RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480936.1

SLBP-203, Transcript of stem-loop binding protein, humanhuman

TSL 4

Gene SLBP, Length 558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLBP-203ENST00000480936 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.32■■■■■ 7.09
SLBP-203ENST00000480936 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.04■■■■■ 6.08
SLBP-203ENST00000480936 ABCC9O60706 1549 aa52.52■■■■■ 6
SLBP-203ENST00000480936 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.26■■■■■ 5.64
SLBP-203ENST00000480936 NACADO15069 1562 aa50.07■■■■■ 5.61
SLBP-203ENST00000480936 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.68■■■■■ 5.54
SLBP-203ENST00000480936 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.63■■■■■ 5.54
SLBP-203ENST00000480936 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.28■■■■■ 5.48
SLBP-203ENST00000480936 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.12■■■■■ 5.45
SLBP-203ENST00000480936 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.03■■■■■ 5.44
SLBP-203ENST00000480936 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.95■■■■■ 5.43
SLBP-203ENST00000480936 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.92■■■■■ 5.42
SLBP-203ENST00000480936 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.79■■■■■ 5.4
SLBP-203ENST00000480936 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.31■■■■■ 5.32
SLBP-203ENST00000480936 SCRIBQ14160 1630 aa48.25■■■■■ 5.31
SLBP-203ENST00000480936 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.55■■■■■ 5.2
SLBP-203ENST00000480936 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.5■■■■■ 5.19
SLBP-203ENST00000480936 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.33■■■■■ 5.17
SLBP-203ENST00000480936 NCAPD3P42695 1498 aa46.25■■■■■ 4.99
SLBP-203ENST00000480936 SMARCA4P51532 1647 aa46.14■■■■■ 4.98
SLBP-203ENST00000480936 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.12■■■■■ 4.97
SLBP-203ENST00000480936 SMARCA2P51531 1590 aa46.01■■■■■ 4.96
SLBP-203ENST00000480936 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.01■■■■■ 4.96
SLBP-203ENST00000480936 HMGXB3Q12766 1538 aa45.93■■■■■ 4.94
SLBP-203ENST00000480936 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.79■■■■■ 4.92
SLBP-203ENST00000480936 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.67■■■■■ 4.9
SLBP-203ENST00000480936 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.66■■■■■ 4.9
SLBP-203ENST00000480936 ERCC6Q03468 1493 aa45.33■■■■■ 4.85
SLBP-203ENST00000480936 NESP48681 1621 aa45.25■■■■■ 4.83
SLBP-203ENST00000480936 CUX2O14529 1486 aa45.21■■■■■ 4.83
SLBP-203ENST00000480936 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.09■■■■■ 4.81
SLBP-203ENST00000480936 WIZO95785 1651 aa45.09■■■■■ 4.81
SLBP-203ENST00000480936 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.92■■■■■ 4.78
SLBP-203ENST00000480936 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.82■■■■■ 4.77
SLBP-203ENST00000480936 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.82■■■■■ 4.77
SLBP-203ENST00000480936 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.76■■■■■ 4.76
SLBP-203ENST00000480936 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.66■■■■■ 4.74
SLBP-203ENST00000480936 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.65■■■■■ 4.74
SLBP-203ENST00000480936 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.64■■■■■ 4.74
SLBP-203ENST00000480936 CFTRP13569 1480 aa44.42■■■■■ 4.7
SLBP-203ENST00000480936 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.39■■■■■ 4.7
SLBP-203ENST00000480936 WDR62O43379 1518 aa44.29■■■■■ 4.68
SLBP-203ENST00000480936 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.28■■■■■ 4.68
SLBP-203ENST00000480936 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.27■■■■■ 4.68
SLBP-203ENST00000480936 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.1■■■■■ 4.65
SLBP-203ENST00000480936 PRDM2Q13029 1718 aa43.9■■■■■ 4.62
SLBP-203ENST00000480936 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.89■■■■■ 4.62
SLBP-203ENST00000480936 TOPBP1Q92547 1522 aa43.49■■■■■ 4.55
