RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477093.1

PXDN-208, Transcript of peroxidasin, humanhuman

TSL 4

Gene PXDN, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDN-208ENST00000477093 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.11■■■■□ 3.37
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PXDN-208ENST00000477093 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.02■■■□□ 2.72
PXDN-208ENST00000477093 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.41■■■□□ 2.62
PXDN-208ENST00000477093 NACADO15069 1562 aa31.06■■■□□ 2.56
PXDN-208ENST00000477093 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.03■■■□□ 2.56
PXDN-208ENST00000477093 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.85■■■□□ 2.53
PXDN-208ENST00000477093 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.54■■■□□ 2.48
PXDN-208ENST00000477093 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.53■■■□□ 2.48
PXDN-208ENST00000477093 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.46■■■□□ 2.47
PXDN-208ENST00000477093 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.15■■■□□ 2.42
PXDN-208ENST00000477093 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.09■■■□□ 2.41
PXDN-208ENST00000477093 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.05■■■□□ 2.4
PXDN-208ENST00000477093 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.92■■■□□ 2.38
PXDN-208ENST00000477093 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
PXDN-208ENST00000477093 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.8■■■□□ 2.36
PXDN-208ENST00000477093 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.35
PXDN-208ENST00000477093 SCRIBQ14160 1630 aa29.66■■■□□ 2.34
PXDN-208ENST00000477093 CUX2O14529 1486 aa29.04■■■□□ 2.24
PXDN-208ENST00000477093 ERCC6Q03468 1493 aa28.85■■■□□ 2.21
PXDN-208ENST00000477093 NCAPD3P42695 1498 aa28.76■■■□□ 2.19
PXDN-208ENST00000477093 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.54■■■□□ 2.16
PXDN-208ENST00000477093 NESP48681 1621 aa28.46■■■□□ 2.15
PXDN-208ENST00000477093 HMGXB3Q12766 1538 aa28.39■■■□□ 2.14
PXDN-208ENST00000477093 SMARCA2P51531 1590 aa28.38■■■□□ 2.13
PXDN-208ENST00000477093 TRIM41Q8WV44 630 aa28.25■■■□□ 2.11
PXDN-208ENST00000477093 SMARCA4P51532 1647 aa28.25■■■□□ 2.11
PXDN-208ENST00000477093 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
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PXDN-208ENST00000477093 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.07■■■□□ 2.08
PXDN-208ENST00000477093 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
PXDN-208ENST00000477093 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.02■■■□□ 2.08
PXDN-208ENST00000477093 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.93■■■□□ 2.06
PXDN-208ENST00000477093 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.86■■■□□ 2.05
PXDN-208ENST00000477093 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.82■■■□□ 2.04
PXDN-208ENST00000477093 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.81■■■□□ 2.04
PXDN-208ENST00000477093 WDR62O43379 1518 aa27.75■■■□□ 2.03
PXDN-208ENST00000477093 OSCARQ8IYS5 282 aa27.71■■■□□ 2.03
PXDN-208ENST00000477093 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.56■■■□□ 2
PXDN-208ENST00000477093 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.49■■□□□ 1.99
PXDN-208ENST00000477093 CFTRP13569 1480 aa27.38■■□□□ 1.97
PXDN-208ENST00000477093 WIZO95785 1651 aa27.36■■□□□ 1.97
PXDN-208ENST00000477093 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
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PXDN-208ENST00000477093 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.24■■□□□ 1.95
PXDN-208ENST00000477093 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.24■■□□□ 1.95
PXDN-208ENST00000477093 ARHGEF11O15085 1522 aa27.15■■□□□ 1.94
PXDN-208ENST00000477093 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.09■■□□□ 1.93
PXDN-208ENST00000477093 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
PXDN-208ENST00000477093 IFT140Q96RY7 1462 aa27.06■■□□□ 1.92
PXDN-208ENST00000477093 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
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PXDN-208ENST00000477093 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
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PXDN-208ENST00000477093 PRDM2Q13029 1718 aa26.78■■□□□ 1.88
PXDN-208ENST00000477093 FBLN2P98095 1184 aa26.76■■□□□ 1.87
PXDN-208ENST00000477093 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
PXDN-208ENST00000477093 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.68■■□□□ 1.86
PXDN-208ENST00000477093 CHD1O14646 1710 aa26.66■■□□□ 1.86
PXDN-208ENST00000477093 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
PXDN-208ENST00000477093 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
PXDN-208ENST00000477093 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
PXDN-208ENST00000477093 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.49■■□□□ 1.83
PXDN-208ENST00000477093 SOGA1O94964 1423 aa26.48■■□□□ 1.83
PXDN-208ENST00000477093 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
PXDN-208ENST00000477093 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.46■■□□□ 1.83
PXDN-208ENST00000477093 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.43■■□□□ 1.82
PXDN-208ENST00000477093 SYNJ1O43426 1573 aa26.37■■□□□ 1.81
PXDN-208ENST00000477093 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
PXDN-208ENST00000477093 WDR97A6NE52 1622 aa26.32■■□□□ 1.8
PXDN-208ENST00000477093 GRIN2BQ13224 1484 aa26.3■■□□□ 1.8
PXDN-208ENST00000477093 SYNJ2O15056 1496 aa26.3■■□□□ 1.8
PXDN-208ENST00000477093 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.29■■□□□ 1.8
PXDN-208ENST00000477093 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.28■■□□□ 1.8
PXDN-208ENST00000477093 CUX1P39880 1505 aa26.15■■□□□ 1.78
PXDN-208ENST00000477093 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.99■■□□□ 1.75
PXDN-208ENST00000477093 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.98■■□□□ 1.75
PXDN-208ENST00000477093 PBRM1Q86U86 1689 aa25.96■■□□□ 1.75
PXDN-208ENST00000477093 GRIN2AQ12879 1464 aa25.94■■□□□ 1.74
PXDN-208ENST00000477093 NUP160Q12769 1436 aa25.92■■□□□ 1.74
PXDN-208ENST00000477093 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.92■■□□□ 1.74
PXDN-208ENST00000477093 CEP170Q5SW79 1584 aa25.9■■□□□ 1.74
PXDN-208ENST00000477093 SHROOM2Q13796 1616 aa25.79■■□□□ 1.72
PXDN-208ENST00000477093 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.78■■□□□ 1.72
PXDN-208ENST00000477093 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.78■■□□□ 1.72
PXDN-208ENST00000477093 ADAMTS12P58397 1594 aa25.77■■□□□ 1.72
PXDN-208ENST00000477093 FAM69CQ0P6D2 419 aa25.75■■□□□ 1.71
PXDN-208ENST00000477093 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.74■■□□□ 1.71
PXDN-208ENST00000477093 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
PXDN-208ENST00000477093 JPH4Q96JJ6 628 aa25.72■■□□□ 1.71
PXDN-208ENST00000477093 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.69■■□□□ 1.7
PXDN-208ENST00000477093 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa25.68■■□□□ 1.7
PXDN-208ENST00000477093 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.67■■□□□ 1.7
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