RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475988.1

PKP1-204, Transcript of plakophilin 1, humanhuman

TSL 3

Gene PKP1, Length 931 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1-204ENST00000475988 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.86■■■□□ 2.53
PKP1-204ENST00000475988 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.01■■□□□ 1.92
PKP1-204ENST00000475988 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
PKP1-204ENST00000475988 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.63■■□□□ 1.69
PKP1-204ENST00000475988 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.34■■□□□ 1.65
PKP1-204ENST00000475988 ABCC9O60706 1549 aa25.32■■□□□ 1.64
PKP1-204ENST00000475988 NACADO15069 1562 aa25.1■■□□□ 1.61
PKP1-204ENST00000475988 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.09■■□□□ 1.61
PKP1-204ENST00000475988 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.89■■□□□ 1.58
PKP1-204ENST00000475988 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.84■■□□□ 1.57
PKP1-204ENST00000475988 SCRIBQ14160 1630 aa24.67■■□□□ 1.54
PKP1-204ENST00000475988 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.39■■□□□ 1.5
PKP1-204ENST00000475988 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.16■■□□□ 1.46
PKP1-204ENST00000475988 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.92■■□□□ 1.42
PKP1-204ENST00000475988 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
PKP1-204ENST00000475988 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
PKP1-204ENST00000475988 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
PKP1-204ENST00000475988 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.81■■□□□ 1.4
PKP1-204ENST00000475988 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.78■■□□□ 1.4
PKP1-204ENST00000475988 SMARCA4P51532 1647 aa23.73■■□□□ 1.39
PKP1-204ENST00000475988 WIZO95785 1651 aa23.6■■□□□ 1.37
PKP1-204ENST00000475988 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.54■■□□□ 1.36
PKP1-204ENST00000475988 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.53■■□□□ 1.36
PKP1-204ENST00000475988 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PKP1-204ENST00000475988 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
PKP1-204ENST00000475988 SMARCA2P51531 1590 aa23.32■■□□□ 1.32
PKP1-204ENST00000475988 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.31■■□□□ 1.32
PKP1-204ENST00000475988 HMGXB3Q12766 1538 aa23.16■■□□□ 1.3
PKP1-204ENST00000475988 NCAPD3P42695 1498 aa23.15■■□□□ 1.3
PKP1-204ENST00000475988 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
PKP1-204ENST00000475988 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.11■■□□□ 1.29
PKP1-204ENST00000475988 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.03■■□□□ 1.28
PKP1-204ENST00000475988 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23■■□□□ 1.27
PKP1-204ENST00000475988 CFTRP13569 1480 aa22.62■■□□□ 1.21
PKP1-204ENST00000475988 PRDM2Q13029 1718 aa22.59■■□□□ 1.21
PKP1-204ENST00000475988 ABCC8Q09428 1581 aa22.59■■□□□ 1.21
PKP1-204ENST00000475988 TRIM41Q8WV44 630 aa22.53■■□□□ 1.2
PKP1-204ENST00000475988 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.49■■□□□ 1.19
PKP1-204ENST00000475988 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.46■■□□□ 1.19
PKP1-204ENST00000475988 SYNJ1O43426 1573 aa22.42■■□□□ 1.18
PKP1-204ENST00000475988 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.38■■□□□ 1.17
PKP1-204ENST00000475988 TOP2BQ02880 1626 aa22.36■■□□□ 1.17
PKP1-204ENST00000475988 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.36■■□□□ 1.17
PKP1-204ENST00000475988 CUX1P39880 1505 aa22.27■■□□□ 1.16
PKP1-204ENST00000475988 NESP48681 1621 aa22.26■■□□□ 1.15
PKP1-204ENST00000475988 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.23■■□□□ 1.15
PKP1-204ENST00000475988 EEA1Q15075 1411 aa22.19■■□□□ 1.14
PKP1-204ENST00000475988 SOGA1O94964 1423 aa22.14■■□□□ 1.14
PKP1-204ENST00000475988 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.1■■□□□ 1.13
