RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474763.5

TBXAS1-215, Transcript of thromboxane A synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene TBXAS1, Length 582 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBXAS1-215ENST00000474763 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.56■■■■■ 5.84
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TBXAS1-215ENST00000474763 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.5■■■■■ 4.55
TBXAS1-215ENST00000474763 NACADO15069 1562 aa43.38■■■■■ 4.54
TBXAS1-215ENST00000474763 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.04■■■■■ 4.48
TBXAS1-215ENST00000474763 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.96■■■■■ 4.47
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TBXAS1-215ENST00000474763 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.73■■■■■ 4.43
TBXAS1-215ENST00000474763 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.71■■■■■ 4.43
TBXAS1-215ENST00000474763 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.28■■■■■ 4.36
TBXAS1-215ENST00000474763 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.2■■■■■ 4.35
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TBXAS1-215ENST00000474763 SCRIBQ14160 1630 aa41.92■■■■■ 4.3
TBXAS1-215ENST00000474763 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.77■■■■■ 4.28
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TBXAS1-215ENST00000474763 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.07■■■■■ 4.17
TBXAS1-215ENST00000474763 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.77■■■■■ 4.12
TBXAS1-215ENST00000474763 SMARCA4P51532 1647 aa40.13■■■■■ 4.02
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TBXAS1-215ENST00000474763 SMARCA2P51531 1590 aa39.9■■■■□ 3.98
TBXAS1-215ENST00000474763 HMGXB3Q12766 1538 aa39.81■■■■□ 3.96
TBXAS1-215ENST00000474763 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.8■■■■□ 3.96
TBXAS1-215ENST00000474763 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.72■■■■□ 3.95
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TBXAS1-215ENST00000474763 NESP48681 1621 aa39.14■■■■□ 3.86
TBXAS1-215ENST00000474763 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.09■■■■□ 3.85
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TBXAS1-215ENST00000474763 CUX2O14529 1486 aa38.87■■■■□ 3.81
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TBXAS1-215ENST00000474763 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.76■■■■□ 3.8
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TBXAS1-215ENST00000474763 PRDM2Q13029 1718 aa38.38■■■■□ 3.74
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TBXAS1-215ENST00000474763 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.35■■■■□ 3.73
TBXAS1-215ENST00000474763 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.33■■■■□ 3.73
TBXAS1-215ENST00000474763 WDR62O43379 1518 aa38.32■■■■□ 3.72
TBXAS1-215ENST00000474763 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.31■■■■□ 3.72
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TBXAS1-215ENST00000474763 ABCC8Q09428 1581 aa37.67■■■■□ 3.62
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TBXAS1-215ENST00000474763 WDR97A6NE52 1622 aa37.09■■■■□ 3.53
TBXAS1-215ENST00000474763 CHD1O14646 1710 aa36.98■■■■□ 3.51
TBXAS1-215ENST00000474763 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.95■■■■□ 3.51
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TBXAS1-215ENST00000474763 GRIN2BQ13224 1484 aa36.77■■■■□ 3.48
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TBXAS1-215ENST00000474763 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.69■■■■□ 3.46
TBXAS1-215ENST00000474763 FBLN2P98095 1184 aa36.6■■■■□ 3.45
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TBXAS1-215ENST00000474763 ARHGEF11O15085 1522 aa36.59■■■■□ 3.45
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TBXAS1-215ENST00000474763 ARAP1Q96P48 1450 aa36.26■■■■□ 3.4
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TBXAS1-215ENST00000474763 NUP160Q12769 1436 aa36.2■■■■□ 3.39
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TBXAS1-215ENST00000474763 KIF27Q86VH2 1401 aa36.08■■■■□ 3.37
TBXAS1-215ENST00000474763 SHROOM2Q13796 1616 aa36.07■■■■□ 3.36
TBXAS1-215ENST00000474763 CUL7Q14999 1698 aa36.03■■■■□ 3.36
TBXAS1-215ENST00000474763 IGF1RP08069 1367 aa36■■■■□ 3.35
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TBXAS1-215ENST00000474763 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.75■■■■□ 3.31
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