RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475658.1

ARRDC1-208, Transcript of arrestin domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene ARRDC1, Length 854 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC1-208ENST00000475658 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.17■■■■■ 5.94
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ARRDC1-208ENST00000475658 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.62■■■■■ 4.41
ARRDC1-208ENST00000475658 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.55■■■■■ 4.4
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ARRDC1-208ENST00000475658 ERCC6Q03468 1493 aa40.78■■■■■ 4.12
ARRDC1-208ENST00000475658 CUX2O14529 1486 aa40.77■■■■■ 4.12
ARRDC1-208ENST00000475658 SMARCA4P51532 1647 aa40.75■■■■■ 4.11
ARRDC1-208ENST00000475658 SMARCA2P51531 1590 aa40.73■■■■■ 4.11
ARRDC1-208ENST00000475658 HMGXB3Q12766 1538 aa40.68■■■■■ 4.1
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ARRDC1-208ENST00000475658 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.6■■■■□ 3.93
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ARRDC1-208ENST00000475658 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.39■■■■□ 3.9
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ARRDC1-208ENST00000475658 TRIM41Q8WV44 630 aa39.21■■■■□ 3.87
ARRDC1-208ENST00000475658 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.19■■■■□ 3.86
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ARRDC1-208ENST00000475658 OSCARQ8IYS5 282 aa38.89■■■■□ 3.82
ARRDC1-208ENST00000475658 PRDM2Q13029 1718 aa38.81■■■■□ 3.8
ARRDC1-208ENST00000475658 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.76■■■■□ 3.8
ARRDC1-208ENST00000475658 IFT140Q96RY7 1462 aa38.6■■■■□ 3.77
ARRDC1-208ENST00000475658 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.59■■■■□ 3.77
ARRDC1-208ENST00000475658 TOPBP1Q92547 1522 aa38.55■■■■□ 3.76
ARRDC1-208ENST00000475658 ABCC8Q09428 1581 aa38.43■■■■□ 3.74
ARRDC1-208ENST00000475658 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.41■■■■□ 3.74
ARRDC1-208ENST00000475658 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.41■■■■□ 3.74
ARRDC1-208ENST00000475658 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.41■■■■□ 3.74
ARRDC1-208ENST00000475658 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.38■■■■□ 3.73
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ARRDC1-208ENST00000475658 ARHGEF11O15085 1522 aa38.27■■■■□ 3.72
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ARRDC1-208ENST00000475658 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.03■■■■□ 3.68
ARRDC1-208ENST00000475658 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.02■■■■□ 3.68
ARRDC1-208ENST00000475658 SOGA1O94964 1423 aa37.96■■■■□ 3.67
ARRDC1-208ENST00000475658 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.93■■■■□ 3.66
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ARRDC1-208ENST00000475658 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.87■■■■□ 3.65
ARRDC1-208ENST00000475658 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.82■■■■□ 3.64
ARRDC1-208ENST00000475658 CUX1P39880 1505 aa37.8■■■■□ 3.64
ARRDC1-208ENST00000475658 WDR97A6NE52 1622 aa37.78■■■■□ 3.64
ARRDC1-208ENST00000475658 TRHP20396 242 aaPredicted RBP37.69■■■■□ 3.62
ARRDC1-208ENST00000475658 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.69■■■■□ 3.62
ARRDC1-208ENST00000475658 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.68■■■■□ 3.62
ARRDC1-208ENST00000475658 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.67■■■■□ 3.62
ARRDC1-208ENST00000475658 GRIN2BQ13224 1484 aa37.66■■■■□ 3.62
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ARRDC1-208ENST00000475658 ADAMTS12P58397 1594 aa37.12■■■■□ 3.53
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ARRDC1-208ENST00000475658 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.01■■■■□ 3.51
ARRDC1-208ENST00000475658 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.93■■■■□ 3.5
ARRDC1-208ENST00000475658 SHROOM2Q13796 1616 aa36.92■■■■□ 3.5
ARRDC1-208ENST00000475658 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP36.78■■■■□ 3.48
ARRDC1-208ENST00000475658 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36.74■■■■□ 3.47
ARRDC1-208ENST00000475658 JPH4Q96JJ6 628 aa36.7■■■■□ 3.47
ARRDC1-208ENST00000475658 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.6■■■■□ 3.45
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