RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475170.5

ITGB2-209, Transcript of integrin subunit beta 2, humanhuman

TSL 2

Gene ITGB2, Length 2,125 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2-209ENST00000475170 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.06■■■■□ 3.68
ITGB2-209ENST00000475170 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.13■■■□□ 2.89
ITGB2-209ENST00000475170 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.96■■■□□ 2.71
ITGB2-209ENST00000475170 ABCC9O60706 1549 aa31.49■■■□□ 2.63
ITGB2-209ENST00000475170 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.48■■■□□ 2.63
ITGB2-209ENST00000475170 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.43■■■□□ 2.62
ITGB2-209ENST00000475170 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.08■■■□□ 2.57
ITGB2-209ENST00000475170 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.05■■■□□ 2.56
ITGB2-209ENST00000475170 NACADO15069 1562 aa30.9■■■□□ 2.54
ITGB2-209ENST00000475170 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.64■■■□□ 2.5
ITGB2-209ENST00000475170 SCRIBQ14160 1630 aa30.53■■■□□ 2.48
ITGB2-209ENST00000475170 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.08■■■□□ 2.41
ITGB2-209ENST00000475170 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
ITGB2-209ENST00000475170 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.82■■■□□ 2.36
ITGB2-209ENST00000475170 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.74■■■□□ 2.35
ITGB2-209ENST00000475170 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.65■■■□□ 2.34
ITGB2-209ENST00000475170 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
ITGB2-209ENST00000475170 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.44■■■□□ 2.3
ITGB2-209ENST00000475170 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
ITGB2-209ENST00000475170 SMARCA4P51532 1647 aa29.25■■■□□ 2.27
ITGB2-209ENST00000475170 WIZO95785 1651 aa29.18■■■□□ 2.26
ITGB2-209ENST00000475170 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.9■■■□□ 2.22
ITGB2-209ENST00000475170 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
ITGB2-209ENST00000475170 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
ITGB2-209ENST00000475170 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.82■■■□□ 2.2
ITGB2-209ENST00000475170 SMARCA2P51531 1590 aa28.73■■■□□ 2.19
ITGB2-209ENST00000475170 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
ITGB2-209ENST00000475170 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.59■■■□□ 2.17
ITGB2-209ENST00000475170 NCAPD3P42695 1498 aa28.58■■■□□ 2.17
ITGB2-209ENST00000475170 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.55■■■□□ 2.16
ITGB2-209ENST00000475170 HMGXB3Q12766 1538 aa28.48■■■□□ 2.15
ITGB2-209ENST00000475170 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.47■■■□□ 2.15
ITGB2-209ENST00000475170 TRIM41Q8WV44 630 aa28.02■■■□□ 2.08
ITGB2-209ENST00000475170 ABCC8Q09428 1581 aa27.97■■■□□ 2.07
ITGB2-209ENST00000475170 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.97■■■□□ 2.07
ITGB2-209ENST00000475170 CFTRP13569 1480 aa27.93■■■□□ 2.06
ITGB2-209ENST00000475170 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.85■■■□□ 2.05
ITGB2-209ENST00000475170 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.76■■■□□ 2.03
ITGB2-209ENST00000475170 PRDM2Q13029 1718 aa27.68■■■□□ 2.02
ITGB2-209ENST00000475170 SYNJ1O43426 1573 aa27.68■■■□□ 2.02
ITGB2-209ENST00000475170 NESP48681 1621 aa27.67■■■□□ 2.02
ITGB2-209ENST00000475170 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.56■■■□□ 2
ITGB2-209ENST00000475170 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
ITGB2-209ENST00000475170 TOP2BQ02880 1626 aa27.53■■■□□ 2
ITGB2-209ENST00000475170 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.52■■■□□ 2
ITGB2-209ENST00000475170 CUX1P39880 1505 aa27.51■■■□□ 2
ITGB2-209ENST00000475170 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.5■■□□□ 1.99
ITGB2-209ENST00000475170 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.49■■□□□ 1.99
