RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479577.1

SLC29A3-203, Transcript of solute carrier family 29 member 3, humanhuman

TSL 2

Gene SLC29A3, Length 749 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A3-203ENST00000479577 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.72■■■■■ 6.83
SLC29A3-203ENST00000479577 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.48■■■■■ 5.83
SLC29A3-203ENST00000479577 ABCC9O60706 1549 aa50.87■■■■■ 5.73
SLC29A3-203ENST00000479577 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.71■■■■■ 5.39
SLC29A3-203ENST00000479577 NACADO15069 1562 aa48.55■■■■■ 5.36
SLC29A3-203ENST00000479577 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.37■■■■■ 5.33
SLC29A3-203ENST00000479577 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.14■■■■■ 5.3
SLC29A3-203ENST00000479577 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48■■■■■ 5.27
SLC29A3-203ENST00000479577 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.75■■■■■ 5.23
SLC29A3-203ENST00000479577 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.47■■■■■ 5.19
SLC29A3-203ENST00000479577 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.45■■■■■ 5.19
SLC29A3-203ENST00000479577 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.25■■■■■ 5.15
SLC29A3-203ENST00000479577 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.12■■■■■ 5.13
SLC29A3-203ENST00000479577 SCRIBQ14160 1630 aa46.94■■■■■ 5.11
SLC29A3-203ENST00000479577 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.78■■■■■ 5.08
SLC29A3-203ENST00000479577 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.05■■■■■ 4.96
SLC29A3-203ENST00000479577 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.95■■■■■ 4.95
SLC29A3-203ENST00000479577 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.77■■■■■ 4.92
SLC29A3-203ENST00000479577 SMARCA4P51532 1647 aa44.86■■■■■ 4.77
SLC29A3-203ENST00000479577 NCAPD3P42695 1498 aa44.83■■■■■ 4.77
SLC29A3-203ENST00000479577 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.78■■■■■ 4.76
SLC29A3-203ENST00000479577 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.77■■■■■ 4.76
SLC29A3-203ENST00000479577 SMARCA2P51531 1590 aa44.69■■■■■ 4.74
SLC29A3-203ENST00000479577 HMGXB3Q12766 1538 aa44.55■■■■■ 4.72
SLC29A3-203ENST00000479577 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.47■■■■■ 4.71
SLC29A3-203ENST00000479577 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.46■■■■■ 4.71
SLC29A3-203ENST00000479577 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.38■■■■■ 4.69
SLC29A3-203ENST00000479577 WIZO95785 1651 aa43.91■■■■■ 4.62
SLC29A3-203ENST00000479577 ERCC6Q03468 1493 aa43.89■■■■■ 4.62
SLC29A3-203ENST00000479577 NESP48681 1621 aa43.87■■■■■ 4.61
SLC29A3-203ENST00000479577 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.82■■■■■ 4.6
SLC29A3-203ENST00000479577 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.69■■■■■ 4.58
SLC29A3-203ENST00000479577 CUX2O14529 1486 aa43.61■■■■■ 4.57
SLC29A3-203ENST00000479577 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.5■■■■■ 4.55
SLC29A3-203ENST00000479577 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.48■■■■■ 4.55
SLC29A3-203ENST00000479577 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.44■■■■■ 4.54
SLC29A3-203ENST00000479577 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.3■■■■■ 4.52
SLC29A3-203ENST00000479577 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.27■■■■■ 4.52
SLC29A3-203ENST00000479577 CFTRP13569 1480 aa43.14■■■■■ 4.5
SLC29A3-203ENST00000479577 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.03■■■■■ 4.48
SLC29A3-203ENST00000479577 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43■■■■■ 4.47
SLC29A3-203ENST00000479577 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.99■■■■■ 4.47
SLC29A3-203ENST00000479577 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.97■■■■■ 4.47
SLC29A3-203ENST00000479577 WDR62O43379 1518 aa42.89■■■■■ 4.46
SLC29A3-203ENST00000479577 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.81■■■■■ 4.44
SLC29A3-203ENST00000479577 PRDM2Q13029 1718 aa42.63■■■■■ 4.41
SLC29A3-203ENST00000479577 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.59■■■■■ 4.41
