RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480955.1

UBA5-209, Transcript of ubiquitin like modifier activating enzyme 5, humanhuman

TSL 2

Gene UBA5, Length 894 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA5-209ENST00000480955 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.65■■■■■ 6.34
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UBA5-209ENST00000480955 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.62■■■■■ 4.89
UBA5-209ENST00000480955 NACADO15069 1562 aa45.61■■■■■ 4.89
UBA5-209ENST00000480955 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.58■■■■■ 4.89
UBA5-209ENST00000480955 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.54■■■■■ 4.88
UBA5-209ENST00000480955 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.41■■■■■ 4.86
UBA5-209ENST00000480955 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.28■■■■■ 4.84
UBA5-209ENST00000480955 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.58■■■■■ 4.73
UBA5-209ENST00000480955 SCRIBQ14160 1630 aa44.28■■■■■ 4.68
UBA5-209ENST00000480955 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.14■■■■■ 4.66
UBA5-209ENST00000480955 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.1■■■■■ 4.65
UBA5-209ENST00000480955 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.82■■■■■ 4.6
UBA5-209ENST00000480955 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.35■■■■■ 4.53
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UBA5-209ENST00000480955 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.76■■■■■ 4.44
UBA5-209ENST00000480955 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.49■■■■■ 4.39
UBA5-209ENST00000480955 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.4■■■■■ 4.38
UBA5-209ENST00000480955 SMARCA4P51532 1647 aa42.4■■■■■ 4.38
UBA5-209ENST00000480955 SMARCA2P51531 1590 aa42.11■■■■■ 4.33
UBA5-209ENST00000480955 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.09■■■■■ 4.33
UBA5-209ENST00000480955 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.06■■■■■ 4.32
UBA5-209ENST00000480955 NCAPD3P42695 1498 aa42.02■■■■■ 4.32
UBA5-209ENST00000480955 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.98■■■■■ 4.31
UBA5-209ENST00000480955 HMGXB3Q12766 1538 aa41.89■■■■■ 4.3
UBA5-209ENST00000480955 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.79■■■■■ 4.28
UBA5-209ENST00000480955 WIZO95785 1651 aa41.68■■■■■ 4.26
UBA5-209ENST00000480955 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.68■■■■■ 4.26
UBA5-209ENST00000480955 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.28■■■■■ 4.2
UBA5-209ENST00000480955 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.95■■■■■ 4.15
UBA5-209ENST00000480955 NESP48681 1621 aa40.89■■■■■ 4.14
UBA5-209ENST00000480955 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.81■■■■■ 4.12
UBA5-209ENST00000480955 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.78■■■■■ 4.12
UBA5-209ENST00000480955 ERCC6Q03468 1493 aa40.76■■■■■ 4.12
UBA5-209ENST00000480955 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.74■■■■■ 4.11
UBA5-209ENST00000480955 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.65■■■■■ 4.1
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UBA5-209ENST00000480955 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.52■■■■■ 4.08
UBA5-209ENST00000480955 PRDM2Q13029 1718 aa40.47■■■■■ 4.07
UBA5-209ENST00000480955 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.35■■■■■ 4.05
UBA5-209ENST00000480955 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.32■■■■■ 4.04
UBA5-209ENST00000480955 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.31■■■■■ 4.04
UBA5-209ENST00000480955 CUX2O14529 1486 aa40.26■■■■■ 4.03
UBA5-209ENST00000480955 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.2■■■■■ 4.03
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UBA5-209ENST00000480955 TOPBP1Q92547 1522 aa39.73■■■■□ 3.95
UBA5-209ENST00000480955 CUX1P39880 1505 aa39.49■■■■□ 3.91
UBA5-209ENST00000480955 IFT140Q96RY7 1462 aa39.46■■■■□ 3.91
UBA5-209ENST00000480955 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.39■■■■□ 3.9
UBA5-209ENST00000480955 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.35■■■■□ 3.89
UBA5-209ENST00000480955 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.34■■■■□ 3.89
UBA5-209ENST00000480955 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.29■■■■□ 3.88
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UBA5-209ENST00000480955 SOGA1O94964 1423 aa39.24■■■■□ 3.87
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UBA5-209ENST00000480955 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.18■■■■□ 3.86
UBA5-209ENST00000480955 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.17■■■■□ 3.86
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UBA5-209ENST00000480955 WDR97A6NE52 1622 aa39.09■■■■□ 3.85
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UBA5-209ENST00000480955 GRIN2BQ13224 1484 aa38.79■■■■□ 3.8
UBA5-209ENST00000480955 PBRM1Q86U86 1689 aa38.78■■■■□ 3.8
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UBA5-209ENST00000480955 CHD1O14646 1710 aa38.62■■■■□ 3.77
UBA5-209ENST00000480955 OSCARQ8IYS5 282 aa38.59■■■■□ 3.77
UBA5-209ENST00000480955 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.56■■■■□ 3.76
UBA5-209ENST00000480955 TRIM41Q8WV44 630 aa38.55■■■■□ 3.76
UBA5-209ENST00000480955 KIF27Q86VH2 1401 aa38.54■■■■□ 3.76
UBA5-209ENST00000480955 FBLN2P98095 1184 aa38.52■■■■□ 3.76
UBA5-209ENST00000480955 SYNJ2O15056 1496 aa38.51■■■■□ 3.76
UBA5-209ENST00000480955 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.47■■■■□ 3.75
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UBA5-209ENST00000480955 IGF1RP08069 1367 aa38.27■■■■□ 3.72
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UBA5-209ENST00000480955 NUP160Q12769 1436 aa38.08■■■■□ 3.69
UBA5-209ENST00000480955 CEP170Q5SW79 1584 aa38.06■■■■□ 3.68
UBA5-209ENST00000480955 EEA1Q15075 1411 aa37.97■■■■□ 3.67
UBA5-209ENST00000480955 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.96■■■■□ 3.67
UBA5-209ENST00000480955 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.96■■■■□ 3.67
UBA5-209ENST00000480955 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.96■■■■□ 3.67
UBA5-209ENST00000480955 ARHGEF11O15085 1522 aa37.96■■■■□ 3.67
UBA5-209ENST00000480955 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.91■■■■□ 3.66
UBA5-209ENST00000480955 SHROOM2Q13796 1616 aa37.81■■■■□ 3.64
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