RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479152.1

PIGP-208, Transcript of phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class P, humanhuman

TSL 3

Gene PIGP, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIGP-208ENST00000479152 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.34■■■■■ 6.93
PIGP-208ENST00000479152 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.32■■■■■ 5.97
PIGP-208ENST00000479152 ABCC9O60706 1549 aa51.68■■■■■ 5.86
PIGP-208ENST00000479152 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.53■■■■■ 5.52
PIGP-208ENST00000479152 NACADO15069 1562 aa49.28■■■■■ 5.48
PIGP-208ENST00000479152 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.82■■■■■ 5.41
PIGP-208ENST00000479152 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.78■■■■■ 5.4
PIGP-208ENST00000479152 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.5■■■■■ 5.35
PIGP-208ENST00000479152 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.38■■■■■ 5.33
PIGP-208ENST00000479152 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.31■■■■■ 5.32
PIGP-208ENST00000479152 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.06■■■■■ 5.28
PIGP-208ENST00000479152 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.98■■■■■ 5.27
PIGP-208ENST00000479152 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.89■■■■■ 5.26
PIGP-208ENST00000479152 SCRIBQ14160 1630 aa47.59■■■■■ 5.21
PIGP-208ENST00000479152 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.58■■■■■ 5.21
PIGP-208ENST00000479152 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.81■■■■■ 5.08
PIGP-208ENST00000479152 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.78■■■■■ 5.08
PIGP-208ENST00000479152 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.55■■■■■ 5.04
PIGP-208ENST00000479152 SMARCA4P51532 1647 aa45.48■■■■■ 4.87
PIGP-208ENST00000479152 NCAPD3P42695 1498 aa45.42■■■■■ 4.86
PIGP-208ENST00000479152 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.34■■■■■ 4.85
PIGP-208ENST00000479152 SMARCA2P51531 1590 aa45.33■■■■■ 4.85
PIGP-208ENST00000479152 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.33■■■■■ 4.85
PIGP-208ENST00000479152 HMGXB3Q12766 1538 aa45.23■■■■■ 4.83
PIGP-208ENST00000479152 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.06■■■■■ 4.8
PIGP-208ENST00000479152 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.98■■■■■ 4.79
PIGP-208ENST00000479152 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.91■■■■■ 4.78
PIGP-208ENST00000479152 ERCC6Q03468 1493 aa44.67■■■■■ 4.74
PIGP-208ENST00000479152 NESP48681 1621 aa44.5■■■■■ 4.71
PIGP-208ENST00000479152 CUX2O14529 1486 aa44.49■■■■■ 4.71
PIGP-208ENST00000479152 WIZO95785 1651 aa44.42■■■■■ 4.7
PIGP-208ENST00000479152 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.41■■■■■ 4.7
PIGP-208ENST00000479152 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.13■■■■■ 4.65
PIGP-208ENST00000479152 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.11■■■■■ 4.65
PIGP-208ENST00000479152 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.08■■■■■ 4.65
PIGP-208ENST00000479152 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.06■■■■■ 4.64
PIGP-208ENST00000479152 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.03■■■■■ 4.64
PIGP-208ENST00000479152 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.98■■■■■ 4.63
PIGP-208ENST00000479152 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.75■■■■■ 4.59
PIGP-208ENST00000479152 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.7■■■■■ 4.59
PIGP-208ENST00000479152 CFTRP13569 1480 aa43.66■■■■■ 4.58
PIGP-208ENST00000479152 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.63■■■■■ 4.57
PIGP-208ENST00000479152 WDR62O43379 1518 aa43.61■■■■■ 4.57
PIGP-208ENST00000479152 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.57■■■■■ 4.56
PIGP-208ENST00000479152 PRDM2Q13029 1718 aa43.42■■■■■ 4.54
PIGP-208ENST00000479152 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.35■■■■■ 4.53
PIGP-208ENST00000479152 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.17■■■■■ 4.5
PIGP-208ENST00000479152 TOPBP1Q92547 1522 aa42.8■■■■■ 4.44
PIGP-208ENST00000479152 ABCC8Q09428 1581 aa42.78■■■■■ 4.44
PIGP-208ENST00000479152 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.74■■■■■ 4.43
PIGP-208ENST00000479152 IFT140Q96RY7 1462 aa42.73■■■■■ 4.43
PIGP-208ENST00000479152 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.52■■■■■ 4.4
PIGP-208ENST00000479152 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.44■■■■■ 4.39
PIGP-208ENST00000479152 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.41■■■■■ 4.38
PIGP-208ENST00000479152 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.39■■■■■ 4.38
PIGP-208ENST00000479152 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.36■■■■■ 4.37
PIGP-208ENST00000479152 OSCARQ8IYS5 282 aa42.35■■■■■ 4.37
PIGP-208ENST00000479152 CUX1P39880 1505 aa42.21■■■■■ 4.35
PIGP-208ENST00000479152 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.18■■■■■ 4.34
PIGP-208ENST00000479152 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.16■■■■■ 4.34
PIGP-208ENST00000479152 WDR97A6NE52 1622 aa42.15■■■■■ 4.34
PIGP-208ENST00000479152 SOGA1O94964 1423 aa42.14■■■■■ 4.34
PIGP-208ENST00000479152 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.14■■■■■ 4.34
PIGP-208ENST00000479152 CHD1O14646 1710 aa42.02■■■■■ 4.32
PIGP-208ENST00000479152 TRIM41Q8WV44 630 aa42.01■■■■■ 4.32
PIGP-208ENST00000479152 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.95■■■■■ 4.31
PIGP-208ENST00000479152 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.88■■■■■ 4.3
PIGP-208ENST00000479152 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.88■■■■■ 4.3
PIGP-208ENST00000479152 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.88■■■■■ 4.3
PIGP-208ENST00000479152 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.85■■■■■ 4.29
PIGP-208ENST00000479152 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.81■■■■■ 4.28
PIGP-208ENST00000479152 GRIN2BQ13224 1484 aa41.8■■■■■ 4.28
PIGP-208ENST00000479152 ARHGEF11O15085 1522 aa41.79■■■■■ 4.28
PIGP-208ENST00000479152 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.76■■■■■ 4.28
PIGP-208ENST00000479152 FBLN2P98095 1184 aa41.75■■■■■ 4.27
PIGP-208ENST00000479152 PBRM1Q86U86 1689 aa41.74■■■■■ 4.27
PIGP-208ENST00000479152 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.73■■■■■ 4.27
PIGP-208ENST00000479152 TOP2BQ02880 1626 aa41.71■■■■■ 4.27
PIGP-208ENST00000479152 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.71■■■■■ 4.27
PIGP-208ENST00000479152 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.7■■■■■ 4.27
PIGP-208ENST00000479152 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.68■■■■■ 4.26
PIGP-208ENST00000479152 SYNJ1O43426 1573 aa41.63■■■■■ 4.26
PIGP-208ENST00000479152 SYNJ2O15056 1496 aa41.63■■■■■ 4.25
PIGP-208ENST00000479152 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.56■■■■■ 4.24
PIGP-208ENST00000479152 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.55■■■■■ 4.24
PIGP-208ENST00000479152 ARAP1Q96P48 1450 aa41.4■■■■■ 4.22
PIGP-208ENST00000479152 ADAMTS12P58397 1594 aa41.37■■■■■ 4.21
PIGP-208ENST00000479152 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.29■■■■■ 4.2
PIGP-208ENST00000479152 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.28■■■■■ 4.2
PIGP-208ENST00000479152 GRIN2AQ12879 1464 aa41.28■■■■■ 4.2
PIGP-208ENST00000479152 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.19■■■■■ 4.18
PIGP-208ENST00000479152 NUP160Q12769 1436 aa41.11■■■■■ 4.17
PIGP-208ENST00000479152 CEP170Q5SW79 1584 aa41.1■■■■■ 4.17
PIGP-208ENST00000479152 SHROOM2Q13796 1616 aa40.93■■■■■ 4.14
PIGP-208ENST00000479152 KIF27Q86VH2 1401 aa40.87■■■■■ 4.13
PIGP-208ENST00000479152 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.83■■■■■ 4.13
PIGP-208ENST00000479152 CUL7Q14999 1698 aa40.82■■■■■ 4.13
PIGP-208ENST00000479152 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.79■■■■■ 4.12
PIGP-208ENST00000479152 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.71■■■■■ 4.11
PIGP-208ENST00000479152 IGF1RP08069 1367 aa40.69■■■■■ 4.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.9 ms