RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476446.5

DHX30-213, Transcript of DExH-box helicase 30, humanhuman

TSL 2

Gene DHX30, Length 752 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX30-213ENST00000476446 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.84■■■■■ 6.69
DHX30-213ENST00000476446 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.87■■■■■ 5.73
DHX30-213ENST00000476446 ABCC9O60706 1549 aa50.39■■■■■ 5.66
DHX30-213ENST00000476446 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.14■■■■■ 5.3
DHX30-213ENST00000476446 NACADO15069 1562 aa47.93■■■■■ 5.26
DHX30-213ENST00000476446 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.56■■■■■ 5.2
DHX30-213ENST00000476446 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.44■■■■■ 5.18
DHX30-213ENST00000476446 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.25■■■■■ 5.15
DHX30-213ENST00000476446 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.17■■■■■ 5.14
DHX30-213ENST00000476446 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47■■■■■ 5.11
DHX30-213ENST00000476446 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.91■■■■■ 5.1
DHX30-213ENST00000476446 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.89■■■■■ 5.1
DHX30-213ENST00000476446 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.83■■■■■ 5.09
DHX30-213ENST00000476446 SCRIBQ14160 1630 aa46.36■■■■■ 5.01
DHX30-213ENST00000476446 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.19■■■■■ 4.98
DHX30-213ENST00000476446 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.59■■■■■ 4.89
DHX30-213ENST00000476446 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.58■■■■■ 4.89
DHX30-213ENST00000476446 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.34■■■■■ 4.85
DHX30-213ENST00000476446 SMARCA4P51532 1647 aa44.28■■■■■ 4.68
DHX30-213ENST00000476446 NCAPD3P42695 1498 aa44.23■■■■■ 4.67
DHX30-213ENST00000476446 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.18■■■■■ 4.66
DHX30-213ENST00000476446 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.07■■■■■ 4.65
DHX30-213ENST00000476446 SMARCA2P51531 1590 aa44.06■■■■■ 4.64
DHX30-213ENST00000476446 HMGXB3Q12766 1538 aa43.99■■■■■ 4.63
DHX30-213ENST00000476446 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.86■■■■■ 4.61
DHX30-213ENST00000476446 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.82■■■■■ 4.61
DHX30-213ENST00000476446 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.75■■■■■ 4.59
DHX30-213ENST00000476446 NESP48681 1621 aa43.45■■■■■ 4.55
DHX30-213ENST00000476446 ERCC6Q03468 1493 aa43.42■■■■■ 4.54
DHX30-213ENST00000476446 WIZO95785 1651 aa43.32■■■■■ 4.53
DHX30-213ENST00000476446 CUX2O14529 1486 aa43.25■■■■■ 4.51
DHX30-213ENST00000476446 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.18■■■■■ 4.5
DHX30-213ENST00000476446 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.03■■■■■ 4.48
DHX30-213ENST00000476446 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.99■■■■■ 4.47
DHX30-213ENST00000476446 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.93■■■■■ 4.46
DHX30-213ENST00000476446 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.88■■■■■ 4.45
DHX30-213ENST00000476446 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.84■■■■■ 4.45
DHX30-213ENST00000476446 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.8■■■■■ 4.44
DHX30-213ENST00000476446 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.68■■■■■ 4.42
DHX30-213ENST00000476446 CFTRP13569 1480 aa42.53■■■■■ 4.4
DHX30-213ENST00000476446 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.53■■■■■ 4.4
DHX30-213ENST00000476446 WDR62O43379 1518 aa42.46■■■■■ 4.39
DHX30-213ENST00000476446 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.43■■■■■ 4.38
DHX30-213ENST00000476446 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.42■■■■■ 4.38
DHX30-213ENST00000476446 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.27■■■■■ 4.36
DHX30-213ENST00000476446 PRDM2Q13029 1718 aa42.2■■■■■ 4.35
DHX30-213ENST00000476446 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.1■■■■■ 4.33
DHX30-213ENST00000476446 TOPBP1Q92547 1522 aa41.69■■■■■ 4.27
DHX30-213ENST00000476446 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.59■■■■■ 4.25
DHX30-213ENST00000476446 IFT140Q96RY7 1462 aa41.56■■■■■ 4.24
DHX30-213ENST00000476446 ABCC8Q09428 1581 aa41.54■■■■■ 4.24
DHX30-213ENST00000476446 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.5■■■■■ 4.23
DHX30-213ENST00000476446 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.33■■■■■ 4.21
DHX30-213ENST00000476446 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.33■■■■■ 4.21
DHX30-213ENST00000476446 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.3■■■■■ 4.2
DHX30-213ENST00000476446 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.29■■■■■ 4.2
DHX30-213ENST00000476446 OSCARQ8IYS5 282 aa41.22■■■■■ 4.19
DHX30-213ENST00000476446 CUX1P39880 1505 aa41.16■■■■■ 4.18
DHX30-213ENST00000476446 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.12■■■■■ 4.177e-9■■■■■ 34.8
DHX30-213ENST00000476446 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.12■■■■■ 4.17
DHX30-213ENST00000476446 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.09■■■■■ 4.17
DHX30-213ENST00000476446 SOGA1O94964 1423 aa41.03■■■■■ 4.16
DHX30-213ENST00000476446 CHD1O14646 1710 aa40.93■■■■■ 4.14
DHX30-213ENST00000476446 TRIM41Q8WV44 630 aa40.93■■■■■ 4.14
DHX30-213ENST00000476446 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.91■■■■■ 4.14
DHX30-213ENST00000476446 WDR97A6NE52 1622 aa40.9■■■■■ 4.14
DHX30-213ENST00000476446 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.82■■■■■ 4.12
DHX30-213ENST00000476446 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.82■■■■■ 4.12
DHX30-213ENST00000476446 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.82■■■■■ 4.12
DHX30-213ENST00000476446 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.76■■■■■ 4.12
DHX30-213ENST00000476446 ARHGEF11O15085 1522 aa40.72■■■■■ 4.11
DHX30-213ENST00000476446 GRIN2BQ13224 1484 aa40.67■■■■■ 4.1
DHX30-213ENST00000476446 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.66■■■■■ 4.1
DHX30-213ENST00000476446 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.64■■■■■ 4.1
DHX30-213ENST00000476446 FBLN2P98095 1184 aa40.63■■■■■ 4.09
DHX30-213ENST00000476446 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.62■■■■■ 4.09
DHX30-213ENST00000476446 PBRM1Q86U86 1689 aa40.62■■■■■ 4.09
DHX30-213ENST00000476446 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.61■■■■■ 4.09
DHX30-213ENST00000476446 TOP2BQ02880 1626 aa40.6■■■■■ 4.09
DHX30-213ENST00000476446 SYNJ1O43426 1573 aa40.59■■■■■ 4.09
DHX30-213ENST00000476446 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.58■■■■■ 4.09
DHX30-213ENST00000476446 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.56■■■■■ 4.08
DHX30-213ENST00000476446 SYNJ2O15056 1496 aa40.5■■■■■ 4.07
DHX30-213ENST00000476446 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.49■■■■■ 4.07
DHX30-213ENST00000476446 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.42■■■■■ 4.06
DHX30-213ENST00000476446 ARAP1Q96P48 1450 aa40.37■■■■■ 4.05
DHX30-213ENST00000476446 ADAMTS12P58397 1594 aa40.27■■■■■ 4.04
DHX30-213ENST00000476446 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.24■■■■■ 4.03
DHX30-213ENST00000476446 GRIN2AQ12879 1464 aa40.17■■■■■ 4.02
DHX30-213ENST00000476446 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.14■■■■■ 4.02
DHX30-213ENST00000476446 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.08■■■■■ 4.01
DHX30-213ENST00000476446 CEP170Q5SW79 1584 aa40.06■■■■■ 4
DHX30-213ENST00000476446 NUP160Q12769 1436 aa40.05■■■■■ 4
DHX30-213ENST00000476446 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.89■■■■□ 3.98
DHX30-213ENST00000476446 SHROOM2Q13796 1616 aa39.87■■■■□ 3.97
DHX30-213ENST00000476446 KIF27Q86VH2 1401 aa39.72■■■■□ 3.95
DHX30-213ENST00000476446 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.7■■■■□ 3.95
DHX30-213ENST00000476446 IGF1RP08069 1367 aa39.69■■■■□ 3.94
DHX30-213ENST00000476446 CUL7Q14999 1698 aa39.65■■■■□ 3.94
DHX30-213ENST00000476446 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.6■■■■□ 3.93
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