RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475417.1

GPLD1-204, Transcript of glycosylphosphatidylinositol specific phospholipase D1, humanhuman

TSL 3

Gene GPLD1, Length 604 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPLD1-204ENST00000475417 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.3■■■■■ 7.24
GPLD1-204ENST00000475417 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.82■■■■■ 6.21
GPLD1-204ENST00000475417 ABCC9O60706 1549 aa53.48■■■■■ 6.15
GPLD1-204ENST00000475417 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.06■■■■■ 5.77
GPLD1-204ENST00000475417 NACADO15069 1562 aa50.86■■■■■ 5.73
GPLD1-204ENST00000475417 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.64■■■■■ 5.7
GPLD1-204ENST00000475417 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.38■■■■■ 5.66
GPLD1-204ENST00000475417 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.05■■■■■ 5.6
GPLD1-204ENST00000475417 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.96■■■■■ 5.59
GPLD1-204ENST00000475417 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.91■■■■■ 5.58
GPLD1-204ENST00000475417 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.86■■■■■ 5.57
GPLD1-204ENST00000475417 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.84■■■■■ 5.57
GPLD1-204ENST00000475417 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.64■■■■■ 5.54
GPLD1-204ENST00000475417 SCRIBQ14160 1630 aa49.05■■■■■ 5.44
GPLD1-204ENST00000475417 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.01■■■■■ 5.44
GPLD1-204ENST00000475417 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.34■■■■■ 5.33
GPLD1-204ENST00000475417 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.32■■■■■ 5.33
GPLD1-204ENST00000475417 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.16■■■■■ 5.3
GPLD1-204ENST00000475417 NCAPD3P42695 1498 aa47.02■■■■■ 5.12
GPLD1-204ENST00000475417 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.91■■■■■ 5.1
GPLD1-204ENST00000475417 SMARCA4P51532 1647 aa46.89■■■■■ 5.1
GPLD1-204ENST00000475417 SMARCA2P51531 1590 aa46.73■■■■■ 5.07
GPLD1-204ENST00000475417 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.73■■■■■ 5.07
GPLD1-204ENST00000475417 HMGXB3Q12766 1538 aa46.64■■■■■ 5.06
GPLD1-204ENST00000475417 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.51■■■■■ 5.04
GPLD1-204ENST00000475417 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.45■■■■■ 5.03
GPLD1-204ENST00000475417 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.41■■■■■ 5.02
GPLD1-204ENST00000475417 ERCC6Q03468 1493 aa46.1■■■■■ 4.97
GPLD1-204ENST00000475417 NESP48681 1621 aa46.08■■■■■ 4.97
GPLD1-204ENST00000475417 CUX2O14529 1486 aa45.96■■■■■ 4.95
GPLD1-204ENST00000475417 WIZO95785 1651 aa45.85■■■■■ 4.93
GPLD1-204ENST00000475417 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.81■■■■■ 4.92
GPLD1-204ENST00000475417 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.69■■■■■ 4.9
GPLD1-204ENST00000475417 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.6■■■■■ 4.89
GPLD1-204ENST00000475417 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.56■■■■■ 4.88
GPLD1-204ENST00000475417 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.56■■■■■ 4.88
GPLD1-204ENST00000475417 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.5■■■■■ 4.87
GPLD1-204ENST00000475417 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.41■■■■■ 4.86
GPLD1-204ENST00000475417 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.32■■■■■ 4.85
GPLD1-204ENST00000475417 CFTRP13569 1480 aa45.17■■■■■ 4.82
GPLD1-204ENST00000475417 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.12■■■■■ 4.81
GPLD1-204ENST00000475417 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.03■■■■■ 4.8
GPLD1-204ENST00000475417 WDR62O43379 1518 aa45.01■■■■■ 4.8
GPLD1-204ENST00000475417 CEP164Q9UPV0 1460 aa45■■■■■ 4.79
GPLD1-204ENST00000475417 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.86■■■■■ 4.77
GPLD1-204ENST00000475417 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.65■■■■■ 4.74
GPLD1-204ENST00000475417 PRDM2Q13029 1718 aa44.54■■■■■ 4.72
GPLD1-204ENST00000475417 TOPBP1Q92547 1522 aa44.22■■■■■ 4.67
GPLD1-204ENST00000475417 ABCC8Q09428 1581 aa44.16■■■■■ 4.66
GPLD1-204ENST00000475417 IFT140Q96RY7 1462 aa44.13■■■■■ 4.65
GPLD1-204ENST00000475417 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.06■■■■■ 4.64
GPLD1-204ENST00000475417 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.03■■■■■ 4.64
GPLD1-204ENST00000475417 OSCARQ8IYS5 282 aa43.97■■■■■ 4.63
GPLD1-204ENST00000475417 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.87■■■■■ 4.61
GPLD1-204ENST00000475417 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.81■■■■■ 4.6
GPLD1-204ENST00000475417 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.79■■■■■ 4.6
GPLD1-204ENST00000475417 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.73■■■■■ 4.59
GPLD1-204ENST00000475417 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.69■■■■■ 4.58
GPLD1-204ENST00000475417 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.64■■■■■ 4.58
GPLD1-204ENST00000475417 SOGA1O94964 1423 aa43.63■■■■■ 4.57
GPLD1-204ENST00000475417 CUX1P39880 1505 aa43.61■■■■■ 4.57
GPLD1-204ENST00000475417 TRIM41Q8WV44 630 aa43.6■■■■■ 4.57
GPLD1-204ENST00000475417 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.57■■■■■ 4.56
GPLD1-204ENST00000475417 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.49■■■■■ 4.55
GPLD1-204ENST00000475417 WDR97A6NE52 1622 aa43.36■■■■■ 4.53
GPLD1-204ENST00000475417 CHD1O14646 1710 aa43.27■■■■■ 4.52
GPLD1-204ENST00000475417 FBLN2P98095 1184 aa43.26■■■■■ 4.52
GPLD1-204ENST00000475417 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.26■■■■■ 4.52
GPLD1-204ENST00000475417 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.26■■■■■ 4.52
GPLD1-204ENST00000475417 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.26■■■■■ 4.52
GPLD1-204ENST00000475417 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.21■■■■■ 4.51
GPLD1-204ENST00000475417 ARHGEF11O15085 1522 aa43.2■■■■■ 4.51
GPLD1-204ENST00000475417 GRIN2BQ13224 1484 aa43.18■■■■■ 4.5
GPLD1-204ENST00000475417 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.14■■■■■ 4.5
GPLD1-204ENST00000475417 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.13■■■■■ 4.5
GPLD1-204ENST00000475417 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.08■■■■■ 4.49
GPLD1-204ENST00000475417 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.05■■■■■ 4.48
GPLD1-204ENST00000475417 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.04■■■■■ 4.48
GPLD1-204ENST00000475417 TOP2BQ02880 1626 aa43■■■■■ 4.47
GPLD1-204ENST00000475417 SYNJ2O15056 1496 aa43■■■■■ 4.47
GPLD1-204ENST00000475417 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.97■■■■■ 4.47
GPLD1-204ENST00000475417 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.97■■■■■ 4.47
GPLD1-204ENST00000475417 SYNJ1O43426 1573 aa42.95■■■■■ 4.47
GPLD1-204ENST00000475417 PBRM1Q86U86 1689 aa42.91■■■■■ 4.46
GPLD1-204ENST00000475417 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.91■■■■■ 4.46
GPLD1-204ENST00000475417 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.89■■■■■ 4.46
GPLD1-204ENST00000475417 ARAP1Q96P48 1450 aa42.83■■■■■ 4.45
GPLD1-204ENST00000475417 GRIN2AQ12879 1464 aa42.62■■■■■ 4.41
GPLD1-204ENST00000475417 ADAMTS12P58397 1594 aa42.61■■■■■ 4.41
GPLD1-204ENST00000475417 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.58■■■■■ 4.41
GPLD1-204ENST00000475417 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.57■■■■■ 4.41
GPLD1-204ENST00000475417 NUP160Q12769 1436 aa42.52■■■■■ 4.4
GPLD1-204ENST00000475417 CEP170Q5SW79 1584 aa42.44■■■■■ 4.38
GPLD1-204ENST00000475417 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.27■■■■■ 4.36
GPLD1-204ENST00000475417 SHROOM2Q13796 1616 aa42.22■■■■■ 4.35
GPLD1-204ENST00000475417 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.22■■■■■ 4.35
GPLD1-204ENST00000475417 IGF1RP08069 1367 aa42.21■■■■■ 4.35
GPLD1-204ENST00000475417 KIF27Q86VH2 1401 aa42.19■■■■■ 4.34
GPLD1-204ENST00000475417 JPH4Q96JJ6 628 aa42.09■■■■■ 4.33
GPLD1-204ENST00000475417 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.03■■■■■ 4.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms