RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475765.5

FPGS-212, Transcript of folylpolyglutamate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene FPGS, Length 898 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FPGS-212ENST00000475765 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.61■■■■■ 6.33
FPGS-212ENST00000475765 ABCC9O60706 1549 aa49.64■■■■■ 5.54
FPGS-212ENST00000475765 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.18■■■■■ 5.46
FPGS-212ENST00000475765 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.05■■■■■ 5.12
FPGS-212ENST00000475765 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.92■■■■■ 5.1
FPGS-212ENST00000475765 NACADO15069 1562 aa46.61■■■■■ 5.05
FPGS-212ENST00000475765 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.35■■■■■ 5.01
FPGS-212ENST00000475765 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.15■■■■■ 4.98
FPGS-212ENST00000475765 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.95■■■■■ 4.95
FPGS-212ENST00000475765 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.82■■■■■ 4.93
FPGS-212ENST00000475765 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.66■■■■■ 4.9
FPGS-212ENST00000475765 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.17■■■■■ 4.82
FPGS-212ENST00000475765 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.07■■■■■ 4.81
FPGS-212ENST00000475765 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.03■■■■■ 4.8
FPGS-212ENST00000475765 SCRIBQ14160 1630 aa44.81■■■■■ 4.76
FPGS-212ENST00000475765 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.8■■■■■ 4.76
FPGS-212ENST00000475765 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.76■■■■■ 4.76
FPGS-212ENST00000475765 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.6■■■■■ 4.73
FPGS-212ENST00000475765 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.42■■■■■ 4.54
FPGS-212ENST00000475765 NCAPD3P42695 1498 aa43.04■■■■■ 4.48
FPGS-212ENST00000475765 CUX2O14529 1486 aa42.94■■■■■ 4.47
FPGS-212ENST00000475765 ERCC6Q03468 1493 aa42.91■■■■■ 4.46
FPGS-212ENST00000475765 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.85■■■■■ 4.45
FPGS-212ENST00000475765 SMARCA2P51531 1590 aa42.71■■■■■ 4.43
FPGS-212ENST00000475765 SMARCA4P51532 1647 aa42.69■■■■■ 4.42
FPGS-212ENST00000475765 HMGXB3Q12766 1538 aa42.67■■■■■ 4.42
FPGS-212ENST00000475765 NESP48681 1621 aa42.5■■■■■ 4.39
FPGS-212ENST00000475765 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.44■■■■■ 4.38
FPGS-212ENST00000475765 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.43■■■■■ 4.38
FPGS-212ENST00000475765 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.27■■■■■ 4.36
FPGS-212ENST00000475765 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.14■■■■■ 4.34
FPGS-212ENST00000475765 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.14■■■■■ 4.34
FPGS-212ENST00000475765 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.07■■■■■ 4.33
FPGS-212ENST00000475765 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.94■■■■■ 4.3
FPGS-212ENST00000475765 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.93■■■■■ 4.3
FPGS-212ENST00000475765 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.73■■■■■ 4.27
FPGS-212ENST00000475765 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.59■■■■■ 4.25
FPGS-212ENST00000475765 WIZO95785 1651 aa41.55■■■■■ 4.24
FPGS-212ENST00000475765 WDR62O43379 1518 aa41.49■■■■■ 4.23
FPGS-212ENST00000475765 TRIM41Q8WV44 630 aa41.37■■■■■ 4.21
FPGS-212ENST00000475765 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.34■■■■■ 4.21
FPGS-212ENST00000475765 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.26■■■■■ 4.2
FPGS-212ENST00000475765 CFTRP13569 1480 aa41.15■■■■■ 4.18
FPGS-212ENST00000475765 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.05■■■■■ 4.16
FPGS-212ENST00000475765 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41■■■■■ 4.15
FPGS-212ENST00000475765 OSCARQ8IYS5 282 aa40.95■■■■■ 4.15
FPGS-212ENST00000475765 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.93■■■■■ 4.14
FPGS-212ENST00000475765 PRDM2Q13029 1718 aa40.68■■■■■ 4.1
FPGS-212ENST00000475765 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.54■■■■■ 4.08
FPGS-212ENST00000475765 IFT140Q96RY7 1462 aa40.53■■■■■ 4.08
FPGS-212ENST00000475765 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.5■■■■■ 4.07
FPGS-212ENST00000475765 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.42■■■■■ 4.06
FPGS-212ENST00000475765 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.42■■■■■ 4.06
FPGS-212ENST00000475765 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.42■■■■■ 4.06
FPGS-212ENST00000475765 TOPBP1Q92547 1522 aa40.42■■■■■ 4.06
FPGS-212ENST00000475765 ABCC8Q09428 1581 aa40.31■■■■■ 4.04
FPGS-212ENST00000475765 ARHGEF11O15085 1522 aa40.26■■■■■ 4.04
FPGS-212ENST00000475765 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.25■■■■■ 4.03
FPGS-212ENST00000475765 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.23■■■■■ 4.03
FPGS-212ENST00000475765 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.09■■■■■ 4.011e-7■■■□□ 17.9
FPGS-212ENST00000475765 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.07■■■■■ 4.01
FPGS-212ENST00000475765 CHD1O14646 1710 aa40.02■■■■■ 4
FPGS-212ENST00000475765 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.02■■■■■ 4
FPGS-212ENST00000475765 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.98■■■■□ 3.99
FPGS-212ENST00000475765 FBLN2P98095 1184 aa39.96■■■■□ 3.99
FPGS-212ENST00000475765 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.84■■■■□ 3.97
FPGS-212ENST00000475765 ARAP1Q96P48 1450 aa39.83■■■■□ 3.97
FPGS-212ENST00000475765 SOGA1O94964 1423 aa39.81■■■■□ 3.96
FPGS-212ENST00000475765 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.79■■■■□ 3.96
FPGS-212ENST00000475765 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.74■■■■□ 3.95
FPGS-212ENST00000475765 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.68■■■■□ 3.94
FPGS-212ENST00000475765 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.67■■■■□ 3.94
FPGS-212ENST00000475765 WDR97A6NE52 1622 aa39.65■■■■□ 3.94
FPGS-212ENST00000475765 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.58■■■■□ 3.93
FPGS-212ENST00000475765 CUX1P39880 1505 aa39.55■■■■□ 3.92
FPGS-212ENST00000475765 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.55■■■■□ 3.92
FPGS-212ENST00000475765 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.55■■■■□ 3.92
FPGS-212ENST00000475765 SYNJ1O43426 1573 aa39.52■■■■□ 3.92
FPGS-212ENST00000475765 GRIN2BQ13224 1484 aa39.5■■■■□ 3.91
FPGS-212ENST00000475765 SYNJ2O15056 1496 aa39.43■■■■□ 3.9
FPGS-212ENST00000475765 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.31■■■■□ 3.88
FPGS-212ENST00000475765 PBRM1Q86U86 1689 aa39.29■■■■□ 3.88
FPGS-212ENST00000475765 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.19■■■■□ 3.86
FPGS-212ENST00000475765 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.16■■■■□ 3.86
FPGS-212ENST00000475765 GRIN2AQ12879 1464 aa38.99■■■■□ 3.83
FPGS-212ENST00000475765 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.97■■■■□ 3.83
FPGS-212ENST00000475765 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.97■■■■□ 3.83
FPGS-212ENST00000475765 ADAMTS12P58397 1594 aa38.91■■■■□ 3.82
FPGS-212ENST00000475765 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.91■■■■□ 3.82
FPGS-212ENST00000475765 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP38.9■■■■□ 3.82
FPGS-212ENST00000475765 NUP160Q12769 1436 aa38.87■■■■□ 3.81
FPGS-212ENST00000475765 CEP170Q5SW79 1584 aa38.86■■■■□ 3.81
FPGS-212ENST00000475765 TOP2BQ02880 1626 aa38.81■■■■□ 3.8
FPGS-212ENST00000475765 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.8■■■■□ 3.8
FPGS-212ENST00000475765 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.8■■■■□ 3.8
FPGS-212ENST00000475765 SHROOM2Q13796 1616 aa38.73■■■■□ 3.79
FPGS-212ENST00000475765 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.69■■■■□ 3.78
FPGS-212ENST00000475765 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.55■■■■□ 3.76
FPGS-212ENST00000475765 JPH4Q96JJ6 628 aa38.5■■■■□ 3.75
FPGS-212ENST00000475765 KIF13AQ9H1H9 1805 aa38.45■■■■□ 3.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 229.2 ms