RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478714.1

FAM217A-205, Transcript of family with sequence similarity 217 member A, humanhuman

TSL 3

Gene FAM217A, Length 599 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM217A-205ENST00000478714 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.58■■■■■ 6.65
FAM217A-205ENST00000478714 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.76■■■■■ 5.72
FAM217A-205ENST00000478714 ABCC9O60706 1549 aa50.62■■■■■ 5.69
FAM217A-205ENST00000478714 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.26■■■■■ 5.32
FAM217A-205ENST00000478714 NACADO15069 1562 aa47.98■■■■■ 5.27
FAM217A-205ENST00000478714 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.63■■■■■ 5.22
FAM217A-205ENST00000478714 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.43■■■■■ 5.18
FAM217A-205ENST00000478714 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.39■■■■■ 5.18
FAM217A-205ENST00000478714 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.16■■■■■ 5.14
FAM217A-205ENST00000478714 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.13■■■■■ 5.14
FAM217A-205ENST00000478714 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.91■■■■■ 5.1
FAM217A-205ENST00000478714 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.86■■■■■ 5.09
FAM217A-205ENST00000478714 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.79■■■■■ 5.08
FAM217A-205ENST00000478714 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.3■■■■■ 5
FAM217A-205ENST00000478714 SCRIBQ14160 1630 aa46.18■■■■■ 4.98
FAM217A-205ENST00000478714 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.76■■■■■ 4.92
FAM217A-205ENST00000478714 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.7■■■■■ 4.91
FAM217A-205ENST00000478714 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.62■■■■■ 4.89
FAM217A-205ENST00000478714 NCAPD3P42695 1498 aa44.3■■■■■ 4.68
FAM217A-205ENST00000478714 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.15■■■■■ 4.66
FAM217A-205ENST00000478714 SMARCA4P51532 1647 aa44.11■■■■■ 4.65
FAM217A-205ENST00000478714 SMARCA2P51531 1590 aa44.04■■■■■ 4.64
FAM217A-205ENST00000478714 HMGXB3Q12766 1538 aa43.97■■■■■ 4.63
FAM217A-205ENST00000478714 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.92■■■■■ 4.62
FAM217A-205ENST00000478714 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.73■■■■■ 4.59
FAM217A-205ENST00000478714 ERCC6Q03468 1493 aa43.7■■■■■ 4.59
FAM217A-205ENST00000478714 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.7■■■■■ 4.59
FAM217A-205ENST00000478714 CUX2O14529 1486 aa43.66■■■■■ 4.58
FAM217A-205ENST00000478714 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.58■■■■■ 4.57
FAM217A-205ENST00000478714 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.54■■■■■ 4.56
FAM217A-205ENST00000478714 NESP48681 1621 aa43.51■■■■■ 4.56
FAM217A-205ENST00000478714 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.27■■■■■ 4.52
FAM217A-205ENST00000478714 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.08■■■■■ 4.49
FAM217A-205ENST00000478714 WIZO95785 1651 aa43.05■■■■■ 4.48
FAM217A-205ENST00000478714 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.02■■■■■ 4.48
FAM217A-205ENST00000478714 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.96■■■■■ 4.47
FAM217A-205ENST00000478714 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.93■■■■■ 4.46
FAM217A-205ENST00000478714 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.71■■■■■ 4.43
FAM217A-205ENST00000478714 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.62■■■■■ 4.41
FAM217A-205ENST00000478714 WDR62O43379 1518 aa42.53■■■■■ 4.4
FAM217A-205ENST00000478714 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.53■■■■■ 4.4
FAM217A-205ENST00000478714 CFTRP13569 1480 aa42.48■■■■■ 4.39
FAM217A-205ENST00000478714 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.46■■■■■ 4.39
FAM217A-205ENST00000478714 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.43■■■■■ 4.38
FAM217A-205ENST00000478714 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.06■■■■■ 4.32
FAM217A-205ENST00000478714 PRDM2Q13029 1718 aa42.05■■■■■ 4.32
FAM217A-205ENST00000478714 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.04■■■■■ 4.32
FAM217A-205ENST00000478714 OSCARQ8IYS5 282 aa41.66■■■■■ 4.26
FAM217A-205ENST00000478714 TOPBP1Q92547 1522 aa41.64■■■■■ 4.26
FAM217A-205ENST00000478714 IFT140Q96RY7 1462 aa41.63■■■■■ 4.25
FAM217A-205ENST00000478714 ABCC8Q09428 1581 aa41.59■■■■■ 4.25
FAM217A-205ENST00000478714 TRIM41Q8WV44 630 aa41.57■■■■■ 4.25
FAM217A-205ENST00000478714 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.53■■■■■ 4.24
FAM217A-205ENST00000478714 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.5■■■■■ 4.23
FAM217A-205ENST00000478714 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.31■■■■■ 4.2
FAM217A-205ENST00000478714 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.28■■■■■ 4.2
FAM217A-205ENST00000478714 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.21■■■■■ 4.19
FAM217A-205ENST00000478714 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.16■■■■■ 4.18
FAM217A-205ENST00000478714 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.09■■■■■ 4.17
FAM217A-205ENST00000478714 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.09■■■■■ 4.17
FAM217A-205ENST00000478714 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.09■■■■■ 4.17
FAM217A-205ENST00000478714 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.03■■■■■ 4.16
FAM217A-205ENST00000478714 SOGA1O94964 1423 aa41.02■■■■■ 4.16
FAM217A-205ENST00000478714 ARHGEF11O15085 1522 aa40.98■■■■■ 4.15
FAM217A-205ENST00000478714 CHD1O14646 1710 aa40.98■■■■■ 4.15
FAM217A-205ENST00000478714 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.96■■■■■ 4.15
FAM217A-205ENST00000478714 CUX1P39880 1505 aa40.93■■■■■ 4.14
FAM217A-205ENST00000478714 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.92■■■■■ 4.14
FAM217A-205ENST00000478714 WDR97A6NE52 1622 aa40.9■■■■■ 4.14
FAM217A-205ENST00000478714 FBLN2P98095 1184 aa40.84■■■■■ 4.13
FAM217A-205ENST00000478714 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.8■■■■■ 4.12
FAM217A-205ENST00000478714 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.74■■■■■ 4.11
FAM217A-205ENST00000478714 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.68■■■■■ 4.1
FAM217A-205ENST00000478714 GRIN2BQ13224 1484 aa40.67■■■■■ 4.1
FAM217A-205ENST00000478714 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.65■■■■■ 4.1
FAM217A-205ENST00000478714 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.59■■■■■ 4.09
FAM217A-205ENST00000478714 ARAP1Q96P48 1450 aa40.58■■■■■ 4.09
FAM217A-205ENST00000478714 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.54■■■■■ 4.08
FAM217A-205ENST00000478714 SYNJ2O15056 1496 aa40.54■■■■■ 4.08
FAM217A-205ENST00000478714 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.53■■■■■ 4.08
FAM217A-205ENST00000478714 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.53■■■■■ 4.08
FAM217A-205ENST00000478714 SYNJ1O43426 1573 aa40.52■■■■■ 4.08
FAM217A-205ENST00000478714 PBRM1Q86U86 1689 aa40.5■■■■■ 4.07
FAM217A-205ENST00000478714 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.45■■■■■ 4.07
FAM217A-205ENST00000478714 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.37■■■■■ 4.05
FAM217A-205ENST00000478714 TOP2BQ02880 1626 aa40.33■■■■■ 4.05
FAM217A-205ENST00000478714 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.32■■■■■ 4.05
FAM217A-205ENST00000478714 GRIN2AQ12879 1464 aa40.14■■■■■ 4.02
FAM217A-205ENST00000478714 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.14■■■■■ 4.02
FAM217A-205ENST00000478714 ADAMTS12P58397 1594 aa40.13■■■■■ 4.01
FAM217A-205ENST00000478714 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.03■■■■■ 4
FAM217A-205ENST00000478714 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.03■■■■■ 4
FAM217A-205ENST00000478714 NUP160Q12769 1436 aa40.03■■■■■ 4
FAM217A-205ENST00000478714 CEP170Q5SW79 1584 aa39.99■■■■□ 3.99
FAM217A-205ENST00000478714 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.88■■■■□ 3.97
FAM217A-205ENST00000478714 SHROOM2Q13796 1616 aa39.84■■■■□ 3.97
FAM217A-205ENST00000478714 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.6■■■■□ 3.93
FAM217A-205ENST00000478714 JPH4Q96JJ6 628 aa39.6■■■■□ 3.93
FAM217A-205ENST00000478714 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.56■■■■□ 3.92
FAM217A-205ENST00000478714 IGF1RP08069 1367 aa39.53■■■■□ 3.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 138 ms