RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477624.1

TMA7-202, Transcript of translation machinery associated 7 homolog, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TMA7, Length 619 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMA7-202ENST00000477624 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.36■■■■■ 6.13
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TMA7-202ENST00000477624 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.37■■■■■ 4.53
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TMA7-202ENST00000477624 SMARCA2P51531 1590 aa41.49■■■■■ 4.23
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TMA7-202ENST00000477624 CUX2O14529 1486 aa41.35■■■■■ 4.21
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TMA7-202ENST00000477624 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.3■■■■■ 4.04
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TMA7-202ENST00000477624 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.11■■■■■ 4.01
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TMA7-202ENST00000477624 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.01■■■■□ 3.84
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TMA7-202ENST00000477624 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.89■■■■□ 3.82
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TMA7-202ENST00000477624 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.79■■■■□ 3.8
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TMA7-202ENST00000477624 FBLN2P98095 1184 aa38.77■■■■□ 3.8
TMA7-202ENST00000477624 CHD1O14646 1710 aa38.77■■■■□ 3.8
TMA7-202ENST00000477624 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.71■■■■□ 3.79
TMA7-202ENST00000477624 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.68■■■■□ 3.78
TMA7-202ENST00000477624 CUX1P39880 1505 aa38.66■■■■□ 3.78
TMA7-202ENST00000477624 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.54■■■■□ 3.76
TMA7-202ENST00000477624 ARAP1Q96P48 1450 aa38.54■■■■□ 3.76
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TMA7-202ENST00000477624 WDR97A6NE52 1622 aa38.42■■■■□ 3.74
TMA7-202ENST00000477624 GRIN2BQ13224 1484 aa38.4■■■■□ 3.74
TMA7-202ENST00000477624 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.37■■■■□ 3.73
TMA7-202ENST00000477624 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.36■■■■□ 3.73
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TMA7-202ENST00000477624 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.21■■■■□ 3.71
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TMA7-202ENST00000477624 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.03■■■■□ 3.68
TMA7-202ENST00000477624 TOP2BQ02880 1626 aa37.94■■■■□ 3.66
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TMA7-202ENST00000477624 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.68■■■■□ 3.62
TMA7-202ENST00000477624 SHROOM2Q13796 1616 aa37.61■■■■□ 3.61
TMA7-202ENST00000477624 JPH4Q96JJ6 628 aa37.51■■■■□ 3.6
TMA7-202ENST00000477624 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.49■■■■□ 3.59
TMA7-202ENST00000477624 IGF1RP08069 1367 aa37.34■■■■□ 3.57
TMA7-202ENST00000477624 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.31■■■■□ 3.56
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