RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474895.6

USP20-205, Transcript of ubiquitin specific peptidase 20, humanhuman

TSL 5

Gene USP20, Length 825 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20-205ENST00000474895 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.36■■■□□ 2.77
USP20-205ENST00000474895 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.09■■■□□ 2.25
USP20-205ENST00000474895 ABCC9O60706 1549 aa28.95■■■□□ 2.23
USP20-205ENST00000474895 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.63■■■□□ 2.01
USP20-205ENST00000474895 NACADO15069 1562 aa27.47■■□□□ 1.99
USP20-205ENST00000474895 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.15■■□□□ 1.94
USP20-205ENST00000474895 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.11■■□□□ 1.93
USP20-205ENST00000474895 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.1■■□□□ 1.93
USP20-205ENST00000474895 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.02■■□□□ 1.92
USP20-205ENST00000474895 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.9■■□□□ 1.9
USP20-205ENST00000474895 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
USP20-205ENST00000474895 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.84■■□□□ 1.89
USP20-205ENST00000474895 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.8■■□□□ 1.88
USP20-205ENST00000474895 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.55■■□□□ 1.84
USP20-205ENST00000474895 SCRIBQ14160 1630 aa26.43■■□□□ 1.82
USP20-205ENST00000474895 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.2■■□□□ 1.78
USP20-205ENST00000474895 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
USP20-205ENST00000474895 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.11■■□□□ 1.77
USP20-205ENST00000474895 NCAPD3P42695 1498 aa25.34■■□□□ 1.65
USP20-205ENST00000474895 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.26■■□□□ 1.63
USP20-205ENST00000474895 SMARCA4P51532 1647 aa25.26■■□□□ 1.63
USP20-205ENST00000474895 SMARCA2P51531 1590 aa25.21■■□□□ 1.63
USP20-205ENST00000474895 HMGXB3Q12766 1538 aa25.19■■□□□ 1.62
USP20-205ENST00000474895 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.61
USP20-205ENST00000474895 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.05■■□□□ 1.6
USP20-205ENST00000474895 CUX2O14529 1486 aa25.01■■□□□ 1.59
USP20-205ENST00000474895 ERCC6Q03468 1493 aa25■■□□□ 1.59
USP20-205ENST00000474895 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
USP20-205ENST00000474895 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.92■■□□□ 1.58
USP20-205ENST00000474895 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.89■■□□□ 1.58
USP20-205ENST00000474895 NESP48681 1621 aa24.88■■□□□ 1.57
USP20-205ENST00000474895 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.78■■□□□ 1.56
USP20-205ENST00000474895 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
USP20-205ENST00000474895 WIZO95785 1651 aa24.62■■□□□ 1.53
USP20-205ENST00000474895 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.6■■□□□ 1.53
USP20-205ENST00000474895 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.6■■□□□ 1.53
USP20-205ENST00000474895 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.54■■□□□ 1.52
USP20-205ENST00000474895 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
USP20-205ENST00000474895 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.4■■□□□ 1.5
USP20-205ENST00000474895 WDR62O43379 1518 aa24.37■■□□□ 1.49
USP20-205ENST00000474895 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
USP20-205ENST00000474895 CFTRP13569 1480 aa24.3■■□□□ 1.48
USP20-205ENST00000474895 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.3■■□□□ 1.48
USP20-205ENST00000474895 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.26■■□□□ 1.47
USP20-205ENST00000474895 PRDM2Q13029 1718 aa24.1■■□□□ 1.45
USP20-205ENST00000474895 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
USP20-205ENST00000474895 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.02■■□□□ 1.44
USP20-205ENST00000474895 IFT140Q96RY7 1462 aa23.82■■□□□ 1.4
USP20-205ENST00000474895 TOPBP1Q92547 1522 aa23.82■■□□□ 1.4
USP20-205ENST00000474895 ABCC8Q09428 1581 aa23.79■■□□□ 1.4
USP20-205ENST00000474895 OSCARQ8IYS5 282 aa23.78■■□□□ 1.4
USP20-205ENST00000474895 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.76■■□□□ 1.39
USP20-205ENST00000474895 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
USP20-205ENST00000474895 TRIM41Q8WV44 630 aa23.73■■□□□ 1.39
USP20-205ENST00000474895 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
USP20-205ENST00000474895 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
USP20-205ENST00000474895 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
USP20-205ENST00000474895 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.53■■□□□ 1.36
USP20-205ENST00000474895 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.53■■□□□ 1.36
USP20-205ENST00000474895 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.53■■□□□ 1.36
USP20-205ENST00000474895 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.51■■□□□ 1.351e-8■■■■■ 34.2
USP20-205ENST00000474895 ARHGEF11O15085 1522 aa23.47■■□□□ 1.35
USP20-205ENST00000474895 CHD1O14646 1710 aa23.47■■□□□ 1.35
USP20-205ENST00000474895 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.45■■□□□ 1.34
USP20-205ENST00000474895 WDR97A6NE52 1622 aa23.44■■□□□ 1.34
USP20-205ENST00000474895 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.43■■□□□ 1.34
USP20-205ENST00000474895 SOGA1O94964 1423 aa23.43■■□□□ 1.34
USP20-205ENST00000474895 CUX1P39880 1505 aa23.42■■□□□ 1.34
USP20-205ENST00000474895 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
USP20-205ENST00000474895 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.31■■□□□ 1.32
USP20-205ENST00000474895 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
USP20-205ENST00000474895 FBLN2P98095 1184 aa23.27■■□□□ 1.32
USP20-205ENST00000474895 GRIN2BQ13224 1484 aa23.26■■□□□ 1.31
USP20-205ENST00000474895 ARAP1Q96P48 1450 aa23.24■■□□□ 1.31
USP20-205ENST00000474895 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.23■■□□□ 1.31
USP20-205ENST00000474895 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
USP20-205ENST00000474895 SYNJ1O43426 1573 aa23.2■■□□□ 1.3
USP20-205ENST00000474895 PBRM1Q86U86 1689 aa23.19■■□□□ 1.3
USP20-205ENST00000474895 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.19■■□□□ 1.3
USP20-205ENST00000474895 SYNJ2O15056 1496 aa23.19■■□□□ 1.3
USP20-205ENST00000474895 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.19■■□□□ 1.3
USP20-205ENST00000474895 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.18■■□□□ 1.3
USP20-205ENST00000474895 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.17■■□□□ 1.3
USP20-205ENST00000474895 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
USP20-205ENST00000474895 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.09■■□□□ 1.29
USP20-205ENST00000474895 TOP2BQ02880 1626 aa23.08■■□□□ 1.28
USP20-205ENST00000474895 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.06■■□□□ 1.28
USP20-205ENST00000474895 ADAMTS12P58397 1594 aa22.99■■□□□ 1.27
USP20-205ENST00000474895 GRIN2AQ12879 1464 aa22.98■■□□□ 1.27
USP20-205ENST00000474895 NUP160Q12769 1436 aa22.91■■□□□ 1.26
USP20-205ENST00000474895 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.91■■□□□ 1.26
USP20-205ENST00000474895 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.9■■□□□ 1.26
USP20-205ENST00000474895 CEP170Q5SW79 1584 aa22.89■■□□□ 1.26
USP20-205ENST00000474895 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
USP20-205ENST00000474895 SHROOM2Q13796 1616 aa22.83■■□□□ 1.25
USP20-205ENST00000474895 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.83■■□□□ 1.25
USP20-205ENST00000474895 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.67■■□□□ 1.22
USP20-205ENST00000474895 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
USP20-205ENST00000474895 JPH4Q96JJ6 628 aa22.59■■□□□ 1.21
USP20-205ENST00000474895 CUL7Q14999 1698 aa22.58■■□□□ 1.21
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