RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477001.1

SEMA5B-210, Transcript of semaphorin 5B, humanhuman

TSL 3

Gene SEMA5B, Length 543 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA5B-210ENST00000477001 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.94■■■■■ 5.91
SEMA5B-210ENST00000477001 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.19■■■■■ 4.98
SEMA5B-210ENST00000477001 ABCC9O60706 1549 aa44.88■■■■■ 4.78
SEMA5B-210ENST00000477001 NACADO15069 1562 aa43.35■■■■■ 4.53
SEMA5B-210ENST00000477001 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.34■■■■■ 4.53
SEMA5B-210ENST00000477001 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.34■■■■■ 4.53
SEMA5B-210ENST00000477001 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.22■■■■■ 4.51
SEMA5B-210ENST00000477001 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.12■■■■■ 4.49
SEMA5B-210ENST00000477001 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.07■■■■■ 4.49
SEMA5B-210ENST00000477001 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.36■■■■■ 4.37
SEMA5B-210ENST00000477001 SCRIBQ14160 1630 aa42.04■■■■■ 4.32
SEMA5B-210ENST00000477001 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.01■■■■■ 4.32
SEMA5B-210ENST00000477001 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.89■■■■■ 4.3
SEMA5B-210ENST00000477001 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.7■■■■■ 4.27
SEMA5B-210ENST00000477001 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41■■■■■ 4.15
SEMA5B-210ENST00000477001 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.89■■■■■ 4.14
SEMA5B-210ENST00000477001 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.67■■■■■ 4.1
SEMA5B-210ENST00000477001 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.39■■■■■ 4.06
SEMA5B-210ENST00000477001 SMARCA4P51532 1647 aa40.29■■■■■ 4.04
SEMA5B-210ENST00000477001 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.27■■■■■ 4.04
SEMA5B-210ENST00000477001 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.01■■■■□ 3.99
SEMA5B-210ENST00000477001 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40■■■■□ 3.99
SEMA5B-210ENST00000477001 SMARCA2P51531 1590 aa40■■■■□ 3.99
SEMA5B-210ENST00000477001 NCAPD3P42695 1498 aa39.98■■■■□ 3.99
SEMA5B-210ENST00000477001 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.95■■■■□ 3.99
SEMA5B-210ENST00000477001 HMGXB3Q12766 1538 aa39.84■■■■□ 3.97
SEMA5B-210ENST00000477001 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.68■■■■□ 3.94
SEMA5B-210ENST00000477001 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.61■■■■□ 3.93
SEMA5B-210ENST00000477001 WIZO95785 1651 aa39.57■■■■□ 3.93
SEMA5B-210ENST00000477001 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.23■■■■□ 3.87
SEMA5B-210ENST00000477001 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.92■■■■□ 3.82
SEMA5B-210ENST00000477001 NESP48681 1621 aa38.89■■■■□ 3.82
SEMA5B-210ENST00000477001 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.79■■■■□ 3.8
SEMA5B-210ENST00000477001 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.71■■■■□ 3.79
SEMA5B-210ENST00000477001 ERCC6Q03468 1493 aa38.68■■■■□ 3.78
SEMA5B-210ENST00000477001 CFTRP13569 1480 aa38.62■■■■□ 3.77
SEMA5B-210ENST00000477001 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.61■■■■□ 3.77
SEMA5B-210ENST00000477001 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.58■■■■□ 3.77
SEMA5B-210ENST00000477001 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.49■■■■□ 3.75
SEMA5B-210ENST00000477001 PRDM2Q13029 1718 aa38.41■■■■□ 3.74
SEMA5B-210ENST00000477001 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.36■■■■□ 3.73
SEMA5B-210ENST00000477001 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.35■■■■□ 3.73
SEMA5B-210ENST00000477001 CUX2O14529 1486 aa38.3■■■■□ 3.72
SEMA5B-210ENST00000477001 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.29■■■■□ 3.72
SEMA5B-210ENST00000477001 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.22■■■■□ 3.71
SEMA5B-210ENST00000477001 WDR62O43379 1518 aa38.12■■■■□ 3.69
SEMA5B-210ENST00000477001 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.96■■■■□ 3.67
SEMA5B-210ENST00000477001 ABCC8Q09428 1581 aa37.8■■■■□ 3.64
