RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478037.1

REXO4-205, Transcript of REX4 homolog, 3'-5' exonuclease, humanhuman

TSL 2

Gene REXO4, Length 847 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO4-205ENST00000478037 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.68■■■■■ 7.79
REXO4-205ENST00000478037 ABCC9O60706 1549 aa57.13■■■■■ 6.74
REXO4-205ENST00000478037 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa57.13■■■■■ 6.74
REXO4-205ENST00000478037 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.38■■■■■ 6.3
REXO4-205ENST00000478037 NACADO15069 1562 aa53.97■■■■■ 6.23
REXO4-205ENST00000478037 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.9■■■■■ 6.22
REXO4-205ENST00000478037 DNAJC5BQ9UF47 199 aa53.38■■■■■ 6.14
REXO4-205ENST00000478037 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP53.19■■■■■ 6.11
REXO4-205ENST00000478037 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.17■■■■■ 6.1
REXO4-205ENST00000478037 UNC13AQ9UPW8 1703 aa53.11■■■■■ 6.09
REXO4-205ENST00000478037 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.81■■■■■ 6.04
REXO4-205ENST00000478037 BICRAQ9NZM4 1560 aa52.71■■■■■ 6.03
REXO4-205ENST00000478037 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.54■■■■■ 6
REXO4-205ENST00000478037 SCRIBQ14160 1630 aa52.17■■■■■ 5.94
REXO4-205ENST00000478037 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52.01■■■■■ 5.92
REXO4-205ENST00000478037 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.57■■■■■ 5.85
REXO4-205ENST00000478037 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP51.47■■■■■ 5.83
REXO4-205ENST00000478037 CECR2Q9BXF3 1484 aa51.42■■■■■ 5.82
REXO4-205ENST00000478037 NCAPD3P42695 1498 aa49.78■■■■■ 5.56
REXO4-205ENST00000478037 SMARCA4P51532 1647 aa49.7■■■■■ 5.55
REXO4-205ENST00000478037 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.69■■■■■ 5.54
REXO4-205ENST00000478037 SMARCA2P51531 1590 aa49.6■■■■■ 5.53
REXO4-205ENST00000478037 HMGXB3Q12766 1538 aa49.47■■■■■ 5.51
REXO4-205ENST00000478037 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.46■■■■■ 5.51
REXO4-205ENST00000478037 ERCC6Q03468 1493 aa49.37■■■■■ 5.49
REXO4-205ENST00000478037 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.29■■■■■ 5.48
REXO4-205ENST00000478037 CUX2O14529 1486 aa49.14■■■■■ 5.46
REXO4-205ENST00000478037 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.13■■■■■ 5.46
REXO4-205ENST00000478037 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.1■■■■■ 5.45
REXO4-205ENST00000478037 NESP48681 1621 aa49.07■■■■■ 5.45
REXO4-205ENST00000478037 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa48.97■■■■■ 5.43
REXO4-205ENST00000478037 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.72■■■■■ 5.39
REXO4-205ENST00000478037 WIZO95785 1651 aa48.55■■■■■ 5.36
REXO4-205ENST00000478037 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.54■■■■■ 5.36
REXO4-205ENST00000478037 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.46■■■■■ 5.35
REXO4-205ENST00000478037 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.45■■■■■ 5.35
REXO4-205ENST00000478037 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.32■■■■■ 5.33
REXO4-205ENST00000478037 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.08■■■■■ 5.29
REXO4-205ENST00000478037 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.04■■■■■ 5.28
REXO4-205ENST00000478037 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.93■■■■■ 5.26
REXO4-205ENST00000478037 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.9■■■■■ 5.26
REXO4-205ENST00000478037 WDR62O43379 1518 aa47.88■■■■■ 5.26
REXO4-205ENST00000478037 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.82■■■■■ 5.25
REXO4-205ENST00000478037 CFTRP13569 1480 aa47.77■■■■■ 5.24
REXO4-205ENST00000478037 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.4■■■■■ 5.18
REXO4-205ENST00000478037 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.36■■■■■ 5.17
REXO4-205ENST00000478037 PRDM2Q13029 1718 aa47.36■■■■■ 5.17
REXO4-205ENST00000478037 TRIM41Q8WV44 630 aa47.05■■■■■ 5.12
