RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476550.1

LRRC71-203, Transcript of leucine rich repeat containing 71, humanhuman

TSL 3

Gene LRRC71, Length 790 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC71-203ENST00000476550 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.92■■■□□ 2.86
LRRC71-203ENST00000476550 ABCC9O60706 1549 aa30.37■■■□□ 2.45
LRRC71-203ENST00000476550 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.67■■■□□ 2.34
LRRC71-203ENST00000476550 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.95■■■□□ 2.22
LRRC71-203ENST00000476550 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.59■■■□□ 2.17
LRRC71-203ENST00000476550 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.26■■■□□ 2.11
LRRC71-203ENST00000476550 NACADO15069 1562 aa28.25■■■□□ 2.11
LRRC71-203ENST00000476550 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.23■■■□□ 2.11
LRRC71-203ENST00000476550 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.8■■■□□ 2.04
LRRC71-203ENST00000476550 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.73■■■□□ 2.03
LRRC71-203ENST00000476550 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.65■■■□□ 2.02
LRRC71-203ENST00000476550 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.4■■□□□ 1.98
LRRC71-203ENST00000476550 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.33■■□□□ 1.97
LRRC71-203ENST00000476550 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.32■■□□□ 1.96
LRRC71-203ENST00000476550 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
LRRC71-203ENST00000476550 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
LRRC71-203ENST00000476550 SCRIBQ14160 1630 aa27.12■■□□□ 1.93
LRRC71-203ENST00000476550 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.11■■□□□ 1.93
LRRC71-203ENST00000476550 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.98■■□□□ 1.91
LRRC71-203ENST00000476550 CUX2O14529 1486 aa26.34■■□□□ 1.81
LRRC71-203ENST00000476550 ERCC6Q03468 1493 aa26.3■■□□□ 1.8
LRRC71-203ENST00000476550 NCAPD3P42695 1498 aa26.11■■□□□ 1.77
LRRC71-203ENST00000476550 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.98■■□□□ 1.75
LRRC71-203ENST00000476550 NESP48681 1621 aa25.91■■□□□ 1.74
LRRC71-203ENST00000476550 SMARCA2P51531 1590 aa25.86■■□□□ 1.73
LRRC71-203ENST00000476550 HMGXB3Q12766 1538 aa25.84■■□□□ 1.73
LRRC71-203ENST00000476550 SMARCA4P51532 1647 aa25.77■■□□□ 1.72
LRRC71-203ENST00000476550 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
LRRC71-203ENST00000476550 TRIM41Q8WV44 630 aa25.7■■□□□ 1.7
LRRC71-203ENST00000476550 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
LRRC71-203ENST00000476550 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
LRRC71-203ENST00000476550 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.58■■□□□ 1.69
LRRC71-203ENST00000476550 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.54■■□□□ 1.68
LRRC71-203ENST00000476550 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.48■■□□□ 1.67
LRRC71-203ENST00000476550 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.46■■□□□ 1.67
LRRC71-203ENST00000476550 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.37■■□□□ 1.65
LRRC71-203ENST00000476550 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.35■■□□□ 1.65
LRRC71-203ENST00000476550 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.33■■□□□ 1.65
LRRC71-203ENST00000476550 WDR62O43379 1518 aa25.23■■□□□ 1.63
LRRC71-203ENST00000476550 OSCARQ8IYS5 282 aa25.14■■□□□ 1.62
LRRC71-203ENST00000476550 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.13■■□□□ 1.61
LRRC71-203ENST00000476550 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.05■■□□□ 1.6
LRRC71-203ENST00000476550 WIZO95785 1651 aa25.01■■□□□ 1.59
LRRC71-203ENST00000476550 CFTRP13569 1480 aa24.9■■□□□ 1.58
LRRC71-203ENST00000476550 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
LRRC71-203ENST00000476550 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.75■■□□□ 1.55
LRRC71-203ENST00000476550 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.75■■□□□ 1.55
