RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475241.1

PKDCC-204, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 3

Gene PKDCC, Length 773 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-204ENST00000475241 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.05■■■■■ 4.16
PKDCC-204ENST00000475241 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.53■■■■□ 3.44
PKDCC-204ENST00000475241 ABCC9O60706 1549 aa35.69■■■■□ 3.3
PKDCC-204ENST00000475241 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.4■■■■□ 3.1
PKDCC-204ENST00000475241 NACADO15069 1562 aa34.39■■■■□ 3.1
PKDCC-204ENST00000475241 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.24■■■■□ 3.07
PKDCC-204ENST00000475241 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.24■■■■□ 3.07
PKDCC-204ENST00000475241 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.18■■■■□ 3.06
PKDCC-204ENST00000475241 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.04■■■■□ 3.04
PKDCC-204ENST00000475241 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.52■■■□□ 2.96
PKDCC-204ENST00000475241 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.34■■■□□ 2.93
PKDCC-204ENST00000475241 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.32■■■□□ 2.92
PKDCC-204ENST00000475241 SCRIBQ14160 1630 aa33.21■■■□□ 2.91
PKDCC-204ENST00000475241 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.11■■■□□ 2.89
PKDCC-204ENST00000475241 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.82■■■□□ 2.84
PKDCC-204ENST00000475241 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.45■■■□□ 2.79
PKDCC-204ENST00000475241 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.31■■■□□ 2.76
PKDCC-204ENST00000475241 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.13■■■□□ 2.73
PKDCC-204ENST00000475241 SMARCA4P51532 1647 aa31.83■■■□□ 2.69
PKDCC-204ENST00000475241 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.83■■■□□ 2.69
PKDCC-204ENST00000475241 NCAPD3P42695 1498 aa31.74■■■□□ 2.67
PKDCC-204ENST00000475241 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.7■■■□□ 2.66
PKDCC-204ENST00000475241 SMARCA2P51531 1590 aa31.69■■■□□ 2.66
PKDCC-204ENST00000475241 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.6■■■□□ 2.65
PKDCC-204ENST00000475241 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.59■■■□□ 2.65
PKDCC-204ENST00000475241 HMGXB3Q12766 1538 aa31.55■■■□□ 2.64
PKDCC-204ENST00000475241 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.42■■■□□ 2.62
PKDCC-204ENST00000475241 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.25■■■□□ 2.59
PKDCC-204ENST00000475241 WIZO95785 1651 aa31.21■■■□□ 2.59
PKDCC-204ENST00000475241 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.94■■■□□ 2.54
PKDCC-204ENST00000475241 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.88■■■□□ 2.53
PKDCC-204ENST00000475241 NESP48681 1621 aa30.86■■■□□ 2.53
PKDCC-204ENST00000475241 ERCC6Q03468 1493 aa30.81■■■□□ 2.52
PKDCC-204ENST00000475241 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.79■■■□□ 2.52
PKDCC-204ENST00000475241 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.7■■■□□ 2.5
PKDCC-204ENST00000475241 CFTRP13569 1480 aa30.6■■■□□ 2.49
PKDCC-204ENST00000475241 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.57■■■□□ 2.48
PKDCC-204ENST00000475241 CUX2O14529 1486 aa30.57■■■□□ 2.48
PKDCC-204ENST00000475241 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.49■■■□□ 2.47
PKDCC-204ENST00000475241 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
PKDCC-204ENST00000475241 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.39■■■□□ 2.46
PKDCC-204ENST00000475241 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.37■■■□□ 2.45
PKDCC-204ENST00000475241 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
PKDCC-204ENST00000475241 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.34■■■□□ 2.45
PKDCC-204ENST00000475241 PRDM2Q13029 1718 aa30.3■■■□□ 2.44
PKDCC-204ENST00000475241 WDR62O43379 1518 aa30.24■■■□□ 2.43
PKDCC-204ENST00000475241 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
PKDCC-204ENST00000475241 ABCC8Q09428 1581 aa30■■■□□ 2.39
PKDCC-204ENST00000475241 TOPBP1Q92547 1522 aa29.91■■■□□ 2.38
PKDCC-204ENST00000475241 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.87■■■□□ 2.37
PKDCC-204ENST00000475241 IFT140Q96RY7 1462 aa29.77■■■□□ 2.36
PKDCC-204ENST00000475241 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.68■■■□□ 2.34
PKDCC-204ENST00000475241 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.64■■■□□ 2.34
PKDCC-204ENST00000475241 CUX1P39880 1505 aa29.64■■■□□ 2.34
PKDCC-204ENST00000475241 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
PKDCC-204ENST00000475241 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
PKDCC-204ENST00000475241 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.55■■■□□ 2.32
PKDCC-204ENST00000475241 SOGA1O94964 1423 aa29.54■■■□□ 2.32
PKDCC-204ENST00000475241 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.48■■■□□ 2.31
PKDCC-204ENST00000475241 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.47■■■□□ 2.31
PKDCC-204ENST00000475241 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
PKDCC-204ENST00000475241 WDR97A6NE52 1622 aa29.43■■■□□ 2.3
PKDCC-204ENST00000475241 TOP2BQ02880 1626 aa29.41■■■□□ 2.3
PKDCC-204ENST00000475241 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.41■■■□□ 2.3
PKDCC-204ENST00000475241 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.39■■■□□ 2.3
PKDCC-204ENST00000475241 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
PKDCC-204ENST00000475241 SYNJ1O43426 1573 aa29.34■■■□□ 2.29
PKDCC-204ENST00000475241 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.31■■■□□ 2.28
PKDCC-204ENST00000475241 OSCARQ8IYS5 282 aa29.3■■■□□ 2.28
PKDCC-204ENST00000475241 GRIN2BQ13224 1484 aa29.22■■■□□ 2.27
PKDCC-204ENST00000475241 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.2■■■□□ 2.26
PKDCC-204ENST00000475241 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
PKDCC-204ENST00000475241 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.16■■■□□ 2.26
PKDCC-204ENST00000475241 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.12■■■□□ 2.25
PKDCC-204ENST00000475241 PBRM1Q86U86 1689 aa29.07■■■□□ 2.24
PKDCC-204ENST00000475241 FBLN2P98095 1184 aa29.05■■■□□ 2.24
PKDCC-204ENST00000475241 CHD1O14646 1710 aa29.05■■■□□ 2.24
PKDCC-204ENST00000475241 SYNJ2O15056 1496 aa29.03■■■□□ 2.24
PKDCC-204ENST00000475241 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
PKDCC-204ENST00000475241 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.98■■■□□ 2.23
PKDCC-204ENST00000475241 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.88■■■□□ 2.21
PKDCC-204ENST00000475241 KIF27Q86VH2 1401 aa28.88■■■□□ 2.21
PKDCC-204ENST00000475241 ADAMTS12P58397 1594 aa28.87■■■□□ 2.21
PKDCC-204ENST00000475241 GRIN2AQ12879 1464 aa28.82■■■□□ 2.2
PKDCC-204ENST00000475241 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.8■■■□□ 2.2
PKDCC-204ENST00000475241 IGF1RP08069 1367 aa28.77■■■□□ 2.2
PKDCC-204ENST00000475241 ARHGEF11O15085 1522 aa28.75■■■□□ 2.19
PKDCC-204ENST00000475241 TRIM41Q8WV44 630 aa28.74■■■□□ 2.19
PKDCC-204ENST00000475241 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.73■■■□□ 2.19
PKDCC-204ENST00000475241 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.73■■■□□ 2.19
PKDCC-204ENST00000475241 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.73■■■□□ 2.19
PKDCC-204ENST00000475241 NUP160Q12769 1436 aa28.72■■■□□ 2.19
PKDCC-204ENST00000475241 CUL7Q14999 1698 aa28.67■■■□□ 2.18
PKDCC-204ENST00000475241 CEP170Q5SW79 1584 aa28.63■■■□□ 2.17
PKDCC-204ENST00000475241 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.59■■■□□ 2.17
PKDCC-204ENST00000475241 ARAP1Q96P48 1450 aa28.51■■■□□ 2.15
PKDCC-204ENST00000475241 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.5■■■□□ 2.15
PKDCC-204ENST00000475241 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.49■■■□□ 2.15
PKDCC-204ENST00000475241 SHROOM2Q13796 1616 aa28.49■■■□□ 2.15
PKDCC-204ENST00000475241 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.45■■■□□ 2.15
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