RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480093.1

PRADC1-203, Transcript of protease associated domain containing 1, humanhuman

TSL 5

Gene PRADC1, Length 600 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRADC1-203ENST00000480093 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.73■■■■■ 7.15
PRADC1-203ENST00000480093 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.28■■■■■ 6.12
PRADC1-203ENST00000480093 ABCC9O60706 1549 aa52.8■■■■■ 6.04
PRADC1-203ENST00000480093 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.44■■■■■ 5.67
PRADC1-203ENST00000480093 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.27■■■■■ 5.64
PRADC1-203ENST00000480093 NACADO15069 1562 aa50.23■■■■■ 5.63
PRADC1-203ENST00000480093 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.7■■■■■ 5.55
PRADC1-203ENST00000480093 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.63■■■■■ 5.54
PRADC1-203ENST00000480093 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.33■■■■■ 5.49
PRADC1-203ENST00000480093 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.31■■■■■ 5.48
PRADC1-203ENST00000480093 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.28■■■■■ 5.48
PRADC1-203ENST00000480093 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.98■■■■■ 5.43
PRADC1-203ENST00000480093 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.96■■■■■ 5.43
PRADC1-203ENST00000480093 SCRIBQ14160 1630 aa48.69■■■■■ 5.39
PRADC1-203ENST00000480093 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.28■■■■■ 5.32
PRADC1-203ENST00000480093 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.72■■■■■ 5.23
PRADC1-203ENST00000480093 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.67■■■■■ 5.22
PRADC1-203ENST00000480093 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.45■■■■■ 5.19
PRADC1-203ENST00000480093 SMARCA4P51532 1647 aa46.46■■■■■ 5.03
PRADC1-203ENST00000480093 NCAPD3P42695 1498 aa46.38■■■■■ 5.01
PRADC1-203ENST00000480093 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.36■■■■■ 5.01
PRADC1-203ENST00000480093 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.31■■■■■ 5
PRADC1-203ENST00000480093 SMARCA2P51531 1590 aa46.23■■■■■ 4.99
PRADC1-203ENST00000480093 HMGXB3Q12766 1538 aa46.08■■■■■ 4.97
PRADC1-203ENST00000480093 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.07■■■■■ 4.97
PRADC1-203ENST00000480093 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.96■■■■■ 4.95
PRADC1-203ENST00000480093 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.96■■■■■ 4.95
PRADC1-203ENST00000480093 WIZO95785 1651 aa45.56■■■■■ 4.88
PRADC1-203ENST00000480093 NESP48681 1621 aa45.53■■■■■ 4.88
PRADC1-203ENST00000480093 ERCC6Q03468 1493 aa45.51■■■■■ 4.88
PRADC1-203ENST00000480093 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.33■■■■■ 4.85
PRADC1-203ENST00000480093 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.23■■■■■ 4.83
PRADC1-203ENST00000480093 CUX2O14529 1486 aa45.15■■■■■ 4.82
PRADC1-203ENST00000480093 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.02■■■■■ 4.8
PRADC1-203ENST00000480093 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.99■■■■■ 4.79
PRADC1-203ENST00000480093 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.96■■■■■ 4.79
PRADC1-203ENST00000480093 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.93■■■■■ 4.78
PRADC1-203ENST00000480093 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.89■■■■■ 4.78
PRADC1-203ENST00000480093 CFTRP13569 1480 aa44.63■■■■■ 4.73
PRADC1-203ENST00000480093 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.55■■■■■ 4.72
PRADC1-203ENST00000480093 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.53■■■■■ 4.72
PRADC1-203ENST00000480093 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.51■■■■■ 4.72
PRADC1-203ENST00000480093 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.5■■■■■ 4.71
PRADC1-203ENST00000480093 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.45■■■■■ 4.71
PRADC1-203ENST00000480093 WDR62O43379 1518 aa44.4■■■■■ 4.7
PRADC1-203ENST00000480093 PRDM2Q13029 1718 aa44.21■■■■■ 4.67
PRADC1-203ENST00000480093 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.13■■■■■ 4.65
PRADC1-203ENST00000480093 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.88■■■■■ 4.62
PRADC1-203ENST00000480093 TOPBP1Q92547 1522 aa43.76■■■■■ 4.6
PRADC1-203ENST00000480093 ABCC8Q09428 1581 aa43.64■■■■■ 4.58
PRADC1-203ENST00000480093 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.63■■■■■ 4.58
PRADC1-203ENST00000480093 IFT140Q96RY7 1462 aa43.57■■■■■ 4.57
PRADC1-203ENST00000480093 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.5■■■■■ 4.55
PRADC1-203ENST00000480093 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.35■■■■■ 4.53
PRADC1-203ENST00000480093 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.3■■■■■ 4.52
PRADC1-203ENST00000480093 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.27■■■■■ 4.52
PRADC1-203ENST00000480093 CUX1P39880 1505 aa43.25■■■■■ 4.51
PRADC1-203ENST00000480093 OSCARQ8IYS5 282 aa43.23■■■■■ 4.51
PRADC1-203ENST00000480093 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.22■■■■■ 4.51
PRADC1-203ENST00000480093 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.19■■■■■ 4.51
PRADC1-203ENST00000480093 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.19■■■■■ 4.5
PRADC1-203ENST00000480093 SOGA1O94964 1423 aa43.17■■■■■ 4.5
PRADC1-203ENST00000480093 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.03■■■■■ 4.48
PRADC1-203ENST00000480093 TRIM41Q8WV44 630 aa42.86■■■■■ 4.45
PRADC1-203ENST00000480093 CHD1O14646 1710 aa42.83■■■■■ 4.45
PRADC1-203ENST00000480093 WDR97A6NE52 1622 aa42.83■■■■■ 4.45
PRADC1-203ENST00000480093 FBLN2P98095 1184 aa42.82■■■■■ 4.45
PRADC1-203ENST00000480093 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.76■■■■■ 4.44
PRADC1-203ENST00000480093 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.75■■■■■ 4.43
PRADC1-203ENST00000480093 SYNJ1O43426 1573 aa42.7■■■■■ 4.43
PRADC1-203ENST00000480093 GRIN2BQ13224 1484 aa42.7■■■■■ 4.43
PRADC1-203ENST00000480093 TOP2BQ02880 1626 aa42.69■■■■■ 4.42
PRADC1-203ENST00000480093 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.69■■■■■ 4.42
PRADC1-203ENST00000480093 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.68■■■■■ 4.42
PRADC1-203ENST00000480093 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.65■■■■■ 4.42
PRADC1-203ENST00000480093 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.62■■■■■ 4.41
PRADC1-203ENST00000480093 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.61■■■■■ 4.41
PRADC1-203ENST00000480093 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.61■■■■■ 4.41
PRADC1-203ENST00000480093 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.61■■■■■ 4.41
PRADC1-203ENST00000480093 PBRM1Q86U86 1689 aa42.59■■■■■ 4.41
PRADC1-203ENST00000480093 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.57■■■■■ 4.41
PRADC1-203ENST00000480093 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.56■■■■■ 4.4
PRADC1-203ENST00000480093 ARHGEF11O15085 1522 aa42.55■■■■■ 4.4
PRADC1-203ENST00000480093 SYNJ2O15056 1496 aa42.49■■■■■ 4.39
PRADC1-203ENST00000480093 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.34■■■■■ 4.37
PRADC1-203ENST00000480093 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.23■■■■■ 4.35
PRADC1-203ENST00000480093 ADAMTS12P58397 1594 aa42.22■■■■■ 4.35
PRADC1-203ENST00000480093 ARAP1Q96P48 1450 aa42.18■■■■■ 4.34
PRADC1-203ENST00000480093 GRIN2AQ12879 1464 aa42.17■■■■■ 4.34
PRADC1-203ENST00000480093 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.15■■■■■ 4.34
PRADC1-203ENST00000480093 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.12■■■■■ 4.33
PRADC1-203ENST00000480093 CEP170Q5SW79 1584 aa42■■■■■ 4.31
PRADC1-203ENST00000480093 NUP160Q12769 1436 aa41.98■■■■■ 4.31
PRADC1-203ENST00000480093 KIF27Q86VH2 1401 aa41.88■■■■■ 4.3
PRADC1-203ENST00000480093 IGF1RP08069 1367 aa41.8■■■■■ 4.28
PRADC1-203ENST00000480093 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.79■■■■■ 4.28
PRADC1-203ENST00000480093 SHROOM2Q13796 1616 aa41.71■■■■■ 4.27
PRADC1-203ENST00000480093 CUL7Q14999 1698 aa41.67■■■■■ 4.26
PRADC1-203ENST00000480093 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.61■■■■■ 4.25
PRADC1-203ENST00000480093 JPH4Q96JJ6 628 aa41.58■■■■■ 4.25
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