SLC29A3-203ENST00000479577 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.31■■■■■ 4.36
SLC29A3-203ENST00000479577 TOPBP1Q92547 1522 aa42.25■■■■■ 4.35
SLC29A3-203ENST00000479577 ABCC8Q09428 1581 aa42.21■■■■■ 4.35
SLC29A3-203ENST00000479577 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.14■■■■■ 4.34
SLC29A3-203ENST00000479577 IFT140Q96RY7 1462 aa42.11■■■■■ 4.33
SLC29A3-203ENST00000479577 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.95■■■■■ 4.31
SLC29A3-203ENST00000479577 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.87■■■■■ 4.29
SLC29A3-203ENST00000479577 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.8■■■■■ 4.28
SLC29A3-203ENST00000479577 CUX1P39880 1505 aa41.75■■■■■ 4.27
SLC29A3-203ENST00000479577 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.75■■■■■ 4.27
SLC29A3-203ENST00000479577 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.69■■■■■ 4.26
SLC29A3-203ENST00000479577 OSCARQ8IYS5 282 aa41.69■■■■■ 4.26
SLC29A3-203ENST00000479577 SOGA1O94964 1423 aa41.68■■■■■ 4.26
SLC29A3-203ENST00000479577 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.67■■■■■ 4.26
SLC29A3-203ENST00000479577 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.65■■■■■ 4.26
SLC29A3-203ENST00000479577 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.51■■■■■ 4.24
SLC29A3-203ENST00000479577 WDR97A6NE52 1622 aa41.46■■■■■ 4.23
SLC29A3-203ENST00000479577 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.32■■■■■ 4.21
SLC29A3-203ENST00000479577 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.27■■■■■ 4.2
SLC29A3-203ENST00000479577 GRIN2BQ13224 1484 aa41.27■■■■■ 4.2
SLC29A3-203ENST00000479577 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.27■■■■■ 4.2
SLC29A3-203ENST00000479577 TOP2BQ02880 1626 aa41.25■■■■■ 4.19
SLC29A3-203ENST00000479577 FBLN2P98095 1184 aa41.23■■■■■ 4.19
SLC29A3-203ENST00000479577 CHD1O14646 1710 aa41.23■■■■■ 4.19
SLC29A3-203ENST00000479577 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.22■■■■■ 4.19
SLC29A3-203ENST00000479577 SYNJ1O43426 1573 aa41.21■■■■■ 4.19
SLC29A3-203ENST00000479577 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.21■■■■■ 4.19
SLC29A3-203ENST00000479577 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.19■■■■■ 4.18
SLC29A3-203ENST00000479577 TRIM41Q8WV44 630 aa41.18■■■■■ 4.18
SLC29A3-203ENST00000479577 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.12■■■■■ 4.17
SLC29A3-203ENST00000479577 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.06■■■■■ 4.16
SLC29A3-203ENST00000479577 SYNJ2O15056 1496 aa41.05■■■■■ 4.16
SLC29A3-203ENST00000479577 PBRM1Q86U86 1689 aa41.04■■■■■ 4.16
SLC29A3-203ENST00000479577 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.04■■■■■ 4.16
SLC29A3-203ENST00000479577 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.04■■■■■ 4.16
SLC29A3-203ENST00000479577 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.04■■■■■ 4.16
SLC29A3-203ENST00000479577 ARHGEF11O15085 1522 aa41.03■■■■■ 4.16
SLC29A3-203ENST00000479577 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.88■■■■■ 4.13
SLC29A3-203ENST00000479577 ADAMTS12P58397 1594 aa40.78■■■■■ 4.12
SLC29A3-203ENST00000479577 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.76■■■■■ 4.12
SLC29A3-203ENST00000479577 GRIN2AQ12879 1464 aa40.72■■■■■ 4.11
SLC29A3-203ENST00000479577 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.71■■■■■ 4.11
SLC29A3-203ENST00000479577 ARAP1Q96P48 1450 aa40.68■■■■■ 4.1
SLC29A3-203ENST00000479577 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.66■■■■■ 4.1
SLC29A3-203ENST00000479577 NUP160Q12769 1436 aa40.58■■■■■ 4.09
SLC29A3-203ENST00000479577 CEP170Q5SW79 1584 aa40.52■■■■■ 4.08
SLC29A3-203ENST00000479577 KIF27Q86VH2 1401 aa40.5■■■■■ 4.07
SLC29A3-203ENST00000479577 IGF1RP08069 1367 aa40.39■■■■■ 4.06
SLC29A3-203ENST00000479577 SHROOM2Q13796 1616 aa40.27■■■■■ 4.04
SLC29A3-203ENST00000479577 CUL7Q14999 1698 aa40.26■■■■■ 4.04
SLC29A3-203ENST00000479577 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.25■■■■■ 4.03
SLC29A3-203ENST00000479577 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.19■■■■■ 4.02
SLC29A3-203ENST00000479577 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.13■■■■■ 4.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms