■■■□□ 2.28
FBXO18-212ENST00000481029 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.15■■■□□ 2.26
FBXO18-212ENST00000481029 SCRIBQ14160 1630 aa29.03■■■□□ 2.24
FBXO18-212ENST00000481029 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.97■■■□□ 2.23
FBXO18-212ENST00000481029 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.67■■■□□ 2.18
FBXO18-212ENST00000481029 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.62■■■□□ 2.17
FBXO18-212ENST00000481029 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
FBXO18-212ENST00000481029 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.2■■■□□ 2.1
FBXO18-212ENST00000481029 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.03■■■□□ 2.08
FBXO18-212ENST00000481029 SMARCA4P51532 1647 aa27.7■■■□□ 2.02
FBXO18-212ENST00000481029 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
FBXO18-212ENST00000481029 SMARCA2P51531 1590 aa27.54■■■□□ 2
FBXO18-212ENST00000481029 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.54■■■□□ 2
FBXO18-212ENST00000481029 NCAPD3P42695 1498 aa27.51■■□□□ 1.99
FBXO18-212ENST00000481029 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.47■■□□□ 1.99
FBXO18-212ENST00000481029 HMGXB3Q12766 1538 aa27.4■■□□□ 1.98
FBXO18-212ENST00000481029 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
FBXO18-212ENST00000481029 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.36■■□□□ 1.97
FBXO18-212ENST00000481029 WIZO95785 1651 aa27.22■■□□□ 1.95
FBXO18-212ENST00000481029 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
FBXO18-212ENST00000481029 ERCC6Q03468 1493 aa26.96■■□□□ 1.91
FBXO18-212ENST00000481029 NESP48681 1621 aa26.94■■□□□ 1.9
FBXO18-212ENST00000481029 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
FBXO18-212ENST00000481029 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.87■■□□□ 1.89
FBXO18-212ENST00000481029 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.74■■□□□ 1.87
FBXO18-212ENST00000481029 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.71■■□□□ 1.87
FBXO18-212ENST00000481029 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.66■■□□□ 1.86
FBXO18-212ENST00000481029 CUX2O14529 1486 aa26.62■■□□□ 1.85
FBXO18-212ENST00000481029 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.56■■□□□ 1.84
FBXO18-212ENST00000481029 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
FBXO18-212ENST00000481029 CFTRP13569 1480 aa26.54■■□□□ 1.84
FBXO18-212ENST00000481029 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
FBXO18-212ENST00000481029 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.47■■□□□ 1.83
FBXO18-212ENST00000481029 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.47■■□□□ 1.83
FBXO18-212ENST00000481029 PRDM2Q13029 1718 aa26.43■■□□□ 1.82
FBXO18-212ENST00000481029 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.42■■□□□ 1.82
FBXO18-212ENST00000481029 WDR62O43379 1518 aa26.31■■□□□ 1.8
FBXO18-212ENST00000481029 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
FBXO18-212ENST00000481029 ABCC8Q09428 1581 aa26.03■■□□□ 1.76
FBXO18-212ENST00000481029 TOPBP1Q92547 1522 aa26.02■■□□□ 1.76
FBXO18-212ENST00000481029 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26■■□□□ 1.75
FBXO18-212ENST00000481029 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.89■■□□□ 1.74
FBXO18-212ENST00000481029 IFT140Q96RY7 1462 aa25.89■■□□□ 1.73
FBXO18-212ENST00000481029 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
FBXO18-212ENST00000481029 CUX1P39880 1505 aa25.78■■□□□ 1.72
FBXO18-212ENST00000481029 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
FBXO18-212ENST00000481029 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.73■■□□□ 1.71
FBXO18-212ENST00000481029 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
FBXO18-212ENST00000481029 SOGA1O94964 1423 aa25.71■■□□□ 1.71
FBXO18-212ENST00000481029 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.71
FBXO18-212ENST00000481029 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.69■■□□□ 1.7
FBXO18-212ENST00000481029 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.62■■□□□ 1.693e-6■■■■□ 22
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FBXO18-212ENST00000481029 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
FBXO18-212ENST00000481029 TOP2BQ02880 1626 aa25.55■■□□□ 1.68
FBXO18-212ENST00000481029 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.55■■□□□ 1.68
FBXO18-212ENST00000481029 SYNJ1O43426 1573 aa25.54■■□□□ 1.68
FBXO18-212ENST00000481029 WDR97A6NE52 1622 aa25.53■■□□□ 1.68
FBXO18-212ENST00000481029 OSCARQ8IYS5 282 aa25.53■■□□□ 1.68
FBXO18-212ENST00000481029 FBLN2P98095 1184 aa25.45■■□□□ 1.66
FBXO18-212ENST00000481029 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.44■■□□□ 1.66
FBXO18-212ENST00000481029 CHD1O14646 1710 aa25.43■■□□□ 1.66
FBXO18-212ENST00000481029 GRIN2BQ13224 1484 aa25.41■■□□□ 1.66
FBXO18-212ENST00000481029 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.41■■□□□ 1.66
FBXO18-212ENST00000481029 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.41■■□□□ 1.66
FBXO18-212ENST00000481029 PBRM1Q86U86 1689 aa25.41■■□□□ 1.66
FBXO18-212ENST00000481029 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.37■■□□□ 1.65
FBXO18-212ENST00000481029 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
FBXO18-212ENST00000481029 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
FBXO18-212ENST00000481029 SYNJ2O15056 1496 aa25.25■■□□□ 1.63
FBXO18-212ENST00000481029 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.16■■□□□ 1.62
FBXO18-212ENST00000481029 ADAMTS12P58397 1594 aa25.15■■□□□ 1.62
FBXO18-212ENST00000481029 TRIM41Q8WV44 630 aa25.15■■□□□ 1.62
FBXO18-212ENST00000481029 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.14■■□□□ 1.61
FBXO18-212ENST00000481029 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.14■■□□□ 1.61
FBXO18-212ENST00000481029 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.14■■□□□ 1.61
FBXO18-212ENST00000481029 ARHGEF11O15085 1522 aa25.1■■□□□ 1.61
FBXO18-212ENST00000481029 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.1■■□□□ 1.61
FBXO18-212ENST00000481029 KIF27Q86VH2 1401 aa25.09■■□□□ 1.61
FBXO18-212ENST00000481029 GRIN2AQ12879 1464 aa25.08■■□□□ 1.6
FBXO18-212ENST00000481029 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.07■■□□□ 1.6
FBXO18-212ENST00000481029 CUL7Q14999 1698 aa24.96■■□□□ 1.59
FBXO18-212ENST00000481029 CEP170Q5SW79 1584 aa24.96■■□□□ 1.59
FBXO18-212ENST00000481029 IGF1RP08069 1367 aa24.93■■□□□ 1.58
FBXO18-212ENST00000481029 NUP160Q12769 1436 aa24.93■■□□□ 1.58
FBXO18-212ENST00000481029 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.92■■□□□ 1.58
FBXO18-212ENST00000481029 ARAP1Q96P48 1450 aa24.88■■□□□ 1.57
FBXO18-212ENST00000481029 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.84■■□□□ 1.57
FBXO18-212ENST00000481029 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.8■■□□□ 1.56
FBXO18-212ENST00000481029 SHROOM2Q13796 1616 aa24.76■■□□□ 1.55
FBXO18-212ENST00000481029 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.73■■□□□ 1.55
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