RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475170.5

ITGB2-209, Transcript of integrin subunit beta 2, humanhuman

TSL 2

Gene ITGB2, Length 2,125 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2-209ENST00000475170 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.06■■■■□ 3.68
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ITGB2-209ENST00000475170 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
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ITGB2-209ENST00000475170 SMARCA2P51531 1590 aa28.73■■■□□ 2.19
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ITGB2-209ENST00000475170 CFTRP13569 1480 aa27.93■■■□□ 2.06
ITGB2-209ENST00000475170 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.85■■■□□ 2.05
ITGB2-209ENST00000475170 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.76■■■□□ 2.03
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ITGB2-209ENST00000475170 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.56■■■□□ 2
ITGB2-209ENST00000475170 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
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ITGB2-209ENST00000475170 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.5■■□□□ 1.99
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ITGB2-209ENST00000475170 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.32■■□□□ 1.96
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ITGB2-209ENST00000475170 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.2■■□□□ 1.95
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ITGB2-209ENST00000475170 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.04■■□□□ 1.92
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ITGB2-209ENST00000475170 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.72■■□□□ 1.87
ITGB2-209ENST00000475170 CEP162Q5TB80 1403 aa26.71■■□□□ 1.87
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ITGB2-209ENST00000475170 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
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ITGB2-209ENST00000475170 ADAMTS12P58397 1594 aa26.37■■□□□ 1.81
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ITGB2-209ENST00000475170 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.3■■□□□ 1.8
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ITGB2-209ENST00000475170 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.27■■□□□ 1.8
ITGB2-209ENST00000475170 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.26■■□□□ 1.79
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