ITGB2-209ENST00000475170 SOGA1O94964 1423 aa27.46■■□□□ 1.99
ITGB2-209ENST00000475170 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.38■■□□□ 1.97
ITGB2-209ENST00000475170 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.36■■□□□ 1.97
ITGB2-209ENST00000475170 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.32■■□□□ 1.96
ITGB2-209ENST00000475170 EEA1Q15075 1411 aa27.27■■□□□ 1.96
ITGB2-209ENST00000475170 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.26■■□□□ 1.95
ITGB2-209ENST00000475170 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.23■■□□□ 1.95
ITGB2-209ENST00000475170 TOPBP1Q92547 1522 aa27.22■■□□□ 1.95
ITGB2-209ENST00000475170 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
ITGB2-209ENST00000475170 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.21■■□□□ 1.95
ITGB2-209ENST00000475170 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.2■■□□□ 1.95
ITGB2-209ENST00000475170 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.19■■□□□ 1.94
ITGB2-209ENST00000475170 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
ITGB2-209ENST00000475170 KIF27Q86VH2 1401 aa27.04■■□□□ 1.92
ITGB2-209ENST00000475170 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.04■■□□□ 1.92
ITGB2-209ENST00000475170 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.02■■□□□ 1.92
ITGB2-209ENST00000475170 CUX2O14529 1486 aa27.01■■□□□ 1.91
ITGB2-209ENST00000475170 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.96■■□□□ 1.91
ITGB2-209ENST00000475170 ERCC6Q03468 1493 aa26.94■■□□□ 1.9
ITGB2-209ENST00000475170 KIF21BO75037 1637 aa26.94■■□□□ 1.9
ITGB2-209ENST00000475170 GOLGA3Q08378 1498 aa26.91■■□□□ 1.9
ITGB2-209ENST00000475170 PRXQ9BXM0 1461 aa26.9■■□□□ 1.9
ITGB2-209ENST00000475170 IGF1RP08069 1367 aa26.89■■□□□ 1.9
ITGB2-209ENST00000475170 WDR62O43379 1518 aa26.89■■□□□ 1.89
ITGB2-209ENST00000475170 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.88■■□□□ 1.89
ITGB2-209ENST00000475170 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.86■■□□□ 1.89
ITGB2-209ENST00000475170 WDR97A6NE52 1622 aa26.85■■□□□ 1.89
ITGB2-209ENST00000475170 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
ITGB2-209ENST00000475170 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
ITGB2-209ENST00000475170 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
ITGB2-209ENST00000475170 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
ITGB2-209ENST00000475170 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.77■■□□□ 1.88
ITGB2-209ENST00000475170 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.73■■□□□ 1.87
ITGB2-209ENST00000475170 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.72■■□□□ 1.87
ITGB2-209ENST00000475170 CEP162Q5TB80 1403 aa26.71■■□□□ 1.87
ITGB2-209ENST00000475170 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.69■■□□□ 1.86
ITGB2-209ENST00000475170 IFT140Q96RY7 1462 aa26.67■■□□□ 1.86
ITGB2-209ENST00000475170 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.62■■□□□ 1.85
ITGB2-209ENST00000475170 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
ITGB2-209ENST00000475170 CUL7Q14999 1698 aa26.57■■□□□ 1.84
ITGB2-209ENST00000475170 CLIP1P30622 1438 aa26.51■■□□□ 1.83
ITGB2-209ENST00000475170 PBRM1Q86U86 1689 aa26.5■■□□□ 1.83
ITGB2-209ENST00000475170 GRIN2BQ13224 1484 aa26.47■■□□□ 1.83
ITGB2-209ENST00000475170 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
ITGB2-209ENST00000475170 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.83
ITGB2-209ENST00000475170 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.39■■□□□ 1.82
ITGB2-209ENST00000475170 ADAMTS12P58397 1594 aa26.37■■□□□ 1.81
ITGB2-209ENST00000475170 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.33■■□□□ 1.8
ITGB2-209ENST00000475170 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.3■■□□□ 1.8
ITGB2-209ENST00000475170 ARAP1Q96P48 1450 aa26.3■■□□□ 1.8
ITGB2-209ENST00000475170 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.27■■□□□ 1.8
ITGB2-209ENST00000475170 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.9 ms