RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477195.1

DLGAP4-207, Transcript of DLG associated protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene DLGAP4, Length 490 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLGAP4-207ENST00000477195 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.95■■■□□ 2.38
DLGAP4-207ENST00000477195 ABCC9O60706 1549 aa27.02■■□□□ 1.92
DLGAP4-207ENST00000477195 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.88■■□□□ 1.89
DLGAP4-207ENST00000477195 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.56■■□□□ 1.68
DLGAP4-207ENST00000477195 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.36■■□□□ 1.65
DLGAP4-207ENST00000477195 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.34■■□□□ 1.65
DLGAP4-207ENST00000477195 NACADO15069 1562 aa25.34■■□□□ 1.65
DLGAP4-207ENST00000477195 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.23■■□□□ 1.63
DLGAP4-207ENST00000477195 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.14■■□□□ 1.62
DLGAP4-207ENST00000477195 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.94■■□□□ 1.58
DLGAP4-207ENST00000477195 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.87■■□□□ 1.57
DLGAP4-207ENST00000477195 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
DLGAP4-207ENST00000477195 SCRIBQ14160 1630 aa24.68■■□□□ 1.54
DLGAP4-207ENST00000477195 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.61■■□□□ 1.53
DLGAP4-207ENST00000477195 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.38■■□□□ 1.49
DLGAP4-207ENST00000477195 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.32■■□□□ 1.48
DLGAP4-207ENST00000477195 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
DLGAP4-207ENST00000477195 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.25■■□□□ 1.47
DLGAP4-207ENST00000477195 SMARCA4P51532 1647 aa23.44■■□□□ 1.34
DLGAP4-207ENST00000477195 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.39■■□□□ 1.34
DLGAP4-207ENST00000477195 NCAPD3P42695 1498 aa23.37■■□□□ 1.33
DLGAP4-207ENST00000477195 SMARCA2P51531 1590 aa23.27■■□□□ 1.32
DLGAP4-207ENST00000477195 HMGXB3Q12766 1538 aa23.25■■□□□ 1.31
DLGAP4-207ENST00000477195 NESP48681 1621 aa23.25■■□□□ 1.31
DLGAP4-207ENST00000477195 ERCC6Q03468 1493 aa23.24■■□□□ 1.31
DLGAP4-207ENST00000477195 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
DLGAP4-207ENST00000477195 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.18■■□□□ 1.3
DLGAP4-207ENST00000477195 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
DLGAP4-207ENST00000477195 CUX2O14529 1486 aa23.1■■□□□ 1.29
DLGAP4-207ENST00000477195 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.1■■□□□ 1.29
DLGAP4-207ENST00000477195 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.09■■□□□ 1.29
DLGAP4-207ENST00000477195 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.99■■□□□ 1.27
DLGAP4-207ENST00000477195 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
DLGAP4-207ENST00000477195 WIZO95785 1651 aa22.97■■□□□ 1.27
DLGAP4-207ENST00000477195 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.9■■□□□ 1.26
DLGAP4-207ENST00000477195 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.7■■□□□ 1.22
DLGAP4-207ENST00000477195 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.67■■□□□ 1.22
DLGAP4-207ENST00000477195 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.61■■□□□ 1.21
DLGAP4-207ENST00000477195 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
DLGAP4-207ENST00000477195 WDR62O43379 1518 aa22.57■■□□□ 1.2
DLGAP4-207ENST00000477195 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
DLGAP4-207ENST00000477195 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.53■■□□□ 1.2
DLGAP4-207ENST00000477195 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.51■■□□□ 1.19
DLGAP4-207ENST00000477195 CFTRP13569 1480 aa22.44■■□□□ 1.18
DLGAP4-207ENST00000477195 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
DLGAP4-207ENST00000477195 PRDM2Q13029 1718 aa22.37■■□□□ 1.17
DLGAP4-207ENST00000477195 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.3■■□□□ 1.16
DLGAP4-207ENST00000477195 TRIM41Q8WV44 630 aa22.27■■□□□ 1.16
DLGAP4-207ENST00000477195 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
DLGAP4-207ENST00000477195 TOPBP1Q92547 1522 aa22.11■■□□□ 1.13
DLGAP4-207ENST00000477195 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
DLGAP4-207ENST00000477195 IFT140Q96RY7 1462 aa22.02■■□□□ 1.12
DLGAP4-207ENST00000477195 OSCARQ8IYS5 282 aa22.01■■□□□ 1.11
DLGAP4-207ENST00000477195 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22■■□□□ 1.11
DLGAP4-207ENST00000477195 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.95■■□□□ 1.1
DLGAP4-207ENST00000477195 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.95■■□□□ 1.1
DLGAP4-207ENST00000477195 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.95■■□□□ 1.1
DLGAP4-207ENST00000477195 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
DLGAP4-207ENST00000477195 CHD1O14646 1710 aa21.93■■□□□ 1.1
DLGAP4-207ENST00000477195 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.9■■□□□ 1.1
DLGAP4-207ENST00000477195 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
DLGAP4-207ENST00000477195 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.87■■□□□ 1.09
DLGAP4-207ENST00000477195 ABCC8Q09428 1581 aa21.86■■□□□ 1.09
DLGAP4-207ENST00000477195 ARHGEF11O15085 1522 aa21.81■■□□□ 1.08
DLGAP4-207ENST00000477195 CUX1P39880 1505 aa21.77■■□□□ 1.08
DLGAP4-207ENST00000477195 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.77■■□□□ 1.07
DLGAP4-207ENST00000477195 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
DLGAP4-207ENST00000477195 FBLN2P98095 1184 aa21.74■■□□□ 1.07
DLGAP4-207ENST00000477195 SOGA1O94964 1423 aa21.72■■□□□ 1.07
DLGAP4-207ENST00000477195 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
DLGAP4-207ENST00000477195 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.68■■□□□ 1.06
DLGAP4-207ENST00000477195 WDR97A6NE52 1622 aa21.67■■□□□ 1.06
DLGAP4-207ENST00000477195 ARAP1Q96P48 1450 aa21.63■■□□□ 1.05
DLGAP4-207ENST00000477195 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.62■■□□□ 1.05
DLGAP4-207ENST00000477195 PBRM1Q86U86 1689 aa21.62■■□□□ 1.05
DLGAP4-207ENST00000477195 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.55■■□□□ 1.04
DLGAP4-207ENST00000477195 GRIN2BQ13224 1484 aa21.52■■□□□ 1.03
DLGAP4-207ENST00000477195 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.5■■□□□ 1.03
DLGAP4-207ENST00000477195 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
DLGAP4-207ENST00000477195 SYNJ1O43426 1573 aa21.48■■□□□ 1.03
DLGAP4-207ENST00000477195 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
DLGAP4-207ENST00000477195 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.47■■□□□ 1.03
DLGAP4-207ENST00000477195 SYNJ2O15056 1496 aa21.45■■□□□ 1.03
DLGAP4-207ENST00000477195 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.43■■□□□ 1.02
DLGAP4-207ENST00000477195 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.4■■□□□ 1.02
DLGAP4-207ENST00000477195 TRHP20396 242 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
DLGAP4-207ENST00000477195 TOP2BQ02880 1626 aa21.36■■□□□ 1.01
DLGAP4-207ENST00000477195 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.36■■□□□ 1.01
DLGAP4-207ENST00000477195 ADAMTS12P58397 1594 aa21.35■■□□□ 1.01
DLGAP4-207ENST00000477195 CEP170Q5SW79 1584 aa21.31■■□□□ 1
DLGAP4-207ENST00000477195 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.31■■□□□ 1
DLGAP4-207ENST00000477195 GRIN2AQ12879 1464 aa21.29■■□□□ 1
DLGAP4-207ENST00000477195 NUP160Q12769 1436 aa21.18■□□□□ 0.98
DLGAP4-207ENST00000477195 SHROOM2Q13796 1616 aa21.15■□□□□ 0.98
DLGAP4-207ENST00000477195 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.15■□□□□ 0.98
DLGAP4-207ENST00000477195 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.14■□□□□ 0.98
DLGAP4-207ENST00000477195 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.06■□□□□ 0.96
DLGAP4-207ENST00000477195 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
DLGAP4-207ENST00000477195 KIF13AQ9H1H9 1805 aa20.97■□□□□ 0.95
DLGAP4-207ENST00000477195 JPH4Q96JJ6 628 aa20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms