RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475790.5

MEGF6-204, Transcript of multiple EGF like domains 6, humanhuman

TSL 3

Gene MEGF6, Length 883 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEGF6-204ENST00000475790 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.38■■■■■ 6.14
MEGF6-204ENST00000475790 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.75■■■■■ 5.23
MEGF6-204ENST00000475790 ABCC9O60706 1549 aa47.26■■■■■ 5.16
MEGF6-204ENST00000475790 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.19■■■■■ 4.82
MEGF6-204ENST00000475790 NACADO15069 1562 aa44.98■■■■■ 4.79
MEGF6-204ENST00000475790 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.81■■■■■ 4.76
MEGF6-204ENST00000475790 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.5■■■■■ 4.71
MEGF6-204ENST00000475790 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.36■■■■■ 4.69
MEGF6-204ENST00000475790 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.29■■■■■ 4.68
MEGF6-204ENST00000475790 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.11■■■■■ 4.65
MEGF6-204ENST00000475790 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.05■■■■■ 4.642e-6■■□□□ 12.9
MEGF6-204ENST00000475790 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.88■■■■■ 4.62
MEGF6-204ENST00000475790 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.88■■■■■ 4.62
MEGF6-204ENST00000475790 SCRIBQ14160 1630 aa43.55■■■■■ 4.56
MEGF6-204ENST00000475790 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.27■■■■■ 4.52
MEGF6-204ENST00000475790 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.75■■■■■ 4.43
MEGF6-204ENST00000475790 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.74■■■■■ 4.43
MEGF6-204ENST00000475790 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.5■■■■■ 4.39
MEGF6-204ENST00000475790 SMARCA4P51532 1647 aa41.58■■■■■ 4.25
MEGF6-204ENST00000475790 NCAPD3P42695 1498 aa41.49■■■■■ 4.23
MEGF6-204ENST00000475790 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.46■■■■■ 4.23
MEGF6-204ENST00000475790 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.42■■■■■ 4.22
MEGF6-204ENST00000475790 SMARCA2P51531 1590 aa41.37■■■■■ 4.21
MEGF6-204ENST00000475790 HMGXB3Q12766 1538 aa41.27■■■■■ 4.2
MEGF6-204ENST00000475790 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.16■■■■■ 4.18
MEGF6-204ENST00000475790 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.16■■■■■ 4.18
MEGF6-204ENST00000475790 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.09■■■■■ 4.17
MEGF6-204ENST00000475790 NESP48681 1621 aa40.75■■■■■ 4.11
MEGF6-204ENST00000475790 ERCC6Q03468 1493 aa40.75■■■■■ 4.11
MEGF6-204ENST00000475790 WIZO95785 1651 aa40.73■■■■■ 4.11
MEGF6-204ENST00000475790 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.52■■■■■ 4.08
MEGF6-204ENST00000475790 CUX2O14529 1486 aa40.51■■■■■ 4.07
MEGF6-204ENST00000475790 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.45■■■■■ 4.07
MEGF6-204ENST00000475790 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.3■■■■■ 4.04
MEGF6-204ENST00000475790 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.27■■■■■ 4.04
MEGF6-204ENST00000475790 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.25■■■■■ 4.03
MEGF6-204ENST00000475790 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.22■■■■■ 4.03
MEGF6-204ENST00000475790 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.21■■■■■ 4.03
MEGF6-204ENST00000475790 CFTRP13569 1480 aa39.91■■■■□ 3.98
MEGF6-204ENST00000475790 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.9■■■■□ 3.98
MEGF6-204ENST00000475790 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.89■■■■□ 3.98
MEGF6-204ENST00000475790 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.82■■■■□ 3.97
MEGF6-204ENST00000475790 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.82■■■■□ 3.97
MEGF6-204ENST00000475790 WDR62O43379 1518 aa39.8■■■■□ 3.96
MEGF6-204ENST00000475790 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.74■■■■□ 3.95
MEGF6-204ENST00000475790 PRDM2Q13029 1718 aa39.68■■■■□ 3.94
MEGF6-204ENST00000475790 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.49■■■■□ 3.91
MEGF6-204ENST00000475790 TOPBP1Q92547 1522 aa39.14■■■■□ 3.86
MEGF6-204ENST00000475790 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.04■■■■□ 3.84
MEGF6-204ENST00000475790 ABCC8Q09428 1581 aa39.04■■■■□ 3.84
MEGF6-204ENST00000475790 IFT140Q96RY7 1462 aa39■■■■□ 3.83
MEGF6-204ENST00000475790 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39■■■■□ 3.83
MEGF6-204ENST00000475790 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.92■■■■□ 3.82
MEGF6-204ENST00000475790 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.78■■■■□ 3.8
MEGF6-204ENST00000475790 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.77■■■■□ 3.8
MEGF6-204ENST00000475790 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.76■■■■□ 3.8
MEGF6-204ENST00000475790 OSCARQ8IYS5 282 aa38.69■■■■□ 3.78
MEGF6-204ENST00000475790 CUX1P39880 1505 aa38.65■■■■□ 3.78
MEGF6-204ENST00000475790 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.62■■■■□ 3.77
MEGF6-204ENST00000475790 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.61■■■■□ 3.77
MEGF6-204ENST00000475790 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.6■■■■□ 3.77
MEGF6-204ENST00000475790 SOGA1O94964 1423 aa38.56■■■■□ 3.76
MEGF6-204ENST00000475790 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.44■■■■□ 3.74
MEGF6-204ENST00000475790 CHD1O14646 1710 aa38.43■■■■□ 3.74
MEGF6-204ENST00000475790 WDR97A6NE52 1622 aa38.39■■■■□ 3.74
MEGF6-204ENST00000475790 TRIM41Q8WV44 630 aa38.39■■■■□ 3.74
MEGF6-204ENST00000475790 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.25■■■■□ 3.71
MEGF6-204ENST00000475790 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.24■■■■□ 3.71
MEGF6-204ENST00000475790 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.24■■■■□ 3.71
MEGF6-204ENST00000475790 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.24■■■■□ 3.71
MEGF6-204ENST00000475790 FBLN2P98095 1184 aa38.23■■■■□ 3.71
MEGF6-204ENST00000475790 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.19■■■■□ 3.7
MEGF6-204ENST00000475790 GRIN2BQ13224 1484 aa38.18■■■■□ 3.7
MEGF6-204ENST00000475790 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.17■■■■□ 3.7
MEGF6-204ENST00000475790 PBRM1Q86U86 1689 aa38.17■■■■□ 3.7
MEGF6-204ENST00000475790 TOP2BQ02880 1626 aa38.16■■■■□ 3.7
MEGF6-204ENST00000475790 SYNJ1O43426 1573 aa38.16■■■■□ 3.7
MEGF6-204ENST00000475790 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.15■■■■□ 3.7
MEGF6-204ENST00000475790 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.15■■■■□ 3.7
MEGF6-204ENST00000475790 ARHGEF11O15085 1522 aa38.14■■■■□ 3.7
MEGF6-204ENST00000475790 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.12■■■■□ 3.69
MEGF6-204ENST00000475790 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.12■■■■□ 3.69
MEGF6-204ENST00000475790 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.01■■■■□ 3.68
MEGF6-204ENST00000475790 SYNJ2O15056 1496 aa38.01■■■■□ 3.67
MEGF6-204ENST00000475790 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.94■■■■□ 3.66
MEGF6-204ENST00000475790 ARAP1Q96P48 1450 aa37.8■■■■□ 3.64
MEGF6-204ENST00000475790 ADAMTS12P58397 1594 aa37.8■■■■□ 3.64
MEGF6-204ENST00000475790 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.77■■■■□ 3.64
MEGF6-204ENST00000475790 GRIN2AQ12879 1464 aa37.71■■■■□ 3.63
MEGF6-204ENST00000475790 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.7■■■■□ 3.63
MEGF6-204ENST00000475790 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.64■■■■□ 3.62
MEGF6-204ENST00000475790 CEP170Q5SW79 1584 aa37.6■■■■□ 3.61
MEGF6-204ENST00000475790 NUP160Q12769 1436 aa37.56■■■■□ 3.6
MEGF6-204ENST00000475790 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.42■■■■□ 3.58
MEGF6-204ENST00000475790 SHROOM2Q13796 1616 aa37.39■■■■□ 3.58
MEGF6-204ENST00000475790 KIF27Q86VH2 1401 aa37.37■■■■□ 3.57
MEGF6-204ENST00000475790 IGF1RP08069 1367 aa37.3■■■■□ 3.56
MEGF6-204ENST00000475790 CUL7Q14999 1698 aa37.28■■■■□ 3.56
MEGF6-204ENST00000475790 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.26■■■■□ 3.55
MEGF6-204ENST00000475790 TRHP20396 242 aaPredicted RBP37.2■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.7 ms