SLBP-203ENST00000480936 ABCC8Q09428 1581 aa43.48■■■■■ 4.55
SLBP-203ENST00000480936 IFT140Q96RY7 1462 aa43.41■■■■■ 4.54
SLBP-203ENST00000480936 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.37■■■■■ 4.53
SLBP-203ENST00000480936 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.25■■■■■ 4.51
SLBP-203ENST00000480936 OSCARQ8IYS5 282 aa43.16■■■■■ 4.5
SLBP-203ENST00000480936 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.08■■■■■ 4.49
SLBP-203ENST00000480936 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.08■■■■■ 4.49
SLBP-203ENST00000480936 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.08■■■■■ 4.49
SLBP-203ENST00000480936 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.03■■■■■ 4.48
SLBP-203ENST00000480936 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.9■■■■■ 4.461e-7■■■■■ 26.8
SLBP-203ENST00000480936 CUX1P39880 1505 aa42.89■■■■■ 4.46
SLBP-203ENST00000480936 SOGA1O94964 1423 aa42.88■■■■■ 4.45
SLBP-203ENST00000480936 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.87■■■■■ 4.45
SLBP-203ENST00000480936 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.85■■■■■ 4.45
SLBP-203ENST00000480936 WDR97A6NE52 1622 aa42.75■■■■■ 4.43
SLBP-203ENST00000480936 TRIM41Q8WV44 630 aa42.72■■■■■ 4.43
SLBP-203ENST00000480936 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.7■■■■■ 4.43
SLBP-203ENST00000480936 CHD1O14646 1710 aa42.56■■■■■ 4.4
SLBP-203ENST00000480936 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.51■■■■■ 4.4
SLBP-203ENST00000480936 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.51■■■■■ 4.4
SLBP-203ENST00000480936 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.51■■■■■ 4.4
SLBP-203ENST00000480936 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.49■■■■■ 4.39
SLBP-203ENST00000480936 GRIN2BQ13224 1484 aa42.48■■■■■ 4.39
SLBP-203ENST00000480936 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.47■■■■■ 4.39
SLBP-203ENST00000480936 ARHGEF11O15085 1522 aa42.46■■■■■ 4.39
SLBP-203ENST00000480936 FBLN2P98095 1184 aa42.45■■■■■ 4.39
SLBP-203ENST00000480936 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.45■■■■■ 4.39
SLBP-203ENST00000480936 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.36■■■■■ 4.37
SLBP-203ENST00000480936 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.35■■■■■ 4.37
SLBP-203ENST00000480936 TOP2BQ02880 1626 aa42.34■■■■■ 4.37
SLBP-203ENST00000480936 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.32■■■■■ 4.37
SLBP-203ENST00000480936 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.31■■■■■ 4.36
SLBP-203ENST00000480936 SYNJ2O15056 1496 aa42.3■■■■■ 4.36
SLBP-203ENST00000480936 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.29■■■■■ 4.36
SLBP-203ENST00000480936 SYNJ1O43426 1573 aa42.26■■■■■ 4.36
SLBP-203ENST00000480936 PBRM1Q86U86 1689 aa42.25■■■■■ 4.35
SLBP-203ENST00000480936 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.21■■■■■ 4.35
SLBP-203ENST00000480936 ARAP1Q96P48 1450 aa42.08■■■■■ 4.33
SLBP-203ENST00000480936 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.06■■■■■ 4.32
SLBP-203ENST00000480936 ADAMTS12P58397 1594 aa41.95■■■■■ 4.31
SLBP-203ENST00000480936 GRIN2AQ12879 1464 aa41.93■■■■■ 4.3
SLBP-203ENST00000480936 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.92■■■■■ 4.3
SLBP-203ENST00000480936 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.88■■■■■ 4.3
SLBP-203ENST00000480936 NUP160Q12769 1436 aa41.82■■■■■ 4.29
SLBP-203ENST00000480936 CEP170Q5SW79 1584 aa41.73■■■■■ 4.27
SLBP-203ENST00000480936 SHROOM2Q13796 1616 aa41.55■■■■■ 4.24
SLBP-203ENST00000480936 KIF27Q86VH2 1401 aa41.52■■■■■ 4.24
SLBP-203ENST00000480936 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.5■■■■■ 4.23
SLBP-203ENST00000480936 IGF1RP08069 1367 aa41.47■■■■■ 4.23
SLBP-203ENST00000480936 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.4■■■■■ 4.22
SLBP-203ENST00000480936 CUL7Q14999 1698 aa41.36■■■■■ 4.21
SLBP-203ENST00000480936 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.35■■■■■ 4.21
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