RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474952.5

TFAP2A-210, Transcript of transcription factor AP-2 alpha, humanhuman

TSL 5

Gene TFAP2A, Length 1,621 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2A-210ENST00000474952 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.28■■■■■ 6.6
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TFAP2A-210ENST00000474952 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.54■■■■■ 5.04
TFAP2A-210ENST00000474952 ABCC9O60706 1549 aa46.51■■■■■ 5.04
TFAP2A-210ENST00000474952 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.45■■■■■ 5.03
TFAP2A-210ENST00000474952 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.02■■■■■ 4.96
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TFAP2A-210ENST00000474952 NACADO15069 1562 aa45.77■■■■■ 4.92
TFAP2A-210ENST00000474952 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.4■■■■■ 4.86
TFAP2A-210ENST00000474952 SCRIBQ14160 1630 aa45.17■■■■■ 4.82
TFAP2A-210ENST00000474952 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.53■■■■■ 4.72
TFAP2A-210ENST00000474952 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.05■■■■■ 4.64
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TFAP2A-210ENST00000474952 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.73■■■■■ 4.59
TFAP2A-210ENST00000474952 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.61■■■■■ 4.57
TFAP2A-210ENST00000474952 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.48■■■■■ 4.55
TFAP2A-210ENST00000474952 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.46■■■■■ 4.55
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TFAP2A-210ENST00000474952 WIZO95785 1651 aa43.13■■■■■ 4.5
TFAP2A-210ENST00000474952 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.77■■■■■ 4.44
TFAP2A-210ENST00000474952 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.71■■■■■ 4.43
TFAP2A-210ENST00000474952 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.68■■■■■ 4.42
TFAP2A-210ENST00000474952 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.59■■■■■ 4.41
TFAP2A-210ENST00000474952 SMARCA2P51531 1590 aa42.57■■■■■ 4.41
TFAP2A-210ENST00000474952 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.34■■■■■ 4.37
TFAP2A-210ENST00000474952 NCAPD3P42695 1498 aa42.23■■■■■ 4.35
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TFAP2A-210ENST00000474952 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.11■■■■■ 4.33
TFAP2A-210ENST00000474952 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.11■■■■■ 4.33
TFAP2A-210ENST00000474952 TRIM41Q8WV44 630 aa41.4■■■■■ 4.22
TFAP2A-210ENST00000474952 ABCC8Q09428 1581 aa41.32■■■■■ 4.2
TFAP2A-210ENST00000474952 CFTRP13569 1480 aa41.27■■■■■ 4.2
TFAP2A-210ENST00000474952 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.14■■■■■ 4.18
TFAP2A-210ENST00000474952 PRDM2Q13029 1718 aa41.12■■■■■ 4.17
TFAP2A-210ENST00000474952 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.09■■■■■ 4.17
TFAP2A-210ENST00000474952 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.05■■■■■ 4.16
TFAP2A-210ENST00000474952 SYNJ1O43426 1573 aa40.91■■■■■ 4.14
TFAP2A-210ENST00000474952 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.83■■■■■ 4.13
TFAP2A-210ENST00000474952 NESP48681 1621 aa40.82■■■■■ 4.12
TFAP2A-210ENST00000474952 TOP2BQ02880 1626 aa40.75■■■■■ 4.11
TFAP2A-210ENST00000474952 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.73■■■■■ 4.11
TFAP2A-210ENST00000474952 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.69■■■■■ 4.1
TFAP2A-210ENST00000474952 CUX1P39880 1505 aa40.66■■■■■ 4.1
TFAP2A-210ENST00000474952 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.64■■■■■ 4.1
TFAP2A-210ENST00000474952 SOGA1O94964 1423 aa40.51■■■■■ 4.08
TFAP2A-210ENST00000474952 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.49■■■■■ 4.07
TFAP2A-210ENST00000474952 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.49■■■■■ 4.07
TFAP2A-210ENST00000474952 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.44■■■■■ 4.06
TFAP2A-210ENST00000474952 EEA1Q15075 1411 aa40.42■■■■■ 4.06
TFAP2A-210ENST00000474952 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.37■■■■■ 4.05
TFAP2A-210ENST00000474952 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.36■■■■■ 4.05
TFAP2A-210ENST00000474952 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.33■■■■■ 4.05
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TFAP2A-210ENST00000474952 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.23■■■■■ 4.03
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TFAP2A-210ENST00000474952 KIF27Q86VH2 1401 aa40.02■■■■■ 4
TFAP2A-210ENST00000474952 MRC2Q9UBG0 1479 aa40■■■■□ 3.99
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TFAP2A-210ENST00000474952 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.91■■■■□ 3.98
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TFAP2A-210ENST00000474952 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.51■■■■□ 3.92
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TFAP2A-210ENST00000474952 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP39.03■■■■□ 3.84
TFAP2A-210ENST00000474952 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa38.98■■■■□ 3.83
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TFAP2A-210ENST00000474952 ARAP1Q96P48 1450 aa38.86■■■■□ 3.81
TFAP2A-210ENST00000474952 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.86■■■■□ 3.81
TFAP2A-210ENST00000474952 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa38.86■■■■□ 3.81
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