REXO4-205ENST00000478037 OSCARQ8IYS5 282 aa46.93■■■■■ 5.1
REXO4-205ENST00000478037 TOPBP1Q92547 1522 aa46.91■■■■■ 5.1
REXO4-205ENST00000478037 IFT140Q96RY7 1462 aa46.89■■■■■ 5.1
REXO4-205ENST00000478037 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.81■■■■■ 5.08
REXO4-205ENST00000478037 ABCC8Q09428 1581 aa46.79■■■■■ 5.08
REXO4-205ENST00000478037 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.76■■■■■ 5.08
REXO4-205ENST00000478037 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP46.6■■■■■ 5.05
REXO4-205ENST00000478037 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.45■■■■■ 5.03
REXO4-205ENST00000478037 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.44■■■■■ 5.02
REXO4-205ENST00000478037 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.41■■■■■ 5.024e-6■■■■■ 31
REXO4-205ENST00000478037 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa46.33■■■■■ 5.01
REXO4-205ENST00000478037 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa46.33■■■■■ 5.01
REXO4-205ENST00000478037 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa46.33■■■■■ 5.01
REXO4-205ENST00000478037 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.29■■■■■ 5
REXO4-205ENST00000478037 CHD1O14646 1710 aa46.24■■■■■ 4.99
REXO4-205ENST00000478037 SOGA1O94964 1423 aa46.24■■■■■ 4.99
REXO4-205ENST00000478037 FBLN2P98095 1184 aa46.2■■■■■ 4.99
REXO4-205ENST00000478037 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.19■■■■■ 4.99
REXO4-205ENST00000478037 ARHGEF11O15085 1522 aa46.18■■■■■ 4.98
REXO4-205ENST00000478037 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.18■■■■■ 4.98
REXO4-205ENST00000478037 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.15■■■■■ 4.98
REXO4-205ENST00000478037 CUX1P39880 1505 aa46.13■■■■■ 4.98
REXO4-205ENST00000478037 WDR97A6NE52 1622 aa45.99■■■■■ 4.95
REXO4-205ENST00000478037 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.98■■■■■ 4.95
REXO4-205ENST00000478037 CYB5RLQ6IPT4 315 aa45.87■■■■■ 4.93
REXO4-205ENST00000478037 GRIN2BQ13224 1484 aa45.83■■■■■ 4.93
REXO4-205ENST00000478037 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.81■■■■■ 4.92
REXO4-205ENST00000478037 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.81■■■■■ 4.92
REXO4-205ENST00000478037 ARAP1Q96P48 1450 aa45.74■■■■■ 4.91
REXO4-205ENST00000478037 SYNJ1O43426 1573 aa45.7■■■■■ 4.91
REXO4-205ENST00000478037 PBRM1Q86U86 1689 aa45.69■■■■■ 4.91
REXO4-205ENST00000478037 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.68■■■■■ 4.9
REXO4-205ENST00000478037 SYNJ2O15056 1496 aa45.67■■■■■ 4.9
REXO4-205ENST00000478037 CLASP1Q7Z460 1538 aa45.64■■■■■ 4.9
REXO4-205ENST00000478037 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.62■■■■■ 4.89
REXO4-205ENST00000478037 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.56■■■■■ 4.88
REXO4-205ENST00000478037 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.49■■■■■ 4.87
REXO4-205ENST00000478037 TRHP20396 242 aaPredicted RBP45.43■■■■■ 4.86
REXO4-205ENST00000478037 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.41■■■■■ 4.86
REXO4-205ENST00000478037 TOP2BQ02880 1626 aa45.41■■■■■ 4.86
REXO4-205ENST00000478037 ADAMTS12P58397 1594 aa45.24■■■■■ 4.83
REXO4-205ENST00000478037 GRIN2AQ12879 1464 aa45.24■■■■■ 4.83
REXO4-205ENST00000478037 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.09■■■■■ 4.81
REXO4-205ENST00000478037 CEP170Q5SW79 1584 aa45.08■■■■■ 4.81
REXO4-205ENST00000478037 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.06■■■■■ 4.8
REXO4-205ENST00000478037 NUP160Q12769 1436 aa45.03■■■■■ 4.8
REXO4-205ENST00000478037 ERCC6L2Q5T890 1561 aa44.98■■■■■ 4.79
REXO4-205ENST00000478037 SHROOM2Q13796 1616 aa44.83■■■■■ 4.77
REXO4-205ENST00000478037 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP44.67■■■■■ 4.74
REXO4-205ENST00000478037 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.6■■■■■ 4.73
REXO4-205ENST00000478037 JPH4Q96JJ6 628 aa44.6■■■■■ 4.73
REXO4-205ENST00000478037 KIF27Q86VH2 1401 aa44.57■■■■■ 4.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.3 ms