PKP1-204ENST00000475988 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.1■■□□□ 1.13
PKP1-204ENST00000475988 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.09■■□□□ 1.13
PKP1-204ENST00000475988 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.09■■□□□ 1.13
PKP1-204ENST00000475988 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.07■■□□□ 1.12
PKP1-204ENST00000475988 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.06■■□□□ 1.12
PKP1-204ENST00000475988 TOPBP1Q92547 1522 aa22.03■■□□□ 1.12
PKP1-204ENST00000475988 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.03■■□□□ 1.12
PKP1-204ENST00000475988 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
PKP1-204ENST00000475988 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22■■□□□ 1.11
PKP1-204ENST00000475988 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
PKP1-204ENST00000475988 KIF21BO75037 1637 aa21.95■■□□□ 1.1
PKP1-204ENST00000475988 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.93■■□□□ 1.1
PKP1-204ENST00000475988 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
PKP1-204ENST00000475988 KIF27Q86VH2 1401 aa21.88■■□□□ 1.09
PKP1-204ENST00000475988 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.87■■□□□ 1.09
PKP1-204ENST00000475988 WDR97A6NE52 1622 aa21.87■■□□□ 1.09
PKP1-204ENST00000475988 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.86■■□□□ 1.09
PKP1-204ENST00000475988 GOLGA3Q08378 1498 aa21.83■■□□□ 1.09
PKP1-204ENST00000475988 PRXQ9BXM0 1461 aa21.82■■□□□ 1.08
PKP1-204ENST00000475988 WDR62O43379 1518 aa21.81■■□□□ 1.08
PKP1-204ENST00000475988 CUX2O14529 1486 aa21.81■■□□□ 1.08
PKP1-204ENST00000475988 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.8■■□□□ 1.08
PKP1-204ENST00000475988 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.77■■□□□ 1.08
PKP1-204ENST00000475988 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.77■■□□□ 1.08
PKP1-204ENST00000475988 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
PKP1-204ENST00000475988 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
PKP1-204ENST00000475988 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.73■■□□□ 1.07
PKP1-204ENST00000475988 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.72■■□□□ 1.07
PKP1-204ENST00000475988 IGF1RP08069 1367 aa21.7■■□□□ 1.06
PKP1-204ENST00000475988 ERCC6Q03468 1493 aa21.68■■□□□ 1.06
PKP1-204ENST00000475988 CUL7Q14999 1698 aa21.62■■□□□ 1.05
PKP1-204ENST00000475988 CEP162Q5TB80 1403 aa21.62■■□□□ 1.05
PKP1-204ENST00000475988 EHMT2Q96KQ7 1210 aa21.61■■□□□ 1.05
PKP1-204ENST00000475988 IFT140Q96RY7 1462 aa21.6■■□□□ 1.05
PKP1-204ENST00000475988 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.57■■□□□ 1.04
PKP1-204ENST00000475988 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.55■■□□□ 1.04
PKP1-204ENST00000475988 UBTFP17480 764 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
PKP1-204ENST00000475988 PBRM1Q86U86 1689 aa21.52■■□□□ 1.04
PKP1-204ENST00000475988 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
PKP1-204ENST00000475988 CLIP1P30622 1438 aa21.45■■□□□ 1.02
PKP1-204ENST00000475988 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
PKP1-204ENST00000475988 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
PKP1-204ENST00000475988 ADAMTS12P58397 1594 aa21.42■■□□□ 1.02
PKP1-204ENST00000475988 GRIN2BQ13224 1484 aa21.42■■□□□ 1.02
PKP1-204ENST00000475988 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.41■■□□□ 1.02
PKP1-204ENST00000475988 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.37■■□□□ 1.01
PKP1-204ENST00000475988 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.36■■□□□ 1.01
PKP1-204ENST00000475988 ARAP1Q96P48 1450 aa21.31■■□□□ 1
PKP1-204ENST00000475988 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.29■■□□□ 1
PKP1-204ENST00000475988 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.29■■□□□ 1
PKP1-204ENST00000475988 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
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