RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475208.5

TMEM54-205, Transcript of transmembrane protein 54, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TMEM54, Length 768 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54-205ENST00000475208 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.7■■■■■ 7.63
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TMEM54-205ENST00000475208 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.66■■■■■ 6.18
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TMEM54-205ENST00000475208 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.67■■■■■ 5.22
TMEM54-205ENST00000475208 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.42■■■■■ 5.18
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TMEM54-205ENST00000475208 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.15■■■■■ 5.14
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TMEM54-205ENST00000475208 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.58■■■■■ 5.05
TMEM54-205ENST00000475208 OSCARQ8IYS5 282 aa46.4■■■■■ 5.02
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TMEM54-205ENST00000475208 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.84■■■■■ 4.93
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TMEM54-205ENST00000475208 SOGA1O94964 1423 aa45.53■■■■■ 4.88
TMEM54-205ENST00000475208 FBLN2P98095 1184 aa45.48■■■■■ 4.87
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TMEM54-205ENST00000475208 WDR97A6NE52 1622 aa45.37■■■■■ 4.85
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TMEM54-205ENST00000475208 SHROOM2Q13796 1616 aa44.26■■■■■ 4.68
TMEM54-205ENST00000475208 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP44.02■■■■■ 4.64
TMEM54-205ENST00000475208 JPH4Q96JJ6 628 aa43.96■■■■■ 4.63
TMEM54-205ENST00000475208 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.95■■■■■ 4.63
TMEM54-205ENST00000475208 KIF27Q86VH2 1401 aa43.77■■■■■ 4.6
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