SEMA5B-210ENST00000477001 TOPBP1Q92547 1522 aa37.77■■■■□ 3.64
SEMA5B-210ENST00000477001 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.76■■■■□ 3.63
SEMA5B-210ENST00000477001 CUX1P39880 1505 aa37.53■■■■□ 3.6
SEMA5B-210ENST00000477001 IFT140Q96RY7 1462 aa37.5■■■■□ 3.59
SEMA5B-210ENST00000477001 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.45■■■■□ 3.59
SEMA5B-210ENST00000477001 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.38■■■■□ 3.57
SEMA5B-210ENST00000477001 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.36■■■■□ 3.57
SEMA5B-210ENST00000477001 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.35■■■■□ 3.57
SEMA5B-210ENST00000477001 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.3■■■■□ 3.56
SEMA5B-210ENST00000477001 TOP2BQ02880 1626 aa37.28■■■■□ 3.56
SEMA5B-210ENST00000477001 SOGA1O94964 1423 aa37.27■■■■□ 3.56
SEMA5B-210ENST00000477001 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.26■■■■□ 3.56
SEMA5B-210ENST00000477001 SYNJ1O43426 1573 aa37.25■■■■□ 3.55
SEMA5B-210ENST00000477001 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.23■■■■□ 3.55
SEMA5B-210ENST00000477001 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.18■■■■□ 3.54
SEMA5B-210ENST00000477001 WDR97A6NE52 1622 aa37.15■■■■□ 3.54
SEMA5B-210ENST00000477001 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.06■■■■□ 3.52
SEMA5B-210ENST00000477001 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.06■■■■□ 3.52
SEMA5B-210ENST00000477001 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37■■■■□ 3.51
SEMA5B-210ENST00000477001 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.92■■■■□ 3.5
SEMA5B-210ENST00000477001 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.86■■■■□ 3.49
SEMA5B-210ENST00000477001 GRIN2BQ13224 1484 aa36.85■■■■□ 3.49
SEMA5B-210ENST00000477001 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.84■■■■□ 3.49
SEMA5B-210ENST00000477001 PBRM1Q86U86 1689 aa36.8■■■■□ 3.48
SEMA5B-210ENST00000477001 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.76■■■■□ 3.48
SEMA5B-210ENST00000477001 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.75■■■■□ 3.47
SEMA5B-210ENST00000477001 CHD1O14646 1710 aa36.66■■■■□ 3.46
SEMA5B-210ENST00000477001 OSCARQ8IYS5 282 aa36.64■■■■□ 3.46
SEMA5B-210ENST00000477001 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.63■■■■□ 3.45
SEMA5B-210ENST00000477001 SYNJ2O15056 1496 aa36.6■■■■□ 3.45
SEMA5B-210ENST00000477001 KIF27Q86VH2 1401 aa36.55■■■■□ 3.44
SEMA5B-210ENST00000477001 ADAMTS12P58397 1594 aa36.54■■■■□ 3.44
SEMA5B-210ENST00000477001 FBLN2P98095 1184 aa36.49■■■■□ 3.43
SEMA5B-210ENST00000477001 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.48■■■■□ 3.43
SEMA5B-210ENST00000477001 TRIM41Q8WV44 630 aa36.48■■■■□ 3.43
SEMA5B-210ENST00000477001 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.46■■■■□ 3.43
SEMA5B-210ENST00000477001 GRIN2AQ12879 1464 aa36.38■■■■□ 3.41
SEMA5B-210ENST00000477001 IGF1RP08069 1367 aa36.36■■■■□ 3.41
SEMA5B-210ENST00000477001 CUL7Q14999 1698 aa36.34■■■■□ 3.41
SEMA5B-210ENST00000477001 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.31■■■■□ 3.4
SEMA5B-210ENST00000477001 NUP160Q12769 1436 aa36.24■■■■□ 3.39
SEMA5B-210ENST00000477001 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.21■■■■□ 3.39
SEMA5B-210ENST00000477001 CEP170Q5SW79 1584 aa36.19■■■■□ 3.38
SEMA5B-210ENST00000477001 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.16■■■■□ 3.38
SEMA5B-210ENST00000477001 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.15■■■■□ 3.38
SEMA5B-210ENST00000477001 ARHGEF11O15085 1522 aa36.11■■■■□ 3.37
SEMA5B-210ENST00000477001 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.09■■■■□ 3.37
SEMA5B-210ENST00000477001 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.09■■■■□ 3.37
SEMA5B-210ENST00000477001 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.09■■■■□ 3.37
SEMA5B-210ENST00000477001 EEA1Q15075 1411 aa36.01■■■■□ 3.36
SEMA5B-210ENST00000477001 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.99■■■■□ 3.35
SEMA5B-210ENST00000477001 SHROOM2Q13796 1616 aa35.97■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 133.9 ms