RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475869.2

NBPF3-208, Transcript of NBPF member 3, humanhuman

TSL 5

Gene NBPF3, Length 485 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3-208ENST00000475869 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.14■■■■■ 7.38
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NBPF3-208ENST00000475869 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.7■■■■■ 5.87
NBPF3-208ENST00000475869 NACADO15069 1562 aa51.49■■■■■ 5.83
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NBPF3-208ENST00000475869 MYO15BQ96JP2 1530 aa51■■■■■ 5.75
NBPF3-208ENST00000475869 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.82■■■■■ 5.73
NBPF3-208ENST00000475869 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.64■■■■■ 5.7
NBPF3-208ENST00000475869 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.57■■■■■ 5.69
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NBPF3-208ENST00000475869 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.21■■■■■ 5.63
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NBPF3-208ENST00000475869 SCRIBQ14160 1630 aa49.81■■■■■ 5.56
NBPF3-208ENST00000475869 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.58■■■■■ 5.53
NBPF3-208ENST00000475869 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.9■■■■■ 5.42
NBPF3-208ENST00000475869 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.86■■■■■ 5.41
NBPF3-208ENST00000475869 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.58■■■■■ 5.37
NBPF3-208ENST00000475869 SMARCA4P51532 1647 aa47.6■■■■■ 5.21
NBPF3-208ENST00000475869 NCAPD3P42695 1498 aa47.51■■■■■ 5.2
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NBPF3-208ENST00000475869 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.42■■■■■ 5.18
NBPF3-208ENST00000475869 SMARCA2P51531 1590 aa47.37■■■■■ 5.17
NBPF3-208ENST00000475869 HMGXB3Q12766 1538 aa47.25■■■■■ 5.15
NBPF3-208ENST00000475869 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.15■■■■■ 5.14
NBPF3-208ENST00000475869 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.12■■■■■ 5.13
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NBPF3-208ENST00000475869 WIZO95785 1651 aa46.61■■■■■ 5.05
NBPF3-208ENST00000475869 NESP48681 1621 aa46.57■■■■■ 5.05
NBPF3-208ENST00000475869 ERCC6Q03468 1493 aa46.57■■■■■ 5.04
NBPF3-208ENST00000475869 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.38■■■■■ 5.01
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NBPF3-208ENST00000475869 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.03■■■■■ 4.96
NBPF3-208ENST00000475869 CFTRP13569 1480 aa45.7■■■■■ 4.91
NBPF3-208ENST00000475869 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.63■■■■■ 4.9
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NBPF3-208ENST00000475869 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.56■■■■■ 4.88
NBPF3-208ENST00000475869 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.56■■■■■ 4.88
NBPF3-208ENST00000475869 WDR62O43379 1518 aa45.53■■■■■ 4.88
NBPF3-208ENST00000475869 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.49■■■■■ 4.87
NBPF3-208ENST00000475869 PRDM2Q13029 1718 aa45.4■■■■■ 4.86
NBPF3-208ENST00000475869 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.18■■■■■ 4.82
NBPF3-208ENST00000475869 TOPBP1Q92547 1522 aa44.79■■■■■ 4.76
NBPF3-208ENST00000475869 ABCC8Q09428 1581 aa44.72■■■■■ 4.75
NBPF3-208ENST00000475869 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.69■■■■■ 4.75
NBPF3-208ENST00000475869 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.64■■■■■ 4.74
NBPF3-208ENST00000475869 IFT140Q96RY7 1462 aa44.63■■■■■ 4.73
NBPF3-208ENST00000475869 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.5■■■■■ 4.71
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NBPF3-208ENST00000475869 CUX1P39880 1505 aa44.24■■■■■ 4.67
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NBPF3-208ENST00000475869 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.17■■■■■ 4.66
NBPF3-208ENST00000475869 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.17■■■■■ 4.66
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NBPF3-208ENST00000475869 SOGA1O94964 1423 aa44.14■■■■■ 4.66
NBPF3-208ENST00000475869 WDR97A6NE52 1622 aa43.98■■■■■ 4.63
NBPF3-208ENST00000475869 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.96■■■■■ 4.63
NBPF3-208ENST00000475869 CHD1O14646 1710 aa43.92■■■■■ 4.62
NBPF3-208ENST00000475869 TRIM41Q8WV44 630 aa43.77■■■■■ 4.6
NBPF3-208ENST00000475869 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.75■■■■■ 4.59
NBPF3-208ENST00000475869 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.73■■■■■ 4.59
NBPF3-208ENST00000475869 TOP2BQ02880 1626 aa43.71■■■■■ 4.59
NBPF3-208ENST00000475869 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.71■■■■■ 4.59
NBPF3-208ENST00000475869 GRIN2BQ13224 1484 aa43.7■■■■■ 4.59
NBPF3-208ENST00000475869 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.7■■■■■ 4.59
NBPF3-208ENST00000475869 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.7■■■■■ 4.59
NBPF3-208ENST00000475869 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.7■■■■■ 4.59
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NBPF3-208ENST00000475869 SYNJ1O43426 1573 aa43.68■■■■■ 4.58
NBPF3-208ENST00000475869 FBLN2P98095 1184 aa43.68■■■■■ 4.58
NBPF3-208ENST00000475869 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.67■■■■■ 4.58
NBPF3-208ENST00000475869 PBRM1Q86U86 1689 aa43.66■■■■■ 4.58
NBPF3-208ENST00000475869 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.64■■■■■ 4.58
NBPF3-208ENST00000475869 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.64■■■■■ 4.58
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NBPF3-208ENST00000475869 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.47■■■■■ 4.55
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NBPF3-208ENST00000475869 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.18■■■■■ 4.5
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NBPF3-208ENST00000475869 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.15■■■■■ 4.5
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NBPF3-208ENST00000475869 CEP170Q5SW79 1584 aa43■■■■■ 4.47
NBPF3-208ENST00000475869 NUP160Q12769 1436 aa42.99■■■■■ 4.47
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NBPF3-208ENST00000475869 SHROOM2Q13796 1616 aa42.79■■■■■ 4.44
NBPF3-208ENST00000475869 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.76■■■■■ 4.44
NBPF3-208ENST00000475869 IGF1RP08069 1367 aa42.72■■■■■ 4.43
NBPF3-208ENST00000475869 CUL7Q14999 1698 aa42.7■■■■■ 4.43
NBPF3-208ENST00000475869 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.64■■■■■ 4.42
NBPF3-208ENST00000475869 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.5■■■■■ 4.39
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