LRRC71-203ENST00000476550 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.75■■□□□ 1.55
LRRC71-203ENST00000476550 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
LRRC71-203ENST00000476550 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
LRRC71-203ENST00000476550 ARHGEF11O15085 1522 aa24.66■■□□□ 1.54
LRRC71-203ENST00000476550 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
LRRC71-203ENST00000476550 IFT140Q96RY7 1462 aa24.64■■□□□ 1.54
LRRC71-203ENST00000476550 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.62■■□□□ 1.53
LRRC71-203ENST00000476550 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
LRRC71-203ENST00000476550 TOPBP1Q92547 1522 aa24.5■■□□□ 1.51
LRRC71-203ENST00000476550 PRDM2Q13029 1718 aa24.45■■□□□ 1.5
LRRC71-203ENST00000476550 FBLN2P98095 1184 aa24.45■■□□□ 1.5
LRRC71-203ENST00000476550 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
LRRC71-203ENST00000476550 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.44■■□□□ 1.5
LRRC71-203ENST00000476550 ABCC8Q09428 1581 aa24.4■■□□□ 1.5
LRRC71-203ENST00000476550 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.39■■□□□ 1.5
LRRC71-203ENST00000476550 ARAP1Q96P48 1450 aa24.38■■□□□ 1.49
LRRC71-203ENST00000476550 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.33■■□□□ 1.49
LRRC71-203ENST00000476550 CHD1O14646 1710 aa24.31■■□□□ 1.48
LRRC71-203ENST00000476550 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
LRRC71-203ENST00000476550 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
LRRC71-203ENST00000476550 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
LRRC71-203ENST00000476550 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
LRRC71-203ENST00000476550 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.17■■□□□ 1.46
LRRC71-203ENST00000476550 SOGA1O94964 1423 aa24.14■■□□□ 1.45
LRRC71-203ENST00000476550 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
LRRC71-203ENST00000476550 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.12■■□□□ 1.45
LRRC71-203ENST00000476550 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.06■■□□□ 1.44
LRRC71-203ENST00000476550 SYNJ1O43426 1573 aa24.03■■□□□ 1.44
LRRC71-203ENST00000476550 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24■■□□□ 1.43
LRRC71-203ENST00000476550 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
LRRC71-203ENST00000476550 GRIN2BQ13224 1484 aa23.97■■□□□ 1.43
LRRC71-203ENST00000476550 WDR97A6NE52 1622 aa23.95■■□□□ 1.43
LRRC71-203ENST00000476550 SYNJ2O15056 1496 aa23.94■■□□□ 1.42
LRRC71-203ENST00000476550 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.92■■□□□ 1.42
LRRC71-203ENST00000476550 CUX1P39880 1505 aa23.87■■□□□ 1.41
LRRC71-203ENST00000476550 PBRM1Q86U86 1689 aa23.73■■□□□ 1.39
LRRC71-203ENST00000476550 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.68■■□□□ 1.38
LRRC71-203ENST00000476550 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.68■■□□□ 1.38
LRRC71-203ENST00000476550 GRIN2AQ12879 1464 aa23.64■■□□□ 1.38
LRRC71-203ENST00000476550 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.63■■□□□ 1.37
LRRC71-203ENST00000476550 CEP170Q5SW79 1584 aa23.6■■□□□ 1.37
LRRC71-203ENST00000476550 NUP160Q12769 1436 aa23.58■■□□□ 1.36
LRRC71-203ENST00000476550 ADAMTS12P58397 1594 aa23.52■■□□□ 1.36
LRRC71-203ENST00000476550 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.52■■□□□ 1.36
LRRC71-203ENST00000476550 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.5■■□□□ 1.35
LRRC71-203ENST00000476550 SHROOM2Q13796 1616 aa23.45■■□□□ 1.34
LRRC71-203ENST00000476550 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
LRRC71-203ENST00000476550 FAM69CQ0P6D2 419 aa23.44■■□□□ 1.34
LRRC71-203ENST00000476550 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.41■■□□□ 1.34
LRRC71-203ENST00000476550 JPH4Q96JJ6 628 aa23.41■■□□□ 1.34
LRRC71-203ENST00000476550 KIF13AQ9H1H9 1805 aa23.4■■□□□ 1.34
LRRC71-203ENST00000476550 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.35■■□□□ 1.33
LRRC71-203ENST